[发明专利]一种腺病毒全基因组捕获方法、引物组以及试剂盒

权利要求书

1.一种腺病毒检测的序列组合，其特征在于，所述的序列组合包括针对腺病毒基因组全序列设计的16条叠瓦式PCR扩增引物，所述16条扩增引物序列依次包括SEQ ID No.1-16或SEQ ID No：1-16中的序列经过一个或几个核苷酸的取代、缺失和/或插入且与相应的SEQID No:1-16具有相同功能的DNA分子。

2.根据权利要求1所述的腺病毒检测的序列组合，其特征在于，所述的序列组合根据腺病毒3型，7型，11型，14型，55型设计。

3.一种试剂盒，其包含腺病毒检测的序列组合，其特征在于，所述序列组合包括针对腺病毒基因组全序列设计的16条叠瓦式PCR扩增引物，所述16条扩增引物序列依次包括SEQID No.1-16或SEQ ID No：1-16中的序列经过一个或几个核苷酸的取代、缺失和/或插入且与相应的SEQ ID No:1-16具有相同功能的DNA分子。

4.根据权利要求3所述的试剂盒，其特征在于，所述的序列组合根据腺病毒3型，7型，11型，14型，55型设计。

5.一种腺病毒检测的测序片段捕获方法，其特征在于，具体步骤包括：

（1）RNA提取：将标本中的腺病毒进行病毒 RNA 提取；

（2）引物设计与PCR扩增：使用针对腺病毒保守区域设计的16条扩增引物，所述的扩增引物的序列包括SEQ ID No.1-16或SEQ ID No：1-16中的序列经过一个或几个核苷酸的取代、缺失和/或插入且与相应的SEQ ID No:1-16具有相同功能的DNA分子，应用RT-PCR扩增体系，取步骤（1）提取的病毒RNA，进行扩增；

（3）测序：扩增反应结束后，将PCR反应中得到大小不同的腺病毒基因片段，直接进行测序。

6.根据权利要求5所述的捕获方法，其特征在于，所述的步骤（1）中，毒株标本类型包括鼻咽拭子、深咳痰液、肺泡灌洗液或肺组织活检标本。

7.根据权利要求5或6所述的捕获方法，其特征在于，所述的步骤（1）中，RNA 提取的最终体积为 20-50 ul。

8.根据权利要求5或6所述的捕获方法，其特征在于，所述的步骤（1）中，RNA 提取后获得的病毒RNA为Ct值低于27的核酸样品。

9.根据权利要求5所述的捕获方法，其特征在于，所述的步骤（2）中， 扩增引物序列根据腺病毒3型，7型，11型，14型，55型设计。

10.权利要求1或2所述的序列组合在制备检测腺病毒试剂盒中的用途。

11.一种腺病毒检测的测序片段捕获方法，其特征在于，使用权利要求3或4所述的试剂盒获得腺病毒检测的测序片段。