[发明专利]一种细胞计数方法、装置、计算机设备及可读存储介质在审
申请号: | 202011427461.9 | 申请日: | 2020-12-07 |
公开(公告)号: | CN112489027A | 公开(公告)日: | 2021-03-12 |
发明(设计)人: | 高楠楠;刘小晴;刘昌灵;张亚军;凌少平 | 申请(专利权)人: | 志诺维思(北京)基因科技有限公司 |
主分类号: | G06T7/00 | 分类号: | G06T7/00;G06T7/11;G06T7/187;G06K9/00;G06K9/62 |
代理公司: | 北京超凡宏宇专利代理事务所(特殊普通合伙) 11463 | 代理人: | 荣颖佳 |
地址: | 102200 北京市昌平区*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 细胞 计数 方法 装置 计算机 设备 可读 存储 介质 | ||
1.一种细胞计数方法,其特征在于,所述细胞计数方法包括:
将通过三目光学显微镜上的专业显微拍摄仪或通过显微镜目镜、利用其他外在拍摄设备拍摄的第一细胞染色图像输入至训练好的颜色分离模型中,并针对不同细胞类别,获取所述细胞染色图像的多张二值图像;其中,所述二值图像中包括多个第一连通量;
确定所述二值图像对应的距离图像包括的多个峰值点,以及每个所述第一连通量包括的峰值点个数;
选取包括多个所述峰值点的第二连通量,并对所述第二连通量进行分割处理,确定所述第二连通量中包括的细胞个数;
基于所述第二连通量中包括的细胞个数,以及所述二值图像对应的细胞类别,确定该细胞类别对应的细胞总数。
2.根据权利要求1所述的细胞计数方法,其特征在于,通过以下方法对所述颜色分离模型进行训练:
获取第一细胞染色图像样本,并将所述细胞染色图像样本输入至颜色空间模型中,得到在目标颜色空间中的第二细胞染色图像样本;
对所述第二细胞染色图像样本进行无监督机器学习,基于预设的聚类中心特征,得到多个颜色特征聚类,当每个所述颜色特征聚类中各个样本特征的相似度满足预设的相似度阈值时,完成训练,得到训练好的颜色分离模型。
3.根据权利要求1所述的细胞计数方法,其特征在于,所述将通过三目光学显微镜上的专业显微拍摄仪或通过显微镜目镜、利用其他外在拍摄设备拍摄的第一细胞染色图像输入至训练好的颜色分离模型中,并针对不同细胞类别,获取所述细胞染色图像的多张二值图像,包括:
获取第一细胞染色图像,并将所述第一细胞染色图像输入至颜色空间模型中,得到在目标颜色空间中的第二细胞染色图像;
将所述第二细胞染色图像输入至训练好的颜色分离模型中,分离出所述第二细胞染色图像中各像素位置对应的细胞类别;
基于所述第二细胞染色图像中各像素位置对应的细胞类别,生成对应不同细胞类别的多张二值图像。
4.根据权利要求1所述的细胞计数方法,其特征在于,所述确定所述二值图像对应的距离图像包括的多个峰值点,以及每个第一连通量包括的峰值点个数,包括:
对所述二值图像进行距离变换,得到二值图像对应的距离图像,确定所述距离图像包括的多个峰值点,以及每个峰值点对应的像素位置;
基于每个峰值点对应的像素位置,以及每个第一连通量对应的像素位置,确定每个第一连通量包括的峰值点个数。
5.根据权利要求1所述的细胞计数方法,其特征在于,所述对所述第二连通量进行分割处理,确定所述第二连通量中包括的细胞个数,包括:
根据预设的收缩距离阈值,对大于所述收缩距离阈值的第三连通量进行收缩处理,得到多个第四连通量;
对所述第四连通量进行距离变换,确定每个第四连通量包括的峰值点个数;
选取包括多个峰值点的第五连通量,并对所述第五连通量进行收缩处理,直至得到多个包括一个峰值点的第六连通量,确定所述第六连通量的个数为所述第二连通量中包括的细胞个数。
6.根据权利要求5所述的细胞计数方法,其特征在于,通过以下方法确定收缩距离阈值:
基于所述二值图像对应的距离图像,确定每个第三连通量对应的距离值,构建包括多个距离值的距离列表;
从所述距离列表中,选取不小于预设距离阈值的最小值为所述收缩距离阈值。
7.根据权利要求1所述的细胞计数方法,其特征在于,还包括:
基于不同细胞类别对应的细胞总数,确定不同细胞类别的占比情况。
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