[发明专利]一种金针菇徐金18菌种的微卫星DNA标记指纹图谱的鉴定方法及其构建方法与应用有效
| 申请号: | 202110383020.1 | 申请日: | 2021-04-09 |
| 公开(公告)号: | CN113186328B | 公开(公告)日: | 2023-02-28 |
| 发明(设计)人: | 吴莹莹;李燕;鲍大鹏;王莹;尚俊军;邹根 | 申请(专利权)人: | 上海市农业科学院 |
| 主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12Q1/6858 |
| 代理公司: | 南京灿烂知识产权代理有限公司 32356 | 代理人: | 王江南 |
| 地址: | 201106 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 金针菇 18 菌种 卫星 dna 标记 指纹 图谱 鉴定 方法 及其 构建 应用 | ||
1.一种金针菇徐金18菌种的微卫星DNA标记指纹图谱的鉴定方法,其特征在于:所述指纹图谱由6对微卫星DNA标记组成,其对应的6对引物的具体序列如下:
FfSSR1 正向引物:TCTGAATGTCCCGGAGCGT;
反向引物:GATACGAGCAGCACTCGCG;
FfSSR3 正向引物:CGTGCGCGTTACAATCCAT;
反向引物:TAGGCCCCCCAAGAAACAT;
FfSSR10 正向引物:GGTGCACGCTCCTAAACCTA;
反向引物:CTTGTCGAGGAAGATCCATG;
FfSSR11 正向引物:AGTGATGACGAGGACAGTGA;
反向引物:CCTTCCTCCTCCATAGCAAA;
FfSSR13 正向引物:ATTTCTTCGGATGCTTTGGA;
反向引物:TTCTCTTTGCACACGTCGAA;
FfSSR15 正向引物:AGTCGTCGTTCAAGGTGTCG;
反向引物:CGGTTGTTTGTTCCACTTTT;
相应带型编号组合为:6/5/(4+7)/(2+3)/(7+10)/(2+10);
其中,引物FfSSR1对应的带型编号为6,其对应的等位基因片段的条带大小为283~283.99bp;引物FfSSR3对应的带型编号为5,其对应的等位基因片段的条带大小为345~345.99bp;引物FfSSR10对应的带型编号为4+7,其中编号4对应的等位基因片段的条带大小为278~278.99bp,编号7对应的等位基因片段的条带大小为284~284.99bp;引物FfSSR11对应的带型编号为2+3,其中编号2对应的等位基因片段的条带大小为260~260.99bp,编号3对应的等位基因片段的条带大小为263~263.99bp;引物FfSSR13对应的带型编号为7+10,其中编号7对应的等位基因片段的条带大小为226~226.99bp,编号10对应的等位基因片段的条带大小为229~229.99bp;引物FfSSR15对应的带型编号为2+10,其中编号2对应的等位基因片段的条带大小为195~195.99bp,编号10对应的等位基因片段的条带大小为257~257.99bp;
所述金针菇徐金18菌种的保藏编号为GDMCC No:61514。
2.权利要求1所述的金针菇徐金18菌种的微卫星DNA标记指纹图谱的应用,其特征在于:所述金针菇徐金18菌种的微卫星DNA标记指纹图谱用于鉴定金针菇徐金18菌种的特异等位变异,和/或鉴定金针菇徐金18菌种的特异性。
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