[发明专利]一套用于水稻品种籼粳鉴定的SNP标记、引物组、试剂盒及应用

权利要求书

1.一套用于水稻品种籼粳鉴定的SNP标记，其特征在于，由40个SNP位点组成，所述SNP位点的物理位置是基于日本晴的全基因组序列MSU7.0版本确定，所述SNP位点的信息如下：

2.权利要求1所述的用于水稻品种籼粳鉴定的SNP标记在水稻品种籼粳鉴定中的应用。

3.根据权利要求2所述的应用，其特征在于，根据所述40个SNP的分型结果，通过计算粳型指数I_g进行水稻品种籼粳鉴定，I_g值在(1，0.5)时，水稻待鉴定品种鉴定为粳稻；I_g值在0.5时，水稻待鉴定品种鉴定为中间型；I_g值在(0.5，0)时，水稻待鉴定品种鉴定为籼稻；

所述粳型指数I_g的计算公式如式(Ⅰ)：

式中：

SNP_x——籼型SNP的数目；

SNP_g——粳型SNP的数目；

SNP_xg——杂合型SNP的数目。

4.权利要求1所述的用于水稻品种籼粳鉴定的SNP标记的引物组，其特征在于，包括序列如SEQ ID NO.1～120所示的引物。

5.根据权利要求4所述的引物组，其特征在于，每个SNP位点检测包括3条引物，分别为正向引物F1、正向引物F2和反向引物R；所述SEQ ID NO.1～120所示的引物与检测的SNP位点的对应关系如下：

6.根据权利要求4所述的引物组，其特征在于，每个SNP位点的正向引物F1的5’端加上SEQ ID NO.121接头序列；每个SNP位点的正向引物F2的5’端加上SEQ ID NO.122接头序列。

7.权利要求4～6任一项所述的引物组在水稻品种籼粳鉴定中的应用。

8.一种用于水稻品种籼粳鉴定的试剂盒，其特征在于，包括权利要求4～6任一项所述的引物组。

9.根据权利要求8所述的试剂盒，其特征在于，还包括2×KASP反应混合液和水。

10.权利要求8或9所述的试剂盒在水稻品种籼粳鉴定中的应用。