[发明专利]一种用于移植患者感染的病原体检测引物和探针组、试剂盒及应用在审
申请号: | 202110794646.1 | 申请日: | 2021-07-14 |
公开(公告)号: | CN113502354A | 公开(公告)日: | 2021-10-15 |
发明(设计)人: | 何苗;梁珊 | 申请(专利权)人: | 中国医学科学院输血研究所 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/6895;C12Q1/689;C12Q1/686;C12N15/11 |
代理公司: | 成都天嘉专利事务所(普通合伙) 51211 | 代理人: | 赵玉玲 |
地址: | 610052 四*** | 国省代码: | 四川;51 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 用于 移植 患者 感染 病原体 检测 引物 探针 试剂盒 应用 | ||
1.一种用于移植患者感染的病原体检测引物和探针组,其特征在于,包括如下23组引物探针组合:
所述第一组引物探针组合用于检测腺病毒B型,上下游引物和探针序列分别为:
上游引物:5’- TCAGGGATAACTTTGTAGG-3’,
下游引物:5’- GACAGTTCAGTATTTCTGTC-3’,
探针:5’- TCAACCACTGCATTCAGTTGTGATG-3’,其5’端的报告基团为FAM,3’端的淬灭基团为BHQ-1;
所述第二组引物探针组合用于检测腺病毒C型,上下游引物和探针序列分别为:
上游引物:5’- CAGTGGTCTTACATGCAC-3’,
下游引物:5’- TGGGGTTTCTAAACTTGTTA-3’,
探针:5’- ACGCCTCGGAGTACCTGAGC-3’,其5’端的报告基团为FAM,3’端的淬灭基团为BHQ-1;
所述第三组引物探针组合用于检测水痘-带状疱疹病毒,上下游引物和探针序列分别为:
上游引物:5’- GGTGTCTCCCTAATCTTG-3’,
下游引物:5’- CTCTCTTTCTGTGTGTCC-3’,
探针:5’- AGGCTTCTGCTCTCGACTGG-3’,其5’端的报告基团为FAM,3’端的淬灭基团为BHQ-1;
所述第四组引物探针组合用于检测EB病毒,上下游引物和探针序列分别为:
上游引物:5’- CTCCCTTTACAACCTCAG-3’,
下游引物:5’- GACGACTCAATGGTGTAA-3’,
探针:5’- CCTTGCTGTTCCACAATGTCGT-3’,其5’端的报告基团为FAM,3’端的淬灭基团为BHQ-1;
所述第五组引物探针组合用于检测人单纯疱疹病毒1型,上下游引物和探针序列分别为:
上游引物:5’- GGATGGCGAACATCTTAA-3’,
下游引物:5’- GTTGGGTTTGTCCTTCTC-3’,
探针:5’- ATGGGACCCGTGACACCCTA -3’,其5’端的报告基团为FAM,3’端的淬灭基团为BHQ-1;
所述第六组引物探针组合用于检测巨细胞病毒,上下游引物和探针序列分别为:
上游引物:5’- CGTGACGTGCATAAAGAG -3’,
下游引物:5’- GGTGATAGGTGACCAGTA -3’,
探针:5’- CTCGCAGAAGGACTCCAGGT -3’,其5’端的报告基团为FAM,3’端的淬灭基团为BHQ-1;
所述第七组引物探针组合用于检测人类疱疹病毒6型,上下游引物和探针序列分别为:
上游引物:5’- GTGTGGTAATGGACTAAG -3’,
下游引物:5’- CGACCATCAAAATATAAAGAG-3’,
探针:5’- AGCTGCTACAATACACACGTAAGTAC -3’,其5’端的报告基团为FAM,3’端的淬灭基团为BHQ-1;
所述第八组引物探针组合用于检测金黄色葡萄球菌,上下游引物和探针序列分别为:
上游引物:5’- GCGAATGAGCGTTTATTTAG -3’,
下游引物:5’- GACCTTTAGATAAAGCTGTAATG-3’,
探针:5’- CGCCATAACTCATACCAGATTGTCCTA -3’,其5’端的报告基团为FAM,3’端的淬灭基团为BHQ-1;
所述第九组引物探针组合用于检测肺炎链球菌,上下游引物和探针序列分别为:
上游引物:5’- CAGCTACCAACGACAGTC -3’,
下游引物:5’- CGCAAGAAGAGTGGGATTA-3’,
探针:5’- TCTCTAACAAGGTCTCATCCACTACGA -3’,其5’端的报告基团为FAM,3’端的淬灭基团为BHQ-1;
所述第十组引物探针组合用于检测表皮葡萄球菌,上下游引物和探针序列分别为:
上游引物:5’- CGGTGCTTATACTGGAGA -3’,
下游引物:5’- TCGTCAGTTTCGTGGAAA -3’,
探针:5’- ACGACGCTCTGAGTGACCAAT -3’,其5’端的报告基团为FAM,3’端的淬灭基团为BHQ-1;
所述第十一组引物探针组合用于检测铜绿假单胞菌,上下游引物和探针序列分别为:
上游引物:5’- TCACCACCTTCTACTTCG -3’,
