[发明专利]一种甲氨蝶呤代谢标志物的检测试剂盒及其检测方法和应用在审
申请号: | 202110661230.2 | 申请日: | 2021-06-15 |
公开(公告)号: | CN113528629A | 公开(公告)日: | 2021-10-22 |
发明(设计)人: | 孙悦;刘丹 | 申请(专利权)人: | 湖南菲思特精准医疗科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6858 | 分类号: | C12Q1/6858;C12Q1/6886;C12N15/11 |
代理公司: | 湖南乔熹知识产权代理事务所(普通合伙) 43262 | 代理人: | 安曼 |
地址: | 410000 湖南省长沙市开福区沙坪街道中*** | 国省代码: | 湖南;43 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 蝶呤 代谢 标志 检测 试剂盒 及其 方法 应用 | ||
1.一种甲氨蝶呤代谢标志物的检测试剂盒,其特征在于,所述试剂盒用于检测氨甲喋呤代谢标志物ABCB1(C3435T)、MTHFR(C677T)和SLCO1B1(c.1865+4846TC)基因多态性,试剂盒包括如下组分:ABCB1(C3435T)扩增引物、ABCB1(C3435T)测序引物、MTHFR(C677T)扩增引物、MTHFR(C677T)测序引物、SLCO1B1(c.1865+4846TC)扩增引物、SLCO1B1(c.1865+4846TC)测序引物和阳性对照。
2.根据权利要求1所述的甲氨蝶呤代谢标志物的检测试剂盒,其特征在于,所述ABCB1(C3435T)扩增引物如序列表SEQ ID NO:1~2所示。
3.根据权利要求1所述的甲氨蝶呤代谢标志物的检测试剂盒,其特征在于,所述MTHFR(C677T)测序引物如序列表SEQ ID NO:3~4所示。
4.根据权利要求1所述的甲氨蝶呤代谢标志物的检测试剂盒,其特征在于,所述SLCO1B1(c.1865+4846TC)扩增引物如序列表SEQ ID NO:5~6所示。
5.根据权利要求1所述的甲氨蝶呤代谢标志物的检测试剂盒,其特征在于,所述ABCB1(C3435T)测序引物如序列表SEQ ID NO:7所示,MTHFR(C677T)测序引物如序列表SEQ IDNO:8所示,SLCO1B1(c.1865+4846TC)测序引物如序列表SEQ ID NO:9所示。
6.根据权利要求1所述的甲氨蝶呤代谢标志物的检测试剂盒,其特征在于,所述测序引物为琼脂糖凝胶颗粒与氨基标记的DNA序列的结合物。
7.根据权利要求1所述的甲氨蝶呤代谢标志物的检测试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括扩增缓冲液、18mM醋酸镁、dNTPS、链置换DNA聚合酶、单链DNA结合蛋白、结合单链核酸的重组酶和海藻糖。
8.根据权利要求1所述的甲氨蝶呤代谢标志物的检测试剂盒,其特征在于,所述的阳性对照包括浓度为20ng/ul的ABCB1(C3435T)、MTHFR(C677T)、SLCO1B1(c.1865+4846TC)杂合型基因组DNA。
9.一种采用根据权利要求1~8任一项所述的甲氨蝶呤代谢标志物的检测试剂盒,其特征在于,所述检测方法包括以下步骤:
a.将所述扩增反应液与5ul待测基因组DNA,采用多重RPA扩增进行扩增;
b.结合液(含微珠)与扩增产物进行结合;
c.变性液处理得到单链产物;
d.加入洗涤缓冲液漂洗;
e.向每个测序管中加入测序酶和测序底物;
f.取一个8排管,自圆滑一端向平端依次加入dATP、dTTP、dGTP、dCTP、ABCB1(C3435T)测序引物、MTHFR(C677T)测序引物、SLCO1B1(c.1865+4846TC)测序引物、ddGTP、ddCTP;
g.焦磷酸测序;
h.确定ABCB1(C3435T)位点、MTHFR(C677T)位点、SLCO1B1(c.1865+4846TC)位点甲氨喋呤药物剂量及不良反应位点的基因型。
10.一种根据权利要求1~8任一项所述的甲氨蝶呤代谢标志物的检测试剂盒的应用,其特征在于,所述检测试剂盒用于体外检测待测样本中的ABCB1(C3435T)、MTHFR(C677T)和SLCO1B1(c.1865+4846TC)基因多态性。
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