[发明专利]水稻芒长基因gna1

权利要求书

1.一种检测水稻芒长基因gna1分子标记的引物，其特征在于，所述分子标记分别是P1、P2、P3、P4或P5，其对应的引物分别是：

P1：

上游引物：5'—AGACGAAAGATCAAACGC—3'；

下游引物：5'—TGGTGTAGGACGAGAAGC—3'；

P2：

上游引物：5'—GTCTTTTCTTCTCCAACTT—3'；

下游引物：5'—GCTACACCACCACTTCAT—3'；

P3：

上游引物：5'—GTGGACGACGAGGTATGCG—3'；

下游引物：5'—CCAAGCAACAGTAGCCAGCA—3'；

P4：

上游引物：5'—GGATGTGAGTGTGGTGTT—3'；

下游引物：5'—ATAATGGAAGTATTCAAAATGT—3'；

P5：

上游引物：5'—TGTGCGATACTGCTCAAGTT—3'；

下游引物：5'—GGAAGTAGGTTGAGAGGTTA—3'。

2.权利要求1所述的检测水稻芒长基因gna1分子标记的引物的获取方法，其特征在于，包括以下步骤：

将一个长芒普通野生稻DP30与短芒籼稻品种9311杂交，获得BC₁F₁，再连续回交4代获得BC₅F₁，最后自交后获得BC₅F₂分离群体，选择F₂群体中隐性的短芒单株用于短芒基因gna1的连锁分析和初步定位，获得以上所述的检测水稻芒长基因gna1分子标记的引物。

3.权利要求1所述的检测水稻芒长基因gna1分子标记的引物在水稻短芒基因gna1的定位与克隆中的应用。

4.权利要求1所述的检测水稻芒长基因gna1分子标记的引物在选育和改良水稻品种中的应用。

5.采用权利要求1所述的引物检测水稻芒长基因gna1分子标记的方法，其特征在于，包括以下步骤：

以待鉴定水稻材料全基因组DNA为模板，利用分子标记P1、P2、P3、P4和P5对应引物中的一对或多对进行PCR扩增，对扩增产物进行检测：

（1）采用分子标记P1引物进行扩增，若扩增出161bp的扩增片段，则表明有水稻短/无芒基因gna1的存在；

（2）采用分子标记P2引物进行扩增，若扩增出117bp的扩增片段，则表明有水稻短/无芒基因gna1的存在；

（3）采用分子标记P3引物进行扩增，若扩增出123bp的扩增片段，则表明有水稻短/无芒基因gna1的存在；

（4）采用分子标记P4引物进行扩增，若扩增出94bp的扩增片段，则表明有水稻短/无芒基因gna1的存在；

（5）采用分子标记P5引物进行扩增，若扩增出57bp或77bp的扩增片段，则表明有水稻短/无芒基因gna1的存在。

6.如权利要求5所述的方法，其特征在于：

所述PCR的反应体系如下：

引物4pmol/μL 2.5μL

dNTP2.5mmol/L 2.0μL

DNA模板25ng/μL 1.0μL

Taq DNA聚合酶5U/μL 0.2μL

10×PCR缓冲液 1.0μL

ddH₂O 3.3μL。