[发明专利]一种RNA文库的构建方法及试剂盒有效
申请号: | 202110493902.3 | 申请日: | 2021-05-07 |
公开(公告)号: | CN113005178B | 公开(公告)日: | 2023-08-11 |
发明(设计)人: | 方圆;蔡青青;宋泽世 | 申请(专利权)人: | 探因医学科技(浙江)有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6806 | 分类号: | C12Q1/6806;C12N15/10;C40B50/06 |
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地址: | 317300 浙江省*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 rna 文库 构建 方法 试剂盒 | ||
1.一种RNA文库的构建方法,其特征在于,包括如下步骤:
向片段化的总RNA中加入能够与rRNA特异性结合并延伸的探针,孵育,所述探针不带接头序列;
加入逆转录体系进行第一次逆转录;
加入带有接头序列的随机引物进行第二次逆转录,得到逆转录产物;
加入连接引物和连接酶将所述逆转录产物进行连接,得到连接产物;
加入扩增引物,对所述连接产物进行PCR扩增,得到所述RNA文库;
所述接头序列为ACGCTCTTCCGATCT;
所述孵育的条件为:60℃ 5min;
所述第一次逆转录条件为:42℃ 10min;
所述探针长度为5-45bp;
所述连接酶为5’App DNA/RNA热稳定连接酶。
2.根据权利要求1所述的构建方法,其特征在于,所述连接引物为CAAGCAGAAGACGGCATACGAGAT,其中,连接引物的5'端腺苷酸化。
3.根据权利要求1所述的构建方法,其特征在于,所述扩增引物包括上游引物和下游引物,所述上游引物从5’端至3’端依次包括:上游测序平台序列、第一文库标签序列以及上游测序引物序列,所述下游引物从5’端至3’端依次包括:下游测序平台序列、第二文库标签序列以及下游测序引物序列,其中,所述下游测序引物序列与所述随机引物的5’端的至少部分序列相同或互补,所述上游测序引物序列与所述连接引物的5’端的至少部分序列相同或互补。
4.根据权利要求3所述的构建方法,其特征在于,所述扩增引物序列为:
上游引物:
GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACXXXXXXXXATCTCGTATGCCGTCTTCTGCTTG;
下游引物:
AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACACXXXXXXXXACACTCTTTCCCTACACGACGCTCTTCCGATC,
其中XXXXXXXX为index序列。
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