[发明专利]一套具有包容性且精准鉴别并挖掘稻瘟病Pik抗病等位基因家族的技术体系及应用和分子标记

权利要求书

1.一套具有包容性且精准鉴别并挖掘稻瘟病Pik抗病等位基因家族的技术体系，其特征在于，该技术体系由“单元型-亚单元型-等位基因”三级检测标记组成并逐级推进；供试品种是否携带目标基因由该技术体系检测的统合结果而决定；

具体地，所述技术体系包含：

(1)该基因家族之功能性单元型/非功能性单元型的检测程序：

通过族内等位基因的序列比较而界定单元型分化清晰的基因组区域；设计2组单元型特异性分子标记并进行基于PCR技术的已知抗病基因参考品种的单元型分析而确认其可靠性；只有同时被判断为K1及K2基因型的品种方为功能性单元型品种；在后续的检测中，非功能性品种可被排除；

(2)该基因家族之K1/K2功能性单元型之亚单元型KM1/KM2、KH1/KH2、KM1/KH2、KH1/KM2的检测程序：

通过族内等位基因的序列比较而界定亚单元型特异性的单核苷酸多态性位点SNP；设计1组亚单元型特异性分子标记并进行基于PCR技术的已知抗病基因参考品种的亚单元型分析而确认其可靠性；

(3)该基因家族之K1/K2功能性单元型之KM1/KM2亚单元型之广谱持久抗性基因Pik的检测程序：

通过族内等位基因的序列比较而界定目标基因特异性的SNP；分别设计其特异性分子标记并进行基于PCR技术的已知抗病基因参考品种目标基因的特异性基因型分析而确认其可靠性；Pik基因携带者应该属于Pik基因家族之K1/K2功能性单元型，KM1/KM2亚单元型，而且2个功能特异性分子标记皆为与Pik参考品种相同基因型的品种；反之，任一检测标记不符合本技术体系的检测结果都不是目标基因Pik；

(4)该基因家族之K1/K2功能性单元型之KM1/KM2亚单元型之广谱持久抗性基因Pik-m的检测程序：

通过族内等位基因的序列比较而界定目标基因特异性的SNP；设计其特异性分子标记并进行基于PCR技术的已知抗病基因参考品种目标基因的特异性基因型分析而确认其可靠性；Pik-m基因携带者应该属于Pik基因家族之K1/K2功能性单元型，KM1/KM2亚单元型，而且功能特异性分子标记为与Pik-m参考品种相同基因型的品种；反之，任一检测标记不符合本技术体系的检测结果都不是目标基因Pik-m；

(5)该基因家族之K1/K2功能性单元型之KM1/KM2亚单元型之抗性基因Pik-s的检测程序：

通过族内等位基因的序列比较而界定目标基因特异性的SNP；分别设计其特异性分子标记并进行基于PCR技术的已知抗病基因参考品种目标基因的特异性基因型分析而确认其可靠性；Pik-s基因携带者应该属于Pik基因家族之K1/K2功能性单元型，KM1/KM2亚单元型，而且2个功能特异性分子标记皆为与Pik-s参考品种相同基因型的品种；反之，任一检测标记不符合本技术体系的检测结果都不是目标基因Pik-s；

(6)该基因家族之K1/K2功能性单元型之KM1/KM2亚单元型之广谱持久抗性基因Pi1的检测程序：

通过族内等位基因的序列比较而界定目标基因特异性的SNP；分别设计其特异性分子标记并进行基于PCR技术的已知抗病基因参考品种目标基因的特异性基因型分析而确认其可靠性；Pi1基因携带者应该属于Pik基因家族之K1/K2功能性单元型，KM1/KM2亚单元型，而且2个功能特异性分子标记皆为与Pi1参考品种相同基因型的品种；反之，任一检测标记不符合本技术体系的检测结果都不是目标基因Pi1；

(7)该基因家族之K1/K2功能性单元型之KM1/KH2混合亚单元型之新型抗性基因Pik-IR8的检测程序：

通过族内等位基因的序列比较而界定目标基因特异性的SNP；分别设计其特异性分子标记并进行基于PCR技术的已知抗病基因参考品种目标基因的特异性基因型分析而确认其可靠性；Pik-IR8基因携带者应该属于Pik基因家族之K1/K2功能性单元型，KM1/KH2亚单元型，而且2个功能特异性分子标记皆为与Pik-IR8参考品种相同基因型的品种；反之，任一检测标记不符合本技术体系的检测结果都不是目标基因Pik-IR8；

(8)该基因家族之K1/K2功能性单元型之KH1/KH2亚单元型之广谱持久抗性基因Pik-p＝Pi7的检测程序：

通过族内等位基因的序列比较而界定目标基因特异性的SNP；分别设计其特异性分子标记并进行基于PCR技术的已知抗病基因参考品种目标基因的特异性基因型分析而确认其可靠性；Pik-p基因携带者应该属于Pik基因家族之K1/K2功能性单元型，KH1/KH2亚单元型，而且2个功能特异性分子标记皆为与Pik-p参考品种相同基因型的品种；反之，任一检测标记不符合本技术体系的检测结果都不是目标基因Pik-p；

(9)该基因家族之K1/K2功能性单元型之KH1/KH2亚单元型之广谱持久抗性基因Pik-h的检测程序：

通过族内等位基因的序列比较而界定目标基因特异性的SNP；分别设计其特异性分子标记并进行基于PCR技术的已知抗病基因参考品种目标基因的特异性基因型分析而确认其可靠性；Pik-h基因携带者应该属于Pik基因家族之K1/K2功能性单元型，KH1/KH2亚单元型，而且2个功能特异性分子标记皆为与Pik-h参考品种相同基因型的品种；反之，任一检测标记不符合本技术体系的检测结果都不是目标基因Pik-h；

(10)该基因家族之K1/K2功能性单元型之KH1/KH2亚单元型之新型抗性基因Pik-IR64的检测程序：

通过族内等位基因的序列比较而界定目标基因特异性的SNP；分别设计其特异性分子标记并进行基于PCR技术的已知抗病基因参考品种目标基因的特异性基因型分析而确认其可靠性；Pik-IR64基因携带者应该属于Pik基因家族之K1/K2功能性单元型，KH1/KH2亚单元型，而且2个功能特异性分子标记皆为与Pik-IR64参考品种相同基因型的品种；反之，任一检测标记不符合本技术体系的检测结果都不是目标基因Pik-IR64。