[发明专利]一种与奶山羊产奶性状相关的SNP分子标记及其制备的液相芯片和应用

说明书

本发明提供了一种与奶山羊产奶性状相关的SNP分子标记及其制备的液相芯片和应用，属于分子生物SNP技术和芯片技术领域。本发明提供了与奶山羊产奶性状相关的SNP分子标记，包括以下情形：1)以下83种SNP分子标记中的一种或几种：SNP分子标记DGHMS01～DGHMS83；2)情形1)中所述SNP分子标记的互补序列或同源序列。根据SNP分子标记设计分子探针组，用所述分子探针组制备液相芯片。采用液相芯片检测奶山羊产奶量，结果聚类分析和主成分分析以及性状统计结果表明83个分子标记与奶山羊的产奶性状紧密相关。因此，分子探针用于检测奶山羊产奶量，可用于筛选或鉴定高产奶山羊品种。

技术领域

本发明属于分子生物SNP技术和芯片技术领域，具体涉及一种与奶山羊产奶性状相关的SNP分子标记及其制备的液相芯片和应用。

背景技术

奶山羊产业是我国奶业发展的重要组成部分。随着羊奶消费市场的快速升温，我国奶山羊产业发展呈蓬勃之势，山羊奶已成为我国第二大奶类。目前，中国奶山羊的存栏量约为1300万只，泌乳奶山羊约为790万只，山羊奶总产量约为175万吨，占全国鲜奶产量约4.5％。与此同时，奶山羊产业正在从传统的奶山羊养殖模式快速转向现代化、集约化、标准化、多样化的质量效益型适度规模经营模式。羊奶是奶中的贵族奶，具有易吸收、低致敏优势，具有免疫球蛋白、表皮细胞生长因子、胰岛素样生长因子、乳铁蛋白等活性物质。90％以上亚洲人因缺乏乳糖调控酶基因，饮用牛奶后会出现乳糖不耐症，而羊奶蛋白组成与人类母乳高度相似，不含致敏异型酪蛋白，脂肪颗粒小，含大量上皮细胞因子，是最适宜中国人消化吸收的保健型乳品。近年来随着人们对山羊奶营养价值的认可度提升，羊奶消费热在我国逐渐兴起，奶山羊养殖业也逐渐成为我国畜牧业的特色产业。

产奶量已经成为奶山羊经济性能的衡量指标。目前，我国奶山羊选种技术落后，只能将羊饲养至12月龄以上，产羔配种有奶之后才能通过产奶量判断其优劣，使得奶山羊场选种效率低，更新淘汰率低，且大大增加了规模化养殖场的饲养成本。

发明内容

有鉴于此，本发明的目的在于提供一种与奶山羊产奶性状相关的SNP分子标记及其制备的液相芯片和应用，所述SNP分子标记在羔羊初生早期阶段能够实现奶山羊产奶潜力的预判，提高高产奶山羊的选种准确性，加速奶山羊育种进程。

本发明提供了一种与奶山羊产奶性状相关的SNP分子标记，所述SNP分子标记包括以下情形：

1)以下83种SNP分子标记中的一种或几种：SNP分子标记DGHMS01～SNP分子标记DGHMS83；

所述SNP分子标记DGHMS01～SNP分子标记DGHMS83的核苷酸序列如SEQ ID NO:1～SEQ ID NO:83所示，第23位核苷酸存在A/G、G/A、G/A、T/A、T/C、A/G、G/A、G/A、C/T、T/C、A/T、C/T、A/G、G/C、C/T、T/C、G/A、A/G、G/T、T/C、T/C、G/A、C/A、T/C、G/A、A/T、C/A、A/G、C/T、G/A、G/A、C/G、G/A、T/C、T/A、A/G、A/G、T/C、C/T、A/G、A/G、A/G、C/G、C/G、C/T、G/A、A/G、C/G、T/C、G/A、G/T、C/A、G/T、T/C、C/G、C/T、T/C、T/C、G/A、G/A、C/G、C/G、G/T、T/A、C/G、G/A、G/A、G/C、G/A、A/T、Aa/Cc、G/A、C/T、T/G、A/G、C/T、G/C、A/G、A/G、Aa/Cc、C/T、G/A、T/G 83个多态性位点；

2)情形1)中所述SNP分子标记的互补序列或同源序列。

本发明提供了一种用于检测奶山羊产奶潜力的分子探针组，所述分子探针为根据所述与奶山羊产奶性状相关的SNP分子标记的核苷酸序列合成得到；每个所述SNP分子标记根据多态性位点的碱基差异合成两条分子探针；

所述分子探针的核苷酸序列如SEQ ID NO:84～SEQ ID NO:249中任意一对或几对。