[发明专利]位于花生FAD2A基因启动子区与花生油酸和亚油酸含量相关的SNP分子标记及其应用有效
申请号: | 202011034365.8 | 申请日: | 2020-09-27 |
公开(公告)号: | CN112063746B | 公开(公告)日: | 2022-05-17 |
发明(设计)人: | 周小静;姜慧芳;黄莉;罗怀勇;刘念;陈伟刚 | 申请(专利权)人: | 中国农业科学院油料作物研究所 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12Q1/6809;C12N15/11 |
代理公司: | 北京路浩知识产权代理有限公司 11002 | 代理人: | 孙怡 |
地址: | 430062 湖北省武汉市武昌*** | 国省代码: | 湖北;42 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 位于 花生 fad2a 基因 启动 子区 油酸 含量 相关 snp 分子 标记 及其 应用 | ||
1.与花生油酸和亚油酸含量相关的SNP分子标记,其特征在于,所述SNP分子标记为SNPC-E,位于花生FAD2A基因启动子区,所述SNPC-E位于SEQ ID NO.1所示序列的第13位,其多态性形式为G/A;当所述SNPC-E的多态性位点的基因型为GG时,对应于花生油酸含量数值低,亚油酸含量数值高,当所述SNPC-E的多态性位点的基因型为AA时,对应于花生油酸含量数值高,亚油酸含量数值低。
2.根据权利要求1所述的SNP分子标记,其特征在于,SNP分子标记SNPC-E位于花生FAD2A基因转录起始位置ATG上游713bp处。
3.用于扩增权利要求1或2所述的SNP分子标记的引物。
4.根据权利要求3所述的引物,其特征在于,包括如SEQ ID NO.2和SEQ ID NO.3所示的引物。
5.权利要求3或4所述的引物的以下任一应用:
(1)在鉴定花生油酸、亚油酸含量性状表型中的应用;
(2)在花生种质资源鉴定、改良或分子标记辅助育种中的应用;
(3)在花生油酸、亚油酸含量性状早期预测中的应用;
(4)在筛选或创制花生油酸、亚油酸含量性状不同的花生中的应用;
(5)在花生油酸、亚油酸含量基因分型中的应用;
(6)在鉴定花生FAD2A基因表达量中的应用。
6.鉴定花生油酸、亚油酸含量高低的方法,其特征在于,包括:
(1)提取待鉴定花生的DNA;
(2)以DNA为模板,利用SEQ ID NO.2和SEQ ID NO.3所示引物进行PCR扩增;
(3) 分析PCR扩增产物中权利要求1或2所述的SNP分子标记的基因型,根据所述基因型判断待鉴定花生油酸、亚油酸含量高低。
7.根据权利要求6所述的方法,其特征在于,步骤(3)中所述判断待鉴定花生油酸、亚油酸含量高低的方法如下:
当所述SNPC-E的多态性位点的基因型为GG时,则待鉴定花生的油酸含量数值低,亚油酸含量数值高,当所述SNPC-E的多态性位点的基因型为AA时,则待鉴定花生的油酸含量数值高,亚油酸含量数值低。
8.鉴定花生FAD2A基因表达量高低的方法,其特征在于,包括:
(1)提取待鉴定花生的DNA;
(2)以DNA为模板,利用SEQ ID NO.2和SEQ ID NO.3所示引物进行PCR扩增;
(3) 分析PCR扩增产物中权利要求1或2所述的SNP分子标记的基因型,根据所述基因型判断待鉴定花生FAD2A基因表达量高低。
9.根据权利要求8所述的方法,其特征在于,步骤(3)中所述判断待鉴定花生FAD2A基因表达量高低的方法如下:
当所述SNPC-E的多态性位点的基因型为GG时,则待鉴定花生的FAD2A基因表达量低;当所述SNPC-E的多态性位点的基因型为AA时,则待鉴定花生的FAD2A基因表达量高。
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