[发明专利]基于CRISPR-Cas12b系统的空肠弯曲菌检测试剂盒和方法有效

专利信息
申请号: 202011002123.0 申请日: 2020-09-22
公开(公告)号: CN112080571B 公开(公告)日: 2022-11-11
发明(设计)人: 焦新安;黄钰;张云增;顾丹;黄金林;郁金燕;薛寒;徐晓萌 申请(专利权)人: 扬州大学
主分类号: C12Q1/689 分类号: C12Q1/689;C12Q1/686;C12Q1/04;C12R1/01
代理公司: 上海光华专利事务所(普通合伙) 31219 代理人: 许亦琳;余明伟
地址: 225009 *** 国省代码: 江苏;32
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摘要:
搜索关键词: 基于 crispr cas12b 系统 空肠 弯曲 检测 试剂盒 方法
【权利要求书】:

1.一种非诊断目的的基于CRISPR-Cas12b系统的空肠弯曲菌检测方法,所述方法具体包括:

(1)体外转录纯化sgRNA,所述sgRNA的核苷酸序列为如SEQ ID NO.4-6所示的序列;

(2)提取样品基因组DNA;

(3)加样:将样品基因组DNA、阳性对照或阴性对照分别加入装有CRISPR-Cas12b反应体系的PCR管中,获得对应的样品反应管、阳性反应管或阴性反应管,所述CRISPR-Cas12b反应体系中含有如SEQ ID NO.4-6所示的sgRNA序列和SEQ ID NO.7-8所示核苷酸序列;

(4)CRISPR-Cas12b反应:反应管置于PCR仪上,设置参数:48°C 30-35 min,65°C 5min;进行反应;

(5)CRISPR-Cas12b反应结束后,分析结果:将反应液放置 485 nm 的蓝光下,通过观察反应液的颜色变化来确定是否含有空肠弯曲菌,当含有空肠弯曲菌时,反应液会变成绿色;

所述方法利用CRISPR-Cas12b系统检测靶标位点,所述靶标位点的核苷酸序列如SEQID NO.1-3任一所示。

2.一种用于检测空肠弯曲菌的CRISPR-Cas12b的检测试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括:Cas12b蛋白、sgRNA以及报告基因,所述CRISPR-Cas12b检测空肠弯曲菌的靶标位点如SEQ ID NO.1-3任一所示,所述CRISPR-Cas12b检测试剂盒利用Cas12b和sgRNA进行CRISPR检测,所述sgRNA以所述靶标位点为靶序列进行设计,所述sgRNA的核苷酸序列如SEQ IDNO.4-6所示,所述报告基因为如SEQ ID NO.7-8所示核苷酸序列,每个所述报告基因的两端分别含有荧光基团和猝灭基团。

3.如权利要求2所述检测试剂盒在制备空肠弯曲菌检测产品中的用途。

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