[发明专利]急性淋巴性白血病甲基化生物标记物及其应用

说明书

本发明涉及一种急性淋巴性白血病甲基化生物标记物及其应用，本发明公开了15个用于急性淋巴性白血病诊断的甲基化生物标记物，通过研究这些基因组片段在ALL患者及健康人群中的甲基化修饰差异，发现以上基因组片段组合都能够作为ALL诊断标记物。本发明联合分析至少1个基因组片段上的多个甲基化胞嘧啶的共甲基化特征作为判断ALL发病的生物标记物准确度高，特异性强，对于ALL的预测、靶向药物开发和伴随诊断、特别是治疗后微小残留病监测(MRD)的筛查诊断意义重大。

技术领域

本发明涉及生物医药领域，特别是涉及一种急性淋巴性白血病甲基化生物标记物及其应用。

背景技术

急性淋巴细胞白血病(acute lymphoblastic leukemia，ALL)是淋巴母细胞异常增生引起的恶性克隆性肿瘤，是最常见的发生于儿童的癌症，占儿童全部癌症的26％，占儿童急性白血病的75％-80％，其中B细胞急性淋巴细胞白血病在儿童所有ALL中占80％，是最为常见的ALL类型。成人ALL患者的发病率较低，约占成人急性白血病的20％。

正常情况下，骨髓生成的血液干细胞，也叫免疫细胞，将会分化为成熟血细胞。血液干细胞可转化为髓质干细胞和淋巴干细胞两种。其中髓质干细胞将分化为三种成熟血细胞，包括载氧和其他底物到身体不同器官组织的红细胞；起凝血作用的血小板和抗外源感染和疾病的粒细胞(白细胞)。髓质干细胞异常是急性髓性白血病(AML)的主要发病原因；淋巴干细胞首先分化为淋巴母细胞，进而分化为机体生产抗体，抵御外援感染的B淋巴细胞和协助B淋巴细胞产生抗体的T淋巴细胞，以及攻击肿瘤细胞和病毒的自然杀伤细胞。ALL患者大量干细胞转为淋巴母细胞、B淋巴细胞或T淋巴细胞，又称为白血病细胞，他们不能有效的防御外源感染，导致血液和骨髓中白细胞，红细胞和血小板细胞数量降低，引发感染、贫血或出血。对于绝大多数肿瘤，越早发现对于其后续的临床治疗越发简单，患者收益越高。然而，到目前为止，世界上没有特殊的应用于急性淋巴性白血病的检测技术方法，白血病常规检测为骨髓或血液样本显微镜检，通过白细胞等的大小、形状和其他特征对其进行鉴定和分类，最主要的指标是血细胞是否成熟。ALL患者的确诊通常需要骨髓中至少20％的细胞为幼稚细胞，正常情况下，幼稚细胞不超过骨髓细胞的5％。

另一方面，对于复发难治性白血病患者，存在治疗监测难和预后难等问题，复发治疗极易产生药物抗性，治疗效果逐渐降低。患者用药缓解后微小残留病变(minimalresidual disease，MRD)的检测已成为不同肿瘤临床治疗检测研究热点。白血病患者在经过治疗达到完全缓解(CR)后，虽然用常规的形态学方法(放大100倍显微镜观察骨髓)不能检测到的明显的白血病细胞，但体内可能仍然存留少量白血病残留细胞。即使用流式细胞学方法来检测，灵敏度可以达到10^-4～10^-5(也就是1万～10万个细胞中可发现1个白血病细胞)，然而却无法检测到更早期的出现细胞形态变化前的细胞。应用分子诊断学方法可以发现更早期的具有基因变异或基因表达差异的白血病细胞，目前临床检测的分子标记物主要集中在细胞遗传学异常，如融合基因和点突变等。但是携带此类细胞遗传学异常和突变异常的患者仅仅占患病人群的一部分。鉴于白血病的复杂性，寻找可用于精确诊断和预后分层的分子标记物具有重要意义。