[发明专利]一种与猪剩余采食量相关的SNP分子标记及其用途

说明书

本发明提供了一种与猪剩余采食量相关的SNP分子标记，所述SNP分子标记的位点为国际猪参考基因组11.1版本14号染色体上第51519932个核苷酸位点，该位点为基因CCDC188上一个错义突变位点，该位点的碱基是T或C。本发明通过优选该SNP的优势等位基因，能够逐代增加优势等位基因频率，降低种猪剩余采食量，选育上述性状的优良种猪，加快猪遗传改良进展从而有效提高种猪育种的经济效益。

技术领域

本发明涉及一种与猪剩余采食量相关的SNP分子标记及其用途。

背景技术

猪肉是人类重要的肉类来源，大约占世界人口消费肉类的40％。受中国人肉食消费习惯影响，我国对猪肉的需求更甚。自八十年代以来，猪肉一直是城乡居民餐桌上的主打肉类，城乡居民猪肉消费始终占到肉类消费的60％以上，占据主导地位。2020年，我国生猪年出栏总数为5.27亿头，占世界生猪出栏数的一半；猪肉产量为4113万吨，占全球猪肉产量的42.02％，同样稳居头号交椅。猪肉消费具有不可替代性，其安全性和有效供给既是关系到老百姓切身利益的大事，也是影响社会发展和稳定的大事。然而，全球最大的猪肉消费需求则伴随着巨大的饲料用粮消耗。2015年以来，我国粮食年产量并无明显的增长，一直维持在6.6亿吨左右。另一方面，随着生猪养殖朝着规模化方向发展，2010年至2017年猪饲料用粮整体呈逐年升高趋势，猪饲料产量从5947万吨增长至9808万吨，并达到历史最高点，占商品饲料总产量的44.27％。显然，粮食作物的紧缺状况以及“人畜争粮”矛盾日益凸显，扭转“人畜争粮”尴尬局面刻不容缓。

此外，在现代生猪养殖中，60-80％的生产成本为饲料成本，已经成为限制生猪养殖企业快速发展的重要影响因素。将优质的饲料高效的转化为猪的增重则显得极为重要，尤其是在饲料成本居高不下的现状下。统计分析表明，如果商品猪的料肉比每降低0.1，每头商品猪可节省15kg饲料，按照我国年产5.4亿头商品猪计算，年节省饲料810万吨，可使中国年节省养猪成本284亿元(每公斤饲料成本以3.5元计算)。针对商品猪的料肉比而言，我国与欧美等养猪大国还存在差距(3.2vs.2.6)，具备较大的改良空间。因此，提高猪的饲料利用效率，特别是瘦肉型猪种(我国半数以上的商品猪(70％)均源西方瘦肉型猪种)，对保障猪肉供应、缓解“人畜争粮”矛盾、降低猪肉生产成本和提升养猪企业核心竞争力意义重大。

回顾近现代全世界的种猪遗传改良历史，猪的育种目标也随着经济的快速发展和消费者市场的需求而变化，当前已由重点提高生长速度、瘦肉率转向为更加平衡的选择，逐渐强调生产效率和肉质的提高，饲料利用效率等相关性状已经成为重点关注的选育性状。猪饲料利用效率性状受遗传、消化吸收代谢能力、日粮组成、饲喂方式、环境温度、活动空间、生长测定阶段和猪只健康状况等很多因素影响，但遗传因素为最主要原因。常见的衡量饲料利用效率的指标有饲料转化效率和剩余采食量两种。饲料转化效率为采食量和增重两个性状的比值，是一个典型的比值性状。从现场育种的角度来说，具有低饲料摄入量和低日增重的猪也同样可能具有低的饲料转化效率，这显然不符合育种选择目标。剩余采食量表示实际采食量与预测的用于维持生命和生长所需要的采食量之差，反映的是个体本身由遗传背景决定的代谢差异。研究表明，剩余采食量与体重等生长性状的遗传相关性较低，相互独立。因此，在针对剩余采食量性状进行选择时对生长性状几乎没有影响，剩余采食量被认为是改良饲料利用效率性状更准确更有效的方法和指标。

过去，人们通过候选基因法和QTL定位进行QTL检测，并且已鉴别到部分影响重要经济性状的候选基因，如IGF2和MC4R基因等。候选基因法虽然具有方法简单、操作方便等优点，但只能针对生物学功能已知的基因；而QTL定位方法所鉴定的候选位置基因的置信区域同样较大，这极大地限制了复杂性状分子标记在家畜遗传育种中的应用。随着高通量测序技术的发展及全基因组芯片的出现，使得全基因组关联分析(Genome-wide AssociationStudy，GWAS)在复杂性状遗传解析中效果显著，也打破了猪重要经济性状分子标记鉴别的瓶颈。

然而，剩余采食量作为种猪遗传改良工作中的重要性状，却少有在猪中鉴定与剩余采食量相关的分子标记。

发明内容