[发明专利]可检测多囊卵巢综合征的生物标志物及其用途

说明书

本发明公开了一种基于肠道菌群的多囊卵巢综合征(PCOS)生物标志物组合包含如下的微生物之一或其组合栖粪杆菌属(Faecalibacterium)、放线菌属(Actinomyces)、琥珀酸单胞菌属(Butyricicoccus)、丁酸梭菌属(Butyricicoccus)和链球菌属(Streptococcus)，应用于多囊卵巢综合征(PCOS)经中医药治疗预后预测。

技术领域

本发明属于生物医药技术领域，具体涉及一种肠道菌群标志物，及其在应用于监测多囊卵巢综合征经中医药治疗效果。

背景技术

多囊卵巢综合征(polycystic ovarian syndrome，PCOS)是异质性内分泌疾病，主要特点是垂体前叶促黄体生成素分泌过多和卵泡刺激素分泌不足、高胰岛素和胰岛素抵抗以及雄激素分泌过多。PCOS是导致不孕的主要原因，也是女性生殖障碍疾病研究的重点。PCOS至今病因仍不明确，限制了治疗方法的发展。

近期研究发现PCOS与肠道菌群密切相关，研究结果表明PCOS患者的肠道菌群与健康对照人群存在差异性，与健康女性相比，PCOS患者肠道微生物的多样性降低，且PCOS患者肠道中普通拟杆菌(Bacteroides vulgatus)的丰度显著增高。PCOS治疗方法在近些年已有不少改进，出现了很多新型药物和疗法，但仍没有取得突破性进展，临床上仍有部分PCOS患者存在西医和中医治疗均未见疗效好转情况。并且不同亚型的PCOS患者临床表征不同，患病程度不同，治疗方案亦有所差异，根据不同分型的PCOS患者应采取个性化治疗方案。现已有微生物制剂应用于部分内分泌疾病辅助治疗，如缓解代谢综合征和预防肥胖症患者的妊娠糖尿病，但在PCOS治疗中还未有关于微生物治疗相关研究。虽然，部分医务人员或学者提出了一些设想，或进行了一些有益的探索，但是截至到目前，依然尚未有一种较为准确、高效的方法，能够实现快速识别、诊断进而有效地治疗多囊卵巢综合征的目的。因此，筛选出与多囊卵巢综合征治疗疗效相关性高的生物标志物，利用该标志物监测治疗效果的技术方案，具有极高的临床价值。

发明内容

本发明的目的在于从肠道菌群角度提供一种多囊卵巢综合征的预后预测方法，为多囊卵巢综合征治疗疗效监测提供参考。

本发明采用以下技术方案来实现：

一种基于肠道菌群的多囊卵巢综合征生物标志物组合，该生物标志物组合用于提供相对丰度信息，其包含以下的多种：栖粪杆菌属(Faecalibacterium)、放线菌属(Actinomyces)、琥珀酸单胞菌属(Butyricicoccus)、丁酸梭菌属(Butyricicoccus)和链球菌属 (Streptococcus)。

所述的生物标志物组合提供的相对丰度信息用于和参考值进行比较。

所述的生物标志物1～5的相对丰度信息是基于能够对其进行相对丰度计算来提供的。

所述的基于肠道菌群的多囊卵巢综合征生物标志物组合用于治疗效果监测应用，所述的基于肠道菌群的多囊卵巢综合征生物标志物的筛选方法，步骤如下：

1)样本收集：收集初诊未经治疗的多囊卵巢综合征病人粪便样品迅速转移到-80℃保存，根据3个月中医药治疗疗效将粪便样品分为治疗有效组和治疗无效组，提取DNA进行测序。

2)16s rDNA测序：取质量合格的基因组DNA样品及对应的融合引物配置PCR反应体系，设置PCR反应参数进行PCR扩增，使用Agencourt AMPure XP磁珠对PCR扩增产物进行纯化并溶于Elution Buffer，完成建库。使用Agilent 2100 Bioanalyzer对文库的片段范围及浓度进行检测。利用HiSeq平台进行测序。测将reads拼接成Tags再聚类成OTU并与数据库比对、物种注释；基于OTU和注释结果进行样品物种复杂度分析，组间物种差异分析等；