[发明专利]一组肺癌标志物及应用在审
申请号: | 202011522014.1 | 申请日: | 2020-12-21 |
公开(公告)号: | CN114645092A | 公开(公告)日: | 2022-06-21 |
发明(设计)人: | 刘春芳;马展 | 申请(专利权)人: | 复旦大学附属华山医院 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;G01N33/574 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 200040 上*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一组 肺癌 标志 应用 | ||
1.一种辅助肺癌鉴别、分类、分子分型及预后评估等的分子生物学方法,所述方法涉及的基因是:FAM83A,LOC84740,SPINK1,CST1,SERPINB5,CRABP2,MMP1,XAGE1D,GPX2,TMPRSS4,GREM1,COL10A1,MMP10,GRHL3,GJB2,B3GNT3,TROAP,MYBL2,CALML3,SERPINB13,S100A7,RHCG,FOXE1,KRT6C,KRT13,SPRR1A,SPRR2D,ERO1L,STEAP1,ANLN,CASC5,PKMYT1,HMMR,TFAP2A,RRM2,CCNA2,VRK1,TRIM58,HIGD1B等39个基因,所述的癌变筛查、病理分类、分子分型及预后与上述基因产物(蛋白、RNA)在肺组织癌变前后出现表达量改变相关,可用于预测肺是否发生癌变、癌症分类、分子分型、耐药性、药物筛选、肿瘤恶性程度、病人预后评估等;
S1单独利用上述基因表达量改变来预测肺癌变、癌症分类、分子分型、肿瘤恶性程度、病人预后等;
S2联合上述基因(2个及2个以上的任意组合)表达量改变来预测肺癌变、癌症分类、分子分型、肿瘤恶性程度、病人预后等;
S3上述单个基因或任意组合后再与其它指标相结合后,来预测肺癌变、癌症分类、分子分型、肿瘤恶性程度、病人预后等。
2.权利要求1、2所述的用途,其特征在于,所述检测对象包括:肺病变组织(包括癌变、增生、癌前病变等)、体液(包括血液、尿液、穿刺液等)、穿刺组织等,上述基因表达量改变的检测,作为预测肺癌变、组织分型、肿瘤恶性程度、靶向药物筛选、转移能力、分子分型、生存期等预后评估指标。
3.权利要求1所述的用途,其特征在于,所述检测基因表达产物包括:蛋白质和RNA;既包括肿瘤细胞中的,也包括各种原因进入体液中的游离的RNA、蛋白及外泌体中的RNA、蛋白,包括完整和片段(RNA、蛋白)。
4.权利要求1所述的用途,其特征在于,所述本发明所涉及的血液包括全血、血清、血浆、分离有核细胞、血液中的循环肿瘤细胞、血液中的外泌体等。
5.权利要求1所述的用途,其特征在于所述的蛋白浓度检测包括直接提取肺病变组织蛋白经化学或免疫学方法进行检测和免疫组化分析,所述的RNA浓度检测包括直接提取肺病变组织RNA。
6.权利要求1,3,5所述的用途,其特征在于,所述基因的检测包括:基因表达的检测(包括蛋白水平和RNA水平,检测方法涉及:免疫组化、免疫荧光、Western blot、ELISA、流式细胞术检测、RT-PCR、免疫学检测、胶体金、化学法检测、荧光定量PCR、RNA Sequencing、RNAarray等检测技术,但不仅限于这些技术)等。
7.权利要求1所述的用途,其特征在于,所述恶性分级及预后判断包括:肿瘤类型、分子分型、恶性程度、转移能力、耐药性、靶向药物的选择、生存期评估等。
8.权利要求1所述的用途,其特征在于,可以直接检测上述基因的绝对量;也可以和正常组织(包括癌旁组织)的比值,来预测肺癌变、肿瘤类型、分子分型、恶性程度、转移能力、耐药性、生存期等恶性指标的评估,以及对肿瘤进行分子分型等。
9.权利要求1、6所述的用途,其特征在于所述的RT-PCR检测上述基因的RNA产物,逆转录后,涉及到PCR包括:普通PCR、荧光定量PCR、巢式PCR、多重PCR、数字PCR、芯片微阵列等。
10.权利要求1所述的用途,其特征在于通过上述基因的组合应用形成肿瘤标志物矩阵(芯片)模式,以提高肺癌预测、分型和预后判断的效率。
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