[发明专利]蛹虫草菌活性RT-PCR检测引物和检测方法在审
申请号: | 202011444356.6 | 申请日: | 2020-12-11 |
公开(公告)号: | CN112501340A | 公开(公告)日: | 2021-03-16 |
发明(设计)人: | 潘中华;徐世清;司马扬虎;殷为民;陈玉华;张怀松 | 申请(专利权)人: | 南通纺织丝绸产业技术研究院;苏州大学 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12Q1/686;C12N15/11 |
代理公司: | 苏州市中南伟业知识产权代理事务所(普通合伙) 32257 | 代理人: | 王玉仙 |
地址: | 226300 江苏省南通市高*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 虫草 活性 rt pcr 检测 引物 方法 | ||
本发明公开了一种蛹虫草菌活性RT‑PCR检测引物和检测方法,属于分子检测和鉴定技术领域。本发明引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.1、SEQ ID NO.2所示。采用所述特异性引物SEQ ID NO.1、SEQ ID NO.2可有效地扩增蛹虫草菌的过氧化氢酶基因片段,片段大小341bp,用于RT‑PCR方法检测。检测结果采用2‑ΔΔCT统计分析,与对照菌株相比,样品值/对照值为判断标准,比值大于或者等于1,该菌种可用于生产;0.1比值1,菌种活性较弱,使用时应谨慎;比值1/10时,该菌株基本不能用于蚕蛹虫草和虫草花的生产,检测结果能够预示蛹虫草菌的相对活性,为生产上菌种筛选提供技术依据。
技术领域
本发明涉及一种蛹虫草菌活性RT-PCR检测引物和检测方法,属于分子检测和鉴定技术领域。
背景技术
蛹虫草菌(Cordyceps militaris(L.)Link)属子囊菌亚门真菌,分离于野生蛹虫草菌,可用于生产虫草子实体和蚕蛹虫草,产品已被证明有多种功效。目前在中国、韩国等一些亚洲国家生产。随着生产技术的成熟和市场规模的扩大,制约虫草产业的问题很多,其中菌种活性不稳定影响生产是一个重要原因,不少生产企业因为菌种退化而造成生产损失,增加生产风险。Shrestha,B.等认为,虫草菌移植到F1和F2代,子实体和活性发生下降。生产企业目前普遍采用小规模栽培试验来鉴定菌种,非常费时费力。
随着分子鉴定技术的发展,虫草菌全基因序列已经公布,为开展多方面鉴定菌种活性奠定基础。较早研究虫草菌菌种活性差异的是利用RAPD,比较活性较好的菌株和活性较差的菌株试验,但这种方法存在很多缺点,不适合应用,但阐明了部分基因发生突变和表达功能减弱。Xiong,C.等利用转基因技术增强蛹虫草菌的抗氧化能力来延缓虫草菌的变性;林清泉等根据菌种产物的酸碱性判定菌种的活性,认为活性强的菌株分泌酸性物质,活性弱的菌株分泌能力减弱,酸性降低,用指示剂可以判定菌株的活性,他还研究了脱氢酶活性来判定菌种活性的方法;上海农科院报道了PCR判定菌株是否为虫草菌,未涉及活性判定。目前还没有一种快速有效的检测蛹虫草菌活性的方法。
发明内容
为解决上述技术问题,本发明以蛹虫草菌过氧化氢酶基因片段为检测靶标,提供检测引物和采用RT-PCR检测方法和检测工艺应用于蛹虫草菌活性检测。
本发明的第一个目的是提供一种蛹虫草菌活性RT-PCR检测引物,所述的检测引物核苷酸序列如SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2所示。
本发明的第二个目的是提供一种蛹虫草菌活性RT-PCR检测试剂盒,所述的试剂盒内包括所述的蛹虫草菌活性RT-PCR检测引物。
进一步地,所述的试剂盒内还包括RT-PCR缓冲液、脱氧三磷酸核苷、ddH2O、DNA聚合酶和cDNA合成反应体系。
进一步地,所述的cDNA合成反应体系包括通用引物(Oligo Primer)、脱氧三磷酸核苷、RT-PCR缓冲液、RNA酶抑制剂、逆转录酶和RNase free水。
本发明的第三个目的是提供一种蛹虫草菌活性RT-PCR检测方法,包括如下步骤:
S1、提取待检测样品RNA;
S2、将待检测样品RNA加入cDNA合成反应体系中,进行cDNA合成;
S3、将合成的cDNA加入到RT-PCR反应体系中进行RT-PCR反应,与对照进行比较,检测蛹虫草菌株活性。
进一步地,cDNA合成反应体系中,各成分含量如下:
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