[发明专利]一组肺癌标志物及应用

说明书

本发明属生物和医学检验领域，涉及检测肿瘤相关基因(单个或任意组合)产物表达量改变来鉴别肺癌变、肺癌分类/型、预后评估等的一种分子生物学方法。所涉及的基因包括：FAM83A，LOC84740，SPINK1，CST1，SERPINB5，CRABP2，MMP1，XAGE1D，GPX2，TMPRSS4，GREM1，COL10A1，MMP10，GRHL3，GJB2，B3GNT3，TROAP，MYBL2，CALML3，SERPINB13，S100A7，RHCG，FOXE1，KRT6C，KRT13，SPRR1A，SPRR2D，ERO1L，STEAP1，ANLN，CASC5，PKMYT1，HMMR，TFAP2A，RRM2，CCNA2，VRK1，TRIM58，HIGD1B等39个基因。上述基因的联合应用有利于肺癌的鉴定、分类/型、预后评估等，尤其是在非小细胞肺癌的鉴别中，在特异性大于99％时，灵敏度可达97％。在肺腺癌和肺鳞癌的区分上，特异性和灵敏度都超过90％。本发明为肺癌的鉴别、分类及预后评估，提供了一种快速、客观、可靠的方法。

技术领域

本发明属生物和医学检验领域，涉及检测肿瘤相关基因谱(单个或任意组合)表达量(蛋白质、RNA)改变来鉴别肺癌变、肺癌类型、分子分型及预后评估等的一种分子生物学方法。所涉及的基因包括：FAM83A，LOC84740，SPINK1，CST1，SERPINB5，CRABP2，MMP1，XAGE1D，GPX2，TMPRSS4，GREM1，COL10A1，MMP10，GRHL3，GJB2，B3GNT3，TROAP，MYBL2，CALML3，SERPINB13，S100A7，RHCG，FOXE1，KRT6C，KRT13，SPRR1A，SPRR2D，ERO1L，STEAP1，ANLN，CASC5，PKMYT1，HMMR，TFAP2A，RRM2，CCNA2，VRK1，TRIM58，HIGD1B等39个基因。

背景技术

肺癌无论是发病率还是死亡率均增长极快，是威胁人类健康和生命的最大的恶性肿瘤之一。目前，肺癌在男性中的发病率和死亡率均高居肿瘤榜首；女性中肺癌的发病率居所有肿瘤发病率的榜首，死亡率居第二位。迄今为止，肺癌的早期诊断、分子分型、预后评估是尽早发现肺癌、根据分子分型采取相应的个性化精准治疗是目前对抗肺癌的有力手段。病理形态学是诊断肺癌的金标准，然而病理形态上出现明显改变时，肺癌常已处于中晚期阶段。通常在癌变初期，就已伴随着分子生物学上的改变，因而分子生物学指标有望成为肺癌早期诊断的重要标志物。在本发明中，我们拟提供一种基于肿瘤标志物谱以对肺癌进行鉴别、组织分类、分子分型及预后评估的分子学方法。本发明中，我们对与肺癌相关的肿瘤标志物做大规模筛查后，寻找到一组相关基因，包括FAM83A，LOC84740，SPINK1，CST1，SERPINB5，CRABP2，MMP1，XAGE1D，GPX2，TMPRSS4，GREM1，COL10A1，MMP10，GRHL3，GJB2，B3GNT3，TROAP，MYBL2，CALML3，SERPINB13，S100A7，RHCG，FOXE1，KRT6C，KRT13，SPRR1A，SPRR2D，ERO1L，STEAP1，ANLN，CASC5，PKMYT1，HMMR，TFAP2A，RRM2，CCNA2，VRK1，TRIM58，HIGD1B等39个基因。与正常肺组织相比，上述基因产物(RNA，蛋白)在癌变肺组织中的表达量极度改变，并与肺癌的类型、预后等具有紧密联系。上述基因的联合应用有利于肺癌的鉴定、分型和预后评估，尤其是在非小细胞肺癌中。对非小细胞肺癌的检出上，在特异性大于99％时，灵敏度可达97％。在肺腺癌和肺鳞癌的区分上，特异性和灵敏度都超过90％。

基于现有技术的研究基础与现状，本申请的发明人拟提供一种用于肺癌鉴别、组织分型及预后评估的一种方法。本发明涉及通过上述基因组(单个或二种及以上任意组合)在肺癌变组织中的表达量改变，来辅助肺癌鉴别、分类、分子分型及预后评估等。尤其是通过多种肿瘤标志物联合形成阵列，再与提取、检测肺病变组织中蛋白质(如免疫比浊、胶体金、免疫化学发光等)或RNA(如RT-PCR、荧光定量PCR、RNA array、RNA Sequencing等)相结合，可以为肺癌的预测、分类、分子分型及预后评估等提供一种快速、高通量、有效、客观的方法。

发明内容