[发明专利]从多个引物测序以增加数据速率和密度

权利要求书

1.一种用于测定包含至少两个结合引物的核酸序列的电子系统，其中所述结合引物的每个包含标记的核苷酸碱基，并且其中所述系统包含处理器，所述处理器配置为进行包括以下项的方法：

获得对应于所述至少两个结合引物的每个处掺入的至少一个标记的核苷酸碱基的信号数据；

从所述信号数据测定所述核苷酸碱基的身份；和

将所述核苷酸碱基的身份分配至延伸读段。

2.权利要求1的系统，其还包含配置为处理所述信号数据的信号处理器。

3.权利要求1的系统，其中所述处理器配置为进行通过信号去卷积、信号改良和信号选择的一个或多个来测定所述核苷酸碱基的身份的方法。

4.权利要求1的系统，其中所述处理器配置为进行通过获得一个或多个图像来获得信号数据的方法。

5.权利要求4的系统，其中所述处理器配置为进行通过获得对应于所述引物处掺入的多个核苷酸类似物的颜色信号数据来获得信号数据的方法。

6.权利要求5的系统，其中每个颜色信号对应于不同的核苷酸类似物或核苷酸类似物的组合。

7.权利要求1的系统，其中所述处理器配置为进行通过分析对应于每个引物处检测的独特标记物的信号强度概况来测定所述核苷酸碱基的身份的方法。

8.权利要求1的系统，其中所述处理器配置为进行通过为每个标记的核苷酸碱基进行初步碱基调用，然后进行最终碱基调用来分配所述核苷酸碱基的身份的方法。

9.权利要求8的系统，其中所述处理器配置为通过将所述初步碱基调用与参考基因组进行比较来进行所述最终碱基调用。

10.一种配置为保持流动池的电子系统，所述流动池包含具有多个结合的多核苷酸的支持物，其中所述电子系统包括配置为进行包括以下项的方法的处理器：

激活第一流体组分以将多个第一和第二引物与所述多个结合的多核苷酸杂交，其中至少第一和第二引物与每个多核苷酸的相同链杂交；

激活第二流体组分以用产生信号的标记的核苷酸碱基延伸与每个多核苷酸的相同链杂交的所述第一和第二引物；

获得对应于在延伸的第一和第二引物的每个处掺入的至少一个核苷酸碱基的信号数据；

从所述信号数据测定所述核苷酸碱基的身份；和

将所述核苷酸碱基的身份分配至所述第一和第二引物的延伸读段。

11.权利要求10的系统，其中所述处理器配置为进行通过获得一个或多个图像来获得信号数据的方法。

12.权利要求10的系统，其中所述处理器配置为进行通过获得对应于所述引物处掺入的多个核苷酸类似物的颜色信号数据来获得信号数据的方法。

13.权利要求12的系统，其中每个颜色信号对应于不同的核苷酸类似物或核苷酸类似物的组合。

14.权利要求10的系统，其中所述处理器配置为进行通过信号去卷积、信号改良和信号选择的一个或多个来测定所述核苷酸碱基的身份的方法。

15.权利要求10的系统，其中所述处理器配置为进行通过分析对应于每个引物处检测的独特标记物的信号强度概况来测定所述核苷酸碱基的身份的方法。

16.权利要求10的系统，其中所述多个第一和第二引物包括封闭的和未封闭的引物以化学区分所述第一和第二引物的每个延伸读段。

17.权利要求10的系统，其进一步包括使用生物信息学信息将所述核苷酸碱基分配至每个延伸读段。