下游引物:5’- CAGAGCCATGTTGTACTC -3’,
探针:5’- ACGACAGCTCCGACCTGAAG -3’,其5’端的报告基团为FAM,3’端的淬灭基团为BHQ-1;
所述第十二组引物探针组合用于检测鲍曼不动杆菌,上下游引物和探针序列分别为:
上游引物:5’- TCCAGTTTATCAAGATTTAGC -3’,
下游引物:5’- CTTGGGTACCGATATCTG -3’,
探针:5’- CATAACCAACACGCTTCACTTCCTTAG -3’,其5’端的报告基团为FAM,3’端的淬灭基团为BHQ-1;
所述第十三组引物探针组合用于检测大肠杆菌,上下游引物和探针序列分别为:
上游引物:5’- CCGCAAGAAAACTATCCC -3’,
下游引物:5’- TAGCGACTGATATTGAACTG -3’,
探针:5’- CCGCCTTACTGCCGCCTGTT -3’,其5’端的报告基团为FAM,3’端的淬灭基团为BHQ-1;
所述第十四组引物探针组合用于检测粪肠球菌,上下游引物和探针序列分别为:
上游引物:5’- TGCCATCATTTAGTTGGG -3’,
下游引物:5’- GAAGCTTTAAGAGATTTGCATG -3’,
探针:5’- CGGTCTAGCGACTCGTTGTACTTC-3’,其5’端的报告基团为FAM,3’端的淬灭基团为BHQ-1;
所述第十五组引物探针组合用于检测结核分枝杆菌复合菌群,上下游引物和探针序列分别为:
上游引物:5’- GTCGAGTACGCCTTCTTG -3’,
下游引物:5’- CACCTATGTGTCGACCTG -3’,
探针:5’- CCTTTGTCACCGACGCCTACG -3’,其5’端的报告基团为FAM,3’端的淬灭基团为BHQ-1;
所述第十六组引物探针组合用于检测屎肠球菌,上下游引物和探针序列分别为:
上游引物:5’- CATCCAAGATATTCTGCC -3’,
下游引物:5’- CGGATTTTGTTCAATACAAG -3’,
探针:5’- CACCATCTACATCGTCAGCAATAATCA -3’,其5’端的报告基团为FAM,3’端的淬灭基团为BHQ-1;
所述第十七组引物探针组合用于检测艰难梭状芽胞杆菌,上下游引物和探针序列分别为:
上游引物:5’- GCGTAGATATTAGGAGGAA -3’,
下游引物:5’- GGAGTACTTAATGCGTTAG -3’,
探针:5’- TCTCTGGACTGTAACTGACGCTG -3’,其5’端的报告基团为FAM,3’端的淬灭基团为BHQ-1;
所述第十八组引物探针组合用于检测嗜麦芽窄食单胞菌,上下游引物和探针序列分别为:
上游引物:5’- TCCTCCAAGGCTAAATAC -3’,
下游引物:5’- CGGTTTCAGGTTCTATTTC -3’,
探针:5’- TGACCGACCGATAGTGAACCAG-3’,其5’端的报告基团为FAM,3’端的淬灭基团为BHQ-1;
所述第十九组引物探针组合用于检测流感嗜血杆菌,上下游引物和探针序列分别为:
上游引物:5’- CGTTCAAATCTTAGACGC -3’,
下游引物:5’- CGATGTTGTATTCTGGTG -3’,
探针:5’- CGTTCATCAGTGTTACCTTCTACTAAT-3’,其5’端的报告基团为FAM,3’端的淬灭基团为BHQ-1;
所述第二十组引物探针组合用于检测肺炎克雷伯菌,上下游引物和探针序列分别为:
上游引物:5’- CCCGTGAACCTTTACTATA -3’,
下游引物:5’- AAGGGTGGTATTTCAAGG -3’,
探针:5’- TGACACTGAACATTGAGCCTTGAT-3’,其5’端的报告基团为FAM,3’端的淬灭基团为BHQ-1;
所述第二十一组引物探针组合用于检测新型隐球菌,上下游引物和探针序列分别为:
上游引物:5’- CTGGAAGCTCATTTACCTA -3’,
下游引物:5’- GGCCATGGAATTGGAATA -3’,
探针:5’- ATTCACCGTAAGCCATCAATCAGG-3’,其5’端的报告基团为FAM,3’端的淬灭基团为BHQ-1;
所述第二十二组引物探针组合用于检测白色念珠菌,上下游引物和探针序列分别为:
上游引物:5’- GAGGTCTAAACTTACAACC -3’,
下游引物:5’- CGTTGTTGAAAGTTTTGAC -3’,
探针:5’- TCAACTTGTCACACCAGATTATTACTT-3’,其5’端的报告基团为FAM,3’端的淬灭基团为BHQ-1;
所述第二十三组引物探针组合用于检测烟曲霉,上下游引物和探针序列分别为:
上游引物:5’- TCCCTCTTATCCATTTTCC -3’,
下游引物:5’- GTTCCAAAGCCGAAAGAATA -3’,
探针:5’- CCTCATCACTGCAACTCTAATCCTCG-3’,其5’端的报告基团为FAM,3’端的淬灭基团为BHQ-1。
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