[发明专利]一种应用于二代感染宏基因组检测的临床样本处理方法有效
| 申请号： | 202110682406.2 | 申请日： | 2021-06-19 |
| 公开（公告）号： | CN113322304B | 公开（公告）日： | 2022-06-07 |
| 发明（设计）人： | 陈阳;卜范峰;丁然;姜瑞凡;张付康;任用;李诗濛 | 申请（专利权）人： | 江苏先声医学诊断有限公司;江苏先声诊断技术有限公司;南京先声诊断技术有限公司 |
| 主分类号： | C12Q1/6806 | 分类号： | C12Q1/6806;C12Q1/6869;C12Q1/04;C40B50/06 |
| 代理公司： | 暂无信息 | 代理人： | 暂无信息 |
| 地址： | 210042 江苏省南京*** | 国省代码： | 江苏;32 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 一种 应用于 二代 感染 宏基 检测 临床 样本 处理 方法 | ||
【权利要求书】：
1.一种应用于二代感染宏基因组检测的临床样本的处理方法，其特征在于，包括如下步骤：
1）样品预处理步骤：
取感染样本离心处理，保留部分上清及沉淀；
对于非粘稠类感染样本，取1-2mL样本，12,000-14,000g离心3-5min，吸去上清，并留部分上清及沉淀在离心管中备用；
对于粘稠类感染样本，取100-200µL样本加入解稠剂或PBS，涡旋震荡，40-42℃、300-400rpm震荡孵育10-15 min，然后12,000-14,000 g离心3-5min，吸去上清，并留部分上清及沉淀在离心管中备用；
2）样品溶菌破壁步骤：
预处理后样本加入溶菌酶，所述溶菌酶在反应体系中的终浓度大于1mg/mL，35-37℃温育10-15min；
温育后样本加入MP Lysing Matri E管中，GB裂解液裂解；MP破壁仪上5-6m/s震荡60-120s，1-2次；再将 MP Lysing Matri E管12,000-14,000g 低温离心3-8min，储存备用；
所述感染样本为肺泡灌洗液或痰液。
2.一种二代感染宏基因组建库方法，其特征在于，包括权利要求1所述的处理方法，以及进一步包括核酸提取和文库构建步骤。
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