[发明专利]位于花生FAD2A基因启动子区与花生油酸和亚油酸含量相关的SNP分子标记及其应用有效

专利信息
申请号: 202011034365.8 申请日: 2020-09-27
公开(公告)号: CN112063746B 公开(公告)日: 2022-05-17
发明(设计)人: 周小静;姜慧芳;黄莉;罗怀勇;刘念;陈伟刚 申请(专利权)人: 中国农业科学院油料作物研究所
主分类号: C12Q1/6895 分类号: C12Q1/6895;C12Q1/6809;C12N15/11
代理公司: 北京路浩知识产权代理有限公司 11002 代理人: 孙怡
地址: 430062 湖北省武汉市武昌*** 国省代码: 湖北;42
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摘要:
搜索关键词: 位于 花生 fad2a 基因 启动 子区 油酸 含量 相关 snp 分子 标记 及其 应用
【权利要求书】:

1.与花生油酸和亚油酸含量相关的SNP分子标记,其特征在于,所述SNP分子标记为SNPC-E,位于花生FAD2A基因启动子区,所述SNPC-E位于SEQ ID NO.1所示序列的第13位,其多态性形式为G/A;当所述SNPC-E的多态性位点的基因型为GG时,对应于花生油酸含量数值低,亚油酸含量数值高,当所述SNPC-E的多态性位点的基因型为AA时,对应于花生油酸含量数值高,亚油酸含量数值低。

2.根据权利要求1所述的SNP分子标记,其特征在于,SNP分子标记SNPC-E位于花生FAD2A基因转录起始位置ATG上游713bp处。

3.用于扩增权利要求1或2所述的SNP分子标记的引物。

4.根据权利要求3所述的引物,其特征在于,包括如SEQ ID NO.2和SEQ ID NO.3所示的引物。

5.权利要求3或4所述的引物的以下任一应用:

(1)在鉴定花生油酸、亚油酸含量性状表型中的应用;

(2)在花生种质资源鉴定、改良或分子标记辅助育种中的应用;

(3)在花生油酸、亚油酸含量性状早期预测中的应用;

(4)在筛选或创制花生油酸、亚油酸含量性状不同的花生中的应用;

(5)在花生油酸、亚油酸含量基因分型中的应用;

(6)在鉴定花生FAD2A基因表达量中的应用。

6.鉴定花生油酸、亚油酸含量高低的方法,其特征在于,包括:

(1)提取待鉴定花生的DNA;

(2)以DNA为模板,利用SEQ ID NO.2和SEQ ID NO.3所示引物进行PCR扩增;

(3) 分析PCR扩增产物中权利要求1或2所述的SNP分子标记的基因型,根据所述基因型判断待鉴定花生油酸、亚油酸含量高低。

7.根据权利要求6所述的方法,其特征在于,步骤(3)中所述判断待鉴定花生油酸、亚油酸含量高低的方法如下:

当所述SNPC-E的多态性位点的基因型为GG时,则待鉴定花生的油酸含量数值低,亚油酸含量数值高,当所述SNPC-E的多态性位点的基因型为AA时,则待鉴定花生的油酸含量数值高,亚油酸含量数值低。

8.鉴定花生FAD2A基因表达量高低的方法,其特征在于,包括:

(1)提取待鉴定花生的DNA;

(2)以DNA为模板,利用SEQ ID NO.2和SEQ ID NO.3所示引物进行PCR扩增;

(3) 分析PCR扩增产物中权利要求1或2所述的SNP分子标记的基因型,根据所述基因型判断待鉴定花生FAD2A基因表达量高低。

9.根据权利要求8所述的方法,其特征在于,步骤(3)中所述判断待鉴定花生FAD2A基因表达量高低的方法如下:

当所述SNPC-E的多态性位点的基因型为GG时,则待鉴定花生的FAD2A基因表达量低;当所述SNPC-E的多态性位点的基因型为AA时,则待鉴定花生的FAD2A基因表达量高。

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