[发明专利]甲状腺结节良恶性相关标志物及其应用

说明书

本发明涉及甲状腺结节良恶性相关标志物及其应用，所述标志物为以下目标标志物：TTC34基因或基因组的TTC34序列，SLC16A3基因或基因组的SLC16A3序列，RARG基因或基因组的RARG序列，以及选自RCOR2基因或基因组的RCOR2序列和ITPKA基因或基因组的ITPKA序列中的任意一种或全部两种。本发明涉及与所述目标标志物杂交的引物分子和/或探针分子在制备诊断甲状腺结节良恶性的检测试剂或诊断试剂盒中的应用，以及用于确定目标标志物的甲基化水平的装置在制备诊断甲状腺结节良恶性的诊断试剂盒中的应用。

技术领域

本发明属于分子辅助诊断领域，涉及甲状腺结节良恶性相关标志物及其应用。

背景技术

DNA甲基化是表观遗传的一种机制，是真核细胞基因组常见的表观遗传学修饰，能够在不改变DNA序列的情况下改变遗传表现。所谓DNA甲基化是指在DNA甲基化转移酶（methyltransferase）的作用下，在基因组CpG二核苷酸的胞嘧啶5号碳位共价结合一个甲基基团。DNA甲基化在细胞增殖、分化、发育等方面起重要作用，与肿瘤的发生、发展关系密切，其效应有转录抑制、染色质结构调节、X染色体失活、基因组印记等。DNA甲基化异常可以通过影响染色质结构以及癌基因和抑癌基因的表达而参与肿瘤的发生和进展。

CpG二核苷酸是哺乳动物发生DNA甲基化的最主要靶点，分布于整个染色体组。健康人基因组中，CpG岛中的CpG位点通常处于非甲基化状态，而在CpG岛外的CpG位点则通常高甲基化，这种甲基化的形式在细胞分裂的过程中能够稳定保留。当肿瘤发生时，通常抑癌基因非CpG岛区的CpG位点甲基化程度降低，而CpG岛中的CpG则呈高度甲基化状态，DNA甲基化后核苷酸顺序及其组成虽未发生改变，但会导致染色质结构改变及抑癌基因表达的降低。

随着过去十几年来遗传学和表观遗传学的不断发展，越来越多的研究者认识到肿瘤的发生并不完全由遗传基因决定，表观遗传学的后天影响同样发挥重要作用。甲状腺癌中的表观遗传学改变主要体现为抑癌基因和甲状腺相关基因的异常甲基化。研究甲状腺癌的DNA甲基化可以为我们提供新的分子标志物，为早期诊断、治疗方案选择和预后评估提供可靠依据。

甲状腺结节（Thyroid nodule）是甲状腺细胞异常增生后在甲状腺内形成的固体或者液体填充的肿块，可随着吞咽动作随甲状腺而上下移动，甲状腺是位于颈部底部、胸骨上方的一个小腺体。甲状腺结节非常常见，尽管大多数甲状腺结节并不严重，不会引起症状，但还是有一部分甲状腺结节进展为甲状腺癌。为了更早的诊断和治疗甲状腺癌，同时降低非必要的手术治疗，亟需一种高灵敏度和特异性的体外诊断方法（In-VitroDiagnostics, IVD）对甲状腺结节的良恶性进行鉴别。