[发明专利]一种评价生物滤池反冲洗效果的方法有效

专利信息
申请号: 202110490212.2 申请日: 2021-05-06
公开(公告)号: CN113462747B 公开(公告)日: 2023-06-27
发明(设计)人: 柏耀辉;林慧;周洁;王东麟;曲久辉 申请(专利权)人: 中国科学院生态环境研究中心
主分类号: C12Q1/6806 分类号: C12Q1/6806;C12Q1/689;C12Q1/6895;C12Q1/6869
代理公司: 北京瑞盛铭杰知识产权代理事务所(普通合伙) 11617 代理人: 郭晓迪
地址: 100085*** 国省代码: 北京;11
权利要求书: 查看更多 说明书: 查看更多
摘要:
搜索关键词: 一种 评价 生物 滤池 冲洗 效果 方法
【权利要求书】:

1.一种评价生物滤池反冲洗效果的方法,其特征在于,包括如下步骤:

(1)分别采集生物滤池反冲洗前以及反冲洗后不同恢复时间的滤料样品;

(2)提取步骤(1)采集的滤料样品中微生物的DNA并进行基因测序,获得基因测序数据;

(3)对步骤(2)获得的基因测序数据进行处理,计算每个滤料样品中微生物的物种丰度,获得物种丰度数据集,其中,运用Wilcox非参数检验筛选出反冲洗前后物种丰度发生显著变化且变化大于2倍的微生物,以筛选出的微生物的丰度形成所述物种丰度数据集;

(4)以步骤(3)获得的物种丰度数据集作为响应变量,以是否进行反冲洗处理作为解释变量,以反冲洗后的恢复时间作为协变量,建立主响应曲线PRC模型,以反冲洗前滤料样品中微生物的物种丰度为参考值,提取反冲洗后不同恢复时间的典范系数,作为评价生物滤池反冲洗效果的指标,

所述方法还包括:以反冲洗后的恢复时间为横坐标,以典范系数为纵坐标,构建loess局部加权回归拟合曲线并以该曲线评价生物滤池反冲洗效果,

在步骤(2)中,对微生物DNA的16S rRNA V3-V4区段进行双末端测序;

在步骤(3)中,获得物种丰度数据集的方法包括:

对获得的原始测序数据raw reads进行去杂、去引物、去接头、过滤低质量reads,得到高质量数据clean data;

对clean data依次进行合并双端数据、去除低质量reads、去噪、去冗余,生成扩增子序列变异ASVs;

对ASVs进行物种注释并计算每个滤料样品中微生物的物种丰度,

其中,使用QIIME2对clean data进行处理生成ASVs;使用q2-quality-filter q-score-joined根据质量得分phred4去除低质量reads;使用QIIME2的q2-feature-classifier运用预先训练好的Naive Bayes分类器进行物种注释;使用Greengenes 13_8按99%聚类操作分类单元OTUs序列中的V4区段训练所述分类器。

2.根据权利要求1所述的评价生物滤池反冲洗效果的方法,其特征在于,在步骤(4)中,使用R软件包vegan建立主响应曲线PRC模型。

3. 根据权利要求1所述的评价生物滤池反冲洗效果的方法,其特征在于,在步骤(2)中,使用Illumina NovaSeq 6000和/或Illumina MiSeq高通量测序仪进行测序,测序模式选择PE250、PE150、PE300中的至少一种。

4. 根据权利要求1所述的评价生物滤池反冲洗效果的方法,其特征在于,使用qiimevsearch join-pairs合并双端数据;使用qiime deblur denoise-16S识别和过滤嵌合子以进行去噪。

下载完整专利技术内容需要扣除积分,VIP会员可以免费下载。

该专利技术资料仅供研究查看技术是否侵权等信息,商用须获得专利权人授权。该专利全部权利属于中国科学院生态环境研究中心,未经中国科学院生态环境研究中心许可,擅自商用是侵权行为。如果您想购买此专利、获得商业授权和技术合作,请联系【客服

本文链接:http://www.vipzhuanli.com/pat/books/202110490212.2/1.html,转载请声明来源钻瓜专利网。

×

专利文献下载

说明:

1、专利原文基于中国国家知识产权局专利说明书;

2、支持发明专利 、实用新型专利、外观设计专利(升级中);

3、专利数据每周两次同步更新,支持Adobe PDF格式;

4、内容包括专利技术的结构示意图流程工艺图技术构造图

5、已全新升级为极速版,下载速度显著提升!欢迎使用!

请您登陆后,进行下载,点击【登陆】 【注册】

关于我们 寻求报道 投稿须知 广告合作 版权声明 网站地图 友情链接 企业标识 联系我们

钻瓜专利网在线咨询

周一至周五 9:00-18:00

咨询在线客服咨询在线客服
tel code back_top