[发明专利]基于CRISPR-Cas12b系统的空肠弯曲菌检测试剂盒和方法有效
申请号: | 202011002123.0 | 申请日: | 2020-09-22 |
公开(公告)号: | CN112080571B | 公开(公告)日: | 2022-11-11 |
发明(设计)人: | 焦新安;黄钰;张云增;顾丹;黄金林;郁金燕;薛寒;徐晓萌 | 申请(专利权)人: | 扬州大学 |
主分类号: | C12Q1/689 | 分类号: | C12Q1/689;C12Q1/686;C12Q1/04;C12R1/01 |
代理公司: | 上海光华专利事务所(普通合伙) 31219 | 代理人: | 许亦琳;余明伟 |
地址: | 225009 *** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 基于 crispr cas12b 系统 空肠 弯曲 检测 试剂盒 方法 | ||
1.一种非诊断目的的基于CRISPR-Cas12b系统的空肠弯曲菌检测方法,所述方法具体包括:
(1)体外转录纯化sgRNA,所述sgRNA的核苷酸序列为如SEQ ID NO.4-6所示的序列;
(2)提取样品基因组DNA;
(3)加样:将样品基因组DNA、阳性对照或阴性对照分别加入装有CRISPR-Cas12b反应体系的PCR管中,获得对应的样品反应管、阳性反应管或阴性反应管,所述CRISPR-Cas12b反应体系中含有如SEQ ID NO.4-6所示的sgRNA序列和SEQ ID NO.7-8所示核苷酸序列;
(4)CRISPR-Cas12b反应:反应管置于PCR仪上,设置参数:48°C 30-35 min,65°C 5min;进行反应;
(5)CRISPR-Cas12b反应结束后,分析结果:将反应液放置 485 nm 的蓝光下,通过观察反应液的颜色变化来确定是否含有空肠弯曲菌,当含有空肠弯曲菌时,反应液会变成绿色;
所述方法利用CRISPR-Cas12b系统检测靶标位点,所述靶标位点的核苷酸序列如SEQID NO.1-3任一所示。
2.一种用于检测空肠弯曲菌的CRISPR-Cas12b的检测试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括:Cas12b蛋白、sgRNA以及报告基因,所述CRISPR-Cas12b检测空肠弯曲菌的靶标位点如SEQ ID NO.1-3任一所示,所述CRISPR-Cas12b检测试剂盒利用Cas12b和sgRNA进行CRISPR检测,所述sgRNA以所述靶标位点为靶序列进行设计,所述sgRNA的核苷酸序列如SEQ IDNO.4-6所示,所述报告基因为如SEQ ID NO.7-8所示核苷酸序列,每个所述报告基因的两端分别含有荧光基团和猝灭基团。
3.如权利要求2所述检测试剂盒在制备空肠弯曲菌检测产品中的用途。
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