[发明专利]从血液特异性靶向捕获人类基因组和转录组区域的方法

权利要求书

1.一种系统，其包括：

不同环状嵌合单链核酸构建体的集合，每个构建体包含：

来自宿主生物体的原始基因组DNA的第一单链区段和

连接至所述第一单链区段且包含对所述宿主生物体而言为外源性的核苷酸序列的第二单链核酸区段，所述核苷酸序列包含第一固体载体引物特异性部分、第二固体载体引物特异性部分和患者标识符序列，借此所述集合的所述嵌合单链核酸构建体是环化的且适于滚环扩增和/或测序；以及

延伸产物的集合，每个延伸产物包含两条或更多条串联线性序列，其中每个串联线性序列与来自所述集合的嵌合单链核酸构建体互补，其中所述集合中的每个延伸产物与所述集合的其互补环状嵌合单链核酸构建体杂交。

2.根据权利要求1所述的系统，其进一步包含：

固体载体，其上固定有多个第一寡核苷酸引物，每个第一寡核苷酸引物包含与所述集合的嵌合单链核酸构建体的第一固体载体引物特异性部分的核苷酸序列相同的核苷酸序列，其中所述固体载体上的多个第一寡核苷酸引物的一个或多个与所述延伸产物的集合的延伸产物杂交。

3.一种系统，其包括：

不同环状嵌合单链核酸构建体的集合，每个构建体包含：

来自宿主生物体的原始基因组DNA的第一单链区段和

连接至所述第一单链区段且包含对所述宿主生物体而言为外源性的核苷酸序列的第二单链核酸区段，所述核苷酸序列包含第一固体载体引物特异性部分、第二固体载体引物特异性部分和患者标识符序列，借此所述集合的所述嵌合单链核酸构建体适于滚环扩增和/或测序；

一个或多个寡核苷酸扩增引物，每个扩增引物包含至少第一核苷酸序列，其与所述集合的嵌合单链核酸构建体的一部分互补；以及

适用于滚环扩增的聚合酶。

4.根据权利要求3所述的系统，其中所述一个或多个寡核苷酸扩增引物包含与所述集合的嵌合单链核酸构建体的第二固体载体引物特异性部分互补的第一核苷酸序列，且所述一个或多个扩增引物被固定在固体载体上。

5.根据权利要求3所述的系统，其中所述一个或多个寡核苷酸扩增引物包含：(i)与所述集合的嵌合单链核酸构建体的第一固体载体引物特异性部分互补的第一核苷酸序列和(ii)与所述集合的嵌合单链核酸构建体的第二固体载体引物特异性部分互补的第二核苷酸序列。

6.根据权利要求3所述的系统，其中所述一个或多个寡核苷酸扩增引物包含(i)与所述集合的嵌合单链核酸构建体的原始基因组DNA区段互补的第一核苷酸序列，(ii)3’部分，其包含可裂解核苷酸或核苷酸类似物和阻断所述寡核苷酸扩增引物的3’聚合酶延伸的阻断基团和(iii)包含可裂解核苷酸或核苷酸类似物与捕获基团的5’部分，所述捕获基团能够固定到固体载体上。

7.根据权利要求3所述的系统，其中所述一个或多个寡核苷酸扩增引物包含：(a)第一寡核苷酸扩增引物，其具有(i)与所述集合的嵌合单链核酸构建体的原始基因组DNA区段的第一部分互补的第一核苷酸序列，和(ii)3’部分，其包含可裂解核苷酸或核苷酸类似物与阻断所述第一寡核苷酸扩增引物的3’聚合酶延伸的阻断基团，以及(b)第二寡核苷酸扩增引物，其具有(i)与所述集合的嵌合单链核酸构建体的原始基因组DNA区段的第二部分互补的第一核苷酸序列，和(ii)包含可裂解核苷酸或核苷酸类似物与捕获基团的5’部分，所述捕获基团能够固定到固体载体上。

8.根据权利要求3所述的系统，其中所述一个或多个扩增引物包含能够被拴系到固体载体上的部分。

9.根据权利要求3所述的系统，其进一步包含：

固体载体，其上固定有多个第一寡核苷酸引物，每个第一寡核苷酸引物包含与所述集合的嵌合单链核酸构建体的第一固体载体引物特异性部分的核苷酸序列相同的核苷酸序列。