[发明专利]一种基于LFD-RMA法检测人鼻病毒的引物探针组在审

专利信息
申请号: 202110449742.2 申请日: 2021-04-25
公开(公告)号: CN113186343A 公开(公告)日: 2021-07-30
发明(设计)人: 陈大为;陈龙;张瑶 申请(专利权)人: 济南国益生物科技有限公司
主分类号: C12Q1/70 分类号: C12Q1/70;C12Q1/6844;C12N15/11;C12R1/93
代理公司: 济南信在专利代理事务所(特殊普通合伙) 37271 代理人: 黄波
地址: 250100 山东省济南*** 国省代码: 山东;37
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摘要:
搜索关键词: 一种 基于 lfd rma 检测 病毒 引物 探针
【说明书】:

本申请属于生物检测技术领域,具体为一种基于LFD‑RMA法检测人鼻病毒的引物探针组,包括检测人鼻病毒的引物对及对应的探针,所述下游引物的5’端用Biotin标记;探针的5’端用FAM标记,第33个碱基替换为THF(dSpacer),3’末端被阻断基团C3‑spacer修饰;扩增产物大小不超过500bp。本发明的检测方法特异性强、灵敏度高,操作简便,检测时间短,能够快速且准确地鉴定人鼻病毒,具有很好的应用前景。

技术领域

本申请属于生物检测技术领域,具体为一种基于LFD-RMA法检测人鼻病毒的引物探针组。

背景技术

人鼻病毒(Human rhinovirus,HRV)属小RNA病毒科,是普通感冒的最主要病原体之一,大约有10%-20%的成年人感冒是由鼻病毒感染引起,而婴儿感冒有15%-30%是由鼻病毒导致。HRV感染具有自限性,但是有时会引起诸如哮喘、充血性心衰、支气管扩张,包囊纤维化等严重并发症,并且HRV多与其它呼吸道病毒合并感染,例如呼吸道合胞病毒、腺病毒、副流感病毒、冠状病毒以及肠道病毒等。

目前HRV的检测方法有组织培养、血清抗体检测及实时荧光定量PCR等。其中,HRV分离是检测HRV感染的金标准,但由于其需要的细胞培养条件苛刻,而检出率较低,耗时较长,故不宜用于HRV的快速检测;由于人鼻病毒具有众多血清型,缺乏合适的交叉反应抗原,使得血清学方法检测人鼻病毒抗体受到很大限制;实时荧光定量PCR需要相关的昂贵仪器设备且需要有专业技术人员操作,因此在基层和现场的检测应用受到很大限制。而重组酶介导扩增(Recombinase Mediated Amplification,RMA)技术,是近年来发展出的一种敏感、特异、简便、快捷的等温核酸扩增技术,被认为是可替代PCR的核酸检测技术,主要依赖重组酶、单链DNA结合蛋白(SSB)和链置换DNA聚合酶三种酶。RMA反应可以在37~42℃进行,整个过程在30min内即可达到检测水平;且RMA可以与侧流层析技术(LFD)结合,既不要求特殊仪器设备,也无需复杂的样品处理,仅使用侧流层析试纸就可以通过肉眼观察结果。因此可实现HRV的快速检测。

本发明采用LFD-RMA法建立快速检测人鼻病毒的方法,为人鼻病毒的现场检测提供一种快速、简单、可靠的新方法。

发明内容

为了解决现有技术的问题,本申请提供了一种基于LFD-RMA法检测人鼻病毒的引物探针组本申请是通过下述方案实现的:

一种基于LFD-RMA法检测人鼻病毒的引物探针组,包括检测人鼻病毒的引物对及对应的探针,其中,引物和探针序列为:

HRV-F:

5’-CAGGAGGGAAGGATGGTAGAGAATGGGACACAG-3’;

HRV-R:

5’-[Biotin]TGCCAAACACTTTGATATCACTCGCTCCGGTTC-3’;

HRV-P:

5’-[FAM]TCACGATAACTTTCACAGGGTTGGGATCGGCA[dSpacer]ATTACATGTTCTATG[C3-spacer]-3’。

优选的,所述下游引物的5’端用Biotin标记;探针的5’端用FAM标记,第33个碱基替换为THF(dSpacer),3’末端被阻断基团C3-spacer修饰;扩增产物大小不超过500bp。

一种基于LFD-RMA法检测人鼻病毒的试剂盒,该试剂盒中包括有:含有扩增反应试剂的检测管、缓冲液、醋酸镁、标准阳性质粒、无菌双蒸水、侧流层析检测试纸条。

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