[发明专利]一种电泳后脂蛋白胆固醇试剂扫描图的预处理方法在审
申请号: | 202110960145.6 | 申请日: | 2021-08-20 |
公开(公告)号: | CN113674367A | 公开(公告)日: | 2021-11-19 |
发明(设计)人: | 张心觉;楼敬伟;王政;高军晖 | 申请(专利权)人: | 上海宝藤生物医药科技股份有限公司;上海宝藤医学检验所有限公司;上海张江医学创新研究院 |
主分类号: | G06T7/90 | 分类号: | G06T7/90;G06T7/136;G06T7/11 |
代理公司: | 北京品源专利代理有限公司 11332 | 代理人: | 刘二艳 |
地址: | 201203 上海市浦东新区中国*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 电泳 脂蛋白 胆固醇 试剂 描图 预处理 方法 | ||
1.一种电泳后脂蛋白胆固醇试剂扫描图的预处理方法,其特征在于,所述预处理办法包括如下步骤:
S1、获取电泳后脂蛋白胆固醇试剂的扫描图,统计灰度值得到灰度值统计图,并根据所述灰度值统计图进行裁剪,得到单一凝胶柱的扫描图;
S2、设置凝胶柱扫描图的最小极大值、间隔阈值、落差阈值和动量阈值,获取所述单一凝胶柱的扫描图中的极大值及其对应的坐标,得到极低密度脂蛋白、高密度脂蛋白和低密度脂蛋白的波峰及拐点;
S3、根据步骤S2所得左右两侧的波峰的拐点对凝胶柱的电泳图进行裁剪,并进行空白填充,得到极低密度脂蛋白、高密度脂蛋白和低密度脂蛋白的图像数据,所得图像数据进入后续分析工作流程。
2.根据权利要求1所述的预处理方法,其特征在于,步骤S1中所述灰度值统计图包括灰度值水平统计图和灰度值纵向统计图,所述裁剪的方法包括:
遍历所述灰度值水平统计图,得到落差位点,根据所述落差位点获取起始线;
确定所述起始线后,再查找所述起始线后的最小值和极大值,确定切割线,以所述落差位点与起始线之间的尺寸为固定尺寸,根据切割线完成水平裁剪;
遍历所述灰度值纵向统计图根据阈值大小,得到凝胶柱的竖直切割线,完成竖直裁剪。
3.根据权利要求2所述的预处理方法,其特征在于,所述极大值的确定方法包括:
S11、设定超参数、段落点数和三个阈值,所述三个阈值包括:极值最小坐标间隔、落差阈值和最小极大值;
其中,极大值小于最小极大值,则不予存储;
S12、通过遍历范围中每个点的值,从中依次读取两段,其最大值分别为M1和M2,并存储该阶段内的极大值,记为M0,同时赋予初始单调性d=1;
其中,单调性d=1表示单调递增,单调性d=0表示单调递减;
S13、将M0、M1和M2作比较,获取极大值。
4.根据权利要求3所述的预处理方法,其特征在于,步骤S13所述获取极大值的方法具体包括如下步骤:
S131、所述M0、M1和M2依次递减,则将M0更新为M1;
d=0,则进入下一区域;d=1,则说明存在极大值,并将d更新为0;
再将极大值和上一个极大值作比较,若所述极大值大于上一个极大值,则将其存储;
S132、所述M0、M1和M2依次递增,则将M0更新为M2;
d=0,则进入下一区域;d=1,则说明存在极大值,并将d更新为0;
再将极大值和上一个极大值作比较,若所述极大值大于上一个极大值,则将其存储;
S133、所述M1最大,则将M0更新为M1,d赋值0;
并将M1和最小极大值作比较,M1大于最小极大值,则将其存储;
S134、所述M1最小且d=1,则将M0和最小极大值作比较,M0大于最小极大值,则将其存储;
所述M1最小且d=0,则将M0更新为M2,d更新为1,进入下一段。
5.根据权利要求1所述的预处理方法,其特征在于,步骤S2中所述极低密度脂蛋白、高密度脂蛋白和低密度脂蛋白的波峰及拐点的获取方法包括:
根据所述单一凝胶柱的扫描图的位置信息得到极低密度脂蛋白和高密度脂蛋白波峰的坐标,根据波峰确定所述波峰两侧的拐点;
在极低密度脂蛋白波峰的右拐点和高密度脂蛋白波峰的左拐点之间,选取最大值确定为低密度脂蛋白的波峰,再通过动量阈值确定所述低密度脂蛋白波峰的右拐点。
6.根据权利要求1所述的预处理方法,其特征在于,步骤S2中所述最小极大值为所述方法中设定的极大值,低于所述最小极大值的极大值不予存储;
所述间隔阈值为两个极大值之间的最小间距;
所述落差阈值为两段最大值之间的最小差值;
所述动量阈值为特定位置下的极大值的下一个极大值至少前移的数值。
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