[发明专利]基于RAA-CRISPR-Cas13a技术检测乙型肝炎病毒DNA的试剂盒在审
申请号: | 202110200314.6 | 申请日: | 2021-02-23 |
公开(公告)号: | CN114959107A | 公开(公告)日: | 2022-08-30 |
发明(设计)人: | 任锋;李浩;田原;董雪;张向颖;徐玲;范子豪;曹亚玲;李伟华;陈德喜;段钟平 | 申请(专利权)人: | 首都医科大学附属北京佑安医院 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/6844;C12N15/11;C12N15/113;C12R1/93 |
代理公司: | 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 | 代理人: | 张立娜 |
地址: | 100069 北*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 基于 raa crispr cas13a 技术 检测 乙型肝炎 病毒 dna 试剂盒 | ||
1.用于检测乙型肝炎病毒DNA的成套引物组,由RAA引物对和crRNA组成;
所述RAA引物对是根据SEQ ID No.1所示核苷酸序列设计的;
所述crRNA包括锚定序列和向导序列,所述锚定序列能够与Cas蛋白结合,所述向导序列与所述RAA引物对的扩增产物序列相匹配。
2.根据权利要求1所述的成套引物组,其特征在于:所述RAA引物对为能够以乙型肝炎病毒DNA为模板扩增得到SEQ ID No.1的第13-134位所示DNA片段的引物对;和/或
所述crRNA中,所述锚定序列为SEQ ID No.10的第1-38位,所述向导序列为SEQ IDNo.10的第39-66位。
3.根据权利要求2所述的成套引物组,其特征在于:所述RAA引物对为由SEQ ID No.3和SEQ ID No.9所示的两条单链DNA组成的引物对;和/或
所述crRNA的核苷酸序列如SEQ ID No.10所示。
4.用于检测乙型肝炎病毒DNA的试剂盒,含有权利要求1-3中任一所述的成套引物组。
5.根据权利要求4所述的试剂盒,其特征在于:所述试剂盒还含有Cas13a蛋白。
6.根据权利要求5所述的试剂盒,其特征在于:所述Cas13a蛋白为LwCas13a蛋白。
7.根据权利要求4-6中任一所述的试剂盒,其特征在于:所述试剂盒中还包括1)RAA反应试剂或RPA反应试剂;和/或,2)NTP、T7 RNA聚合酶、RNA酶抑制剂、报告RNA。
8.如下任一物质:
P1、权利要求1-3任一中所述的RAA引物对;
P2、权利要求1-3任一中所述的crRNA;
P3、权利要求1-3任一中所述的crRNA和Cas蛋白,或者二者形成的复合体。
9.权利要求1-3中任一所述的成套引物组或权利要求4-7中任一所述的试剂盒或权利要求8所述物质在如下任一中的应用:
Q1、制备用于检测乙型肝炎病毒DNA的产品,或检测乙型肝炎病毒DNA;
Q2、制备用于检测或辅助检测待测样本中是否含有乙型肝炎病毒DNA的产品,或检测或辅助检测待测样本中是否含有乙型肝炎病毒DNA;
Q3、制备用于筛查目标个体是否携带乙型肝炎病毒的产品,或筛查目标个体是否携带乙型肝炎病毒;
Q4、制备用于诊断乙型肝炎的产品,或诊断乙型肝炎;
Q5、制备用于筛选或辅助筛选乙型肝炎病毒防治药物的产品,或筛选或辅助筛选乙型肝炎病毒防治药物。
10.一种检测或辅助检测待测样本中是否含有乙型肝炎病毒DNA的方法,包括如下步骤:
(a1)从待测样本中提取DNA;
(a2)以(a1)提取的DNA为模板,采用权利要求1-3任一中所述的RAA引物对进行RAA扩增或RPA扩增,得到扩增产物;
(a3)取(a2)所得扩增产物,加入NTP、T7 RNA聚合酶、RNA酶抑制剂、报告RNA、权利要求5或6中所述的Cas蛋白和权利要求1-3任一中所述的crRNA,形成反应体系;将所述反应体系进行CRISPR反应检测,读取检测信号,根据检测信号按照如下确定检测结果:
若所述反应体系的检测信号为阳性,则所述待测样本中含有或候选含有乙型肝炎病毒DNA;若所述反应体系的检测信号为阴性,则所述待测样本中不含有或候选不含有乙型肝炎病毒DNA。
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