[发明专利]一种建立于dCas9工程化修饰蛋白及生物膜层干涉技术基础上的检测核酸的方法在审
申请号: | 202110254546.X | 申请日: | 2021-03-09 |
公开(公告)号: | CN112852926A | 公开(公告)日: | 2021-05-28 |
发明(设计)人: | 高玉舟;乔善鹏;李海超;刘珍妮;何欣 | 申请(专利权)人: | 济南国科医工科技发展有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6837 | 分类号: | C12Q1/6837;C12Q1/6825;C12N9/22;C12N15/113 |
代理公司: | 济南誉丰专利代理事务所(普通合伙企业) 37240 | 代理人: | 薛鹏喜 |
地址: | 250000 山东省济南市高新区综合保税*** | 国省代码: | 山东;37 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 建立 dcas9 工程 修饰 蛋白 生物膜 干涉 技术 基础上 检测 核酸 方法 | ||
1.一种CRISPR-BLI检测芯片,其特征在于,包括:BLI感受器和固定在BLI感受器上的CRISPR探针;
所述CRISPR探针由biotin-dCas9-Halo功能化蛋白和sgRNA复合而成;所述biotin-dCas9-Halo功能化蛋白为dCas9-Halo蛋白经生物素定点修饰获得,dCas9-Halo蛋白的氨基酸序列如SEQ ID NO.4所示。
2.根据权利要求1所述的CRISPR-BLI检测芯片,其特征在于,所述sgRNA的序列如SEQID NO.6所示。
3.权利要求1或2所述的CRISPR-BLI检测芯片的制备方法,其特征在于,包括以下步骤:
(1)将编码dCas9和Halo标签的基因序列连接到表达载体上,获得重组表达质粒,并转化到大肠杆菌中进行原核表达,分离纯化得到dCas9-Halo蛋白;将dCas9-Halo蛋白进行生物素定点修饰,制备得到biotin-dCas9-Halo功能化蛋白;
(2)将biotin-dCas9-Halo功能化蛋白与sgRNA复合,制备得到CRISPR探针;
(3)将CRISPR探针固定在BLI感受器上,制备得到CRISPR-BLI检测芯片。
4.根据权利要求3所述的制备方法,其特征在于,步骤(1)中,编码dCas9的基因序列如SEQ ID NO.1所示;编码Halo标签的基因序列如SEQ ID NO.2所示。
5.根据权利要求3所述的制备方法,其特征在于,步骤(1)中,对dCas9-Halo蛋白进行生物素定点修饰的方法为:用pH=7.4的PBS缓冲液将dCas9-Halo蛋白超滤浓缩,使蛋白的终浓度大于或等于1mg/mL;向浓缩后的dCas9-Halo蛋白溶液中加入HaloTag@PGE-Bio tinLigand母液,混匀,室温反应30-90分钟,以pH=7.4的PBS缓冲液为流动相过除盐柱,除去未反应小分子,收集浓缩修饰后蛋白。
6.根据权利要求3所述的制备方法,其特征在于,步骤(2)中,biotin-dCas9-Halo功能化蛋白与sgRNA复合的方法为:将500μg biotin-dCas9-Halo功能化蛋白超滤浓缩至500~1000μL;取100-250μL的sgRNA加入到浓缩后的biotin-dCas9-Halo溶液中,混合均匀,在37℃条件下孵育复合15-30分钟。
7.根据权利要求3所述的制备方法,其特征在于,步骤(3)中,将CRISPR探针固定在BLI感受器上的方法为:将BLI感受器首先浸入平衡液1中平衡基线60-120秒,然后浸入CRISPR探针溶液中500-900秒,将CRISPR探针固定在BLI感受器上;
所述平衡液1为:含有5-50μg/ml肝素钠、0.1~0.01%BSA、0.01~0.05%Triton X-100、0.01~0.05%Tween-20、0.1~0.5mol/L NaCl、1~5mmol/L MgCl2、1~5mmol/ml EDTA和0.1~0.01%变性鲑鱼精DNA的0.1M PBS,pH=6.0-8.0。
8.权利要求1或2所述的CRISPR-BLI检测芯片在如下(1)或(2)中的应用:
(1)检测核酸;
(2)制备检测核酸的产品。
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