[发明专利]一种基于等温扩增-CRISPR/Cas12a技术检测弓形虫的试剂盒及其应用在审

专利信息
申请号: 202110703245.0 申请日: 2021-06-24
公开(公告)号: CN113403412A 公开(公告)日: 2021-09-17
发明(设计)人: 王萌;马巧妮;朱兴全 申请(专利权)人: 中国农业科学院兰州兽医研究所
主分类号: C12Q1/6893 分类号: C12Q1/6893;C12Q1/6844;C12N15/113
代理公司: 北京高沃律师事务所 11569 代理人: 薛红凡
地址: 730070 *** 国省代码: 甘肃;62
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摘要:
搜索关键词: 一种 基于 等温 扩增 crispr cas12a 技术 检测 弓形虫 试剂盒 及其 应用
【权利要求书】:

1.一种用于特异性检测弓形虫DNA的crRNA,其特征在于,所述crRNA的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示。

2.一种基于等温扩增-CRISPR/Cas12a技术检测弓形虫DNA的试剂盒,其特征在于,包括以下组分:

权利要求1所述crRNA、Cas12a蛋白和荧光报告基团标记的ssDNA。

3.权利要求1所述crRNA或权利要求2所述试剂盒在检测环境中弓形虫DNA中的应用。

4.根据权利要求3所述应用,其特征在于,所述环境包括环境土壤、水源。

5.根据权利要求3所述应用,其特征在于,所述弓形虫DNA包括弓形虫卵囊DNA。

6.一种基于权利要求2所述试剂盒检测环境中弓形虫DNA的方法,其特征在于,包括以下步骤:

1)提取环境样品中总DNA;

2)以步骤1)提取的总DNA为模板进行等温扩增,得到扩增产物;

3)将crRNA和Cas12a蛋白混合,孵育,得到核酸蛋白复合物;

4)将所述核酸蛋白复合物与所述扩增产物和荧光报告基团标记的ssDNA溶液混合,孵育,得到反应产物;

5)将所述反应产物测定荧光强度,根据荧光强度的有无判断环境样本中是否含有弓形虫:当检测到荧光强度信号时,表明环境样本中含有弓形虫,反之则不含。

7.根据权利要求6所述方法,其特征在于,步骤3)中crRNA和Cas12a蛋白的摩尔比为1:0.8。

8.根据权利要求6所述方法,其特征在于,步骤4)中所述核酸蛋白复合物、所述扩增产物和荧光报告基团标记的ssDNA溶液的体积比为1:1:1;

所述荧光报告基团标记的ssDNA溶液的浓度为1μM。

9.根据权利要求6所述方法,其特征在于,步骤2)中所述等温扩增包括重组酶介导扩增、环介导等温扩增、依赖核酸序列扩增或重组酶聚合酶扩增。

10.根据权利要求6~9任意一项所述方法,其特征在于,所述环境样本中弓形虫的浓度不低于100copies/μL。

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