[发明专利]一组神经胶质瘤分子分型及预后标志物

说明书

本发明属生物和医学检验领域，涉及一组用于神经胶质瘤分子分型、恶性分级及预后评估的肿瘤标志物及应用；所涉及的基因包括：ACVR1、BAX、BCL10、BMP8B、CANT1、CDH10、CDH12、CDK11B、CTSA、CXCR4、GDF15、IFITM3、ITGA1、ITGA3、ITGA4、ITGA11、ITGB1、ITGB1BP1、ITGB2、ITGB3BP、JUN、JUNB、LIF、NRG3、POU5F1、PRDM1、ROR2、STAT3、WNT5A、GDF15等30个基因。所述基因(单独或任意组合)产物(蛋白、RNA)表达量，用以对神经胶质瘤进行分子分型、药物筛选、恶性分级及病人总体生存期预测等。所涉及的标志物可直接应用，也可与WHO病理分级、1p19q突变状态等相结合。

技术领域

本发明属生物和医学检验领域，涉及一组用于神经胶质瘤分子分型、恶性分级及预后评估的肿瘤标志物及应用；所涉及的基因包括：ACVR1、BAX、BCL10、BMP8B、CANT1、CDH10、CDH12、CDK11B、CTSA、CXCR4、GDF15、IFITM3、ITGA1、ITGA3、ITGA4、ITGA11、ITGB1、ITGB1BP1、ITGB2、ITGB3BP、JUN、JUNB、LIF、NRG3、POU5F1、PRDM1、ROR2、STAT3、WNT5A、GDF15等30个基因。所述标志物包括上述基因产物(蛋白、RNA)，通过利用上述基因(单个或任意组合)表达量改变，来对神经胶质瘤进行分子分型、靶向药物筛选、恶性分级及病人总体生存期预测。

背景技术

神经胶质瘤(Glioma)是对人类健康和生命威胁最大的恶性肿瘤之一，按病理形态学特征WHO将神经胶质瘤分为：WHO II、WHO III、WHO IV(胶质母细胞瘤，GBM)三型^[1，2]。WHO病理分级是神经胶质瘤分级的经典，但这种分类方法耗时长，而且对病人预后的判断并不太好^[1，2]。尤其是对较低级别胶质瘤(lower grade glioma，LGG，包括WHO II、WHO III)，它们在病理组织学上非常接近，但预后却千差万别，从几个月到十年以上^[1，2]。1p和19q基因突变(合称1p19q-codel)的神经胶质瘤对多种治疗敏感，病人预后好。因而，1p19q突变与否(1p19q-codel还是1p19q-noncodel)是评估神经胶质瘤预后的重要指标，尤其是对低级别神经胶质瘤病人的预后评估^[1，2]。

分子生物学技术具有快速、微量、高通量、客观等巨大优势。因而，用分子生物学方法对肿瘤进行分子分型、恶性分级及预后评估是未来的发展方向。而且分子生物学上的改变可能对应着功能学上的改变，分子分型有利于肿瘤的靶向治疗。但用于肿瘤分子分型、恶性分级及预后评估的有效标志物还有待进一步发掘。

生物信息学的目的是通过开放数据库，加快人类对肿瘤的认识，早日攻克肿瘤，造福人类。文献报道：睾丸抗原在肿瘤中广发表达^[3]。我们前期研究发现：肿瘤的胚胎/生殖细胞特性在肿瘤的恶性行为中具有至关重要的作用^[4-6]。在本发明中，我们利用“中国脑胶质瘤基因组图谱数据库(CGGA)”这个生物信息数据库，在神经胶质瘤中对与胚胎/生殖细胞发育轴相关的基因表达谱做大规模筛查后，寻找到一组分子生物学指标，包括ACVR1、BAX、BCL10、BMP8B、CANT1、CDH10、CDH12、CDK11B、CTSA、CXCR4、GDF15、IFITM3、ITGA1、ITGA3、ITGA4、ITGA11、ITGB1、ITGB1BP1、ITGB2、ITGB3BP、JUN、JUNB、LIF、NRG3、POU5F1、PRDM1、ROR2、STAT3、WNT5A、GDF15等30个基因。