[发明专利]一种基于等温扩增-CRISPR/Cas12a技术检测弓形虫的试剂盒及其应用在审
申请号: | 202110703245.0 | 申请日: | 2021-06-24 |
公开(公告)号: | CN113403412A | 公开(公告)日: | 2021-09-17 |
发明(设计)人: | 王萌;马巧妮;朱兴全 | 申请(专利权)人: | 中国农业科学院兰州兽医研究所 |
主分类号: | C12Q1/6893 | 分类号: | C12Q1/6893;C12Q1/6844;C12N15/113 |
代理公司: | 北京高沃律师事务所 11569 | 代理人: | 薛红凡 |
地址: | 730070 *** | 国省代码: | 甘肃;62 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 等温 扩增 crispr cas12a 技术 检测 弓形虫 试剂盒 及其 应用 | ||
1.一种用于特异性检测弓形虫DNA的crRNA,其特征在于,所述crRNA的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示。
2.一种基于等温扩增-CRISPR/Cas12a技术检测弓形虫DNA的试剂盒,其特征在于,包括以下组分:
权利要求1所述crRNA、Cas12a蛋白和荧光报告基团标记的ssDNA。
3.权利要求1所述crRNA或权利要求2所述试剂盒在检测环境中弓形虫DNA中的应用。
4.根据权利要求3所述应用,其特征在于,所述环境包括环境土壤、水源。
5.根据权利要求3所述应用,其特征在于,所述弓形虫DNA包括弓形虫卵囊DNA。
6.一种基于权利要求2所述试剂盒检测环境中弓形虫DNA的方法,其特征在于,包括以下步骤:
1)提取环境样品中总DNA;
2)以步骤1)提取的总DNA为模板进行等温扩增,得到扩增产物;
3)将crRNA和Cas12a蛋白混合,孵育,得到核酸蛋白复合物;
4)将所述核酸蛋白复合物与所述扩增产物和荧光报告基团标记的ssDNA溶液混合,孵育,得到反应产物;
5)将所述反应产物测定荧光强度,根据荧光强度的有无判断环境样本中是否含有弓形虫:当检测到荧光强度信号时,表明环境样本中含有弓形虫,反之则不含。
7.根据权利要求6所述方法,其特征在于,步骤3)中crRNA和Cas12a蛋白的摩尔比为1:0.8。
8.根据权利要求6所述方法,其特征在于,步骤4)中所述核酸蛋白复合物、所述扩增产物和荧光报告基团标记的ssDNA溶液的体积比为1:1:1;
所述荧光报告基团标记的ssDNA溶液的浓度为1μM。
9.根据权利要求6所述方法,其特征在于,步骤2)中所述等温扩增包括重组酶介导扩增、环介导等温扩增、依赖核酸序列扩增或重组酶聚合酶扩增。
10.根据权利要求6~9任意一项所述方法,其特征在于,所述环境样本中弓形虫的浓度不低于100copies/μL。
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