[发明专利]用于16价HPV病毒分型检测的复合扩增体系及试剂盒在审

专利信息
申请号: 202110541801.9 申请日: 2021-05-18
公开(公告)号: CN113481322A 公开(公告)日: 2021-10-08
发明(设计)人: 于在亮;黄维金;黄杰;聂玲玲;许姝歆;李朝萍;冯晓琴 申请(专利权)人: 苏州阅微基因技术有限公司
主分类号: C12Q1/70 分类号: C12Q1/70;C12Q1/686;C12N15/11
代理公司: 南京纵横知识产权代理有限公司 32224 代理人: 刘妍妍
地址: 215011 江苏省苏*** 国省代码: 江苏;32
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摘要:
搜索关键词: 用于 16 hpv 病毒 检测 复合 扩增 体系 试剂盒
【说明书】:

发明属于生物检测技术领域,公开了一种用于16价HPV病毒分型检测的复合扩增体系及其试剂盒,所述的扩增体系中包括26对检测引物,其核苷酸序列如SEQ ID NO.1‑38所示。采用本发明中的扩增系统和方法可检出16种HPV分型,所选分型为16价疫苗对应分型,可度高并有较实用检出意义。其中较为常用的9价可检出分型都有两种检测位点分别设定在HPV基因组的L1区和E区,可保证试剂盒检测HPV分型更高效、精准、灵敏。

技术领域

本发明属于生物检测技术领域,具体涉及一种用于16价HPV病毒分型检测的复合扩增体系及试剂盒。

背景技术

人类乳头瘤病毒(Human Papilloma Virus,简称HPV)是一种乳多空病毒科的乳头瘤空泡病毒A属,是球形DNA病毒感染引起的一种性传播疾病,主要感染区域有人类表皮和粘膜鳞状上皮,已知HPV可引起人类良性的肿瘤和疣。该病毒特异性很高,至今已分离出130多种,包括HPV6、11、42、43、44等型别,常引起外生殖器湿疣等良性病变包括宫颈上皮内低度病变(CINI)。此类为低危型别。

高危型HPV包括HPV16、18、31、33、35、39、45、51、52、56、58、59、68等型别,与宫颈癌及宫颈上皮内高度病变(CINⅡ/Ⅲ)的发生相关,尤其是HPV16和18型。长期感染可能与女性宫颈癌有关。从HPV感染到宫颈癌发生需要较长时间,因此尽早检测是否感染HPV,有利于预防宫颈癌的发生。最新的宫颈癌筛查指南也建议高危HPV分型检测方法作为一线的宫颈癌筛查方法。

目前临床上用于检测HPV的方法包括细胞学方法、免疫组化、原位杂交、斑点杂交、核酸印迹和PCR等,其中以PCR方法的敏感性最高,是目前应用最多的方法。基于PCR技术的检测方法又包含特异引物PCR和通用引物PCR之后的膜杂交法、基因芯片法、反向点杂交法、流氏荧光杂交法、荧光探针法等。不同的方法有各自的优点和不足,无法兼顾操作简便、灵敏度高、特异性好、价格低廉和客观性强的特点,只能根据不同需求选择合适、有效的检测方法满足检测要求。

HPV病毒基因组较小,仅含有约7900个碱基对。病毒基因组分为3个部分:早期基因区(E)、晚期基因区(L)及将早期区与晚期区分开的长调控区(LCR)。调控区主要调控病毒的转录,控制病毒蛋白和感染颗粒的产生。早期区编码E6、E7、E1、E2、E4、E3和E5蛋白质,主要参与病毒DNA复制、转录。晚期区编码L1、L2蛋白分别是病毒的主要壳蛋白和次要壳蛋白。根据不同基因区功能性特点和序列保守性特征,目前基于荧光标记PCR方法检测人乳头瘤病毒DNA大多选择的靶点为E6E7区或者L1区。其中L1区序列非常保守,是区分不同亚型的主要依据,但是在HPV病毒DNA整合进入人基因组的过程会有一定几率导致HPV L1基因缺失。

发明内容

针对上述问题,本发明提供一种操作简单、灵敏度高、特异性好且价格较低的用于16价HPV病毒分型检测的复合扩增体系及试剂盒。

实现上述技术目的,达到上述技术效果,本发明通过以下技术方案实现:

本发明中的用于16价HPV病毒分型检测的复合扩增体系,是在基于所选取的16种HPV分型病毒的基础上所设计的26对检测引物,其核苷酸序列如下表所示。

具体的,所述引物包括对应于9种HPV分型病毒中的L区和E区检测位点中的18对检测引物,和另外7对用于检测其它7种高危型HPV病毒的E区检测位点,以及1对针对人类基因组DNA的β-globin的检测引物。

进一步,在扩增体系中包括0.1-0.4μM多对所述检测引物。

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