[发明专利]一种定量DNA甲基化程度的电化学方法及系统有效

专利信息
申请号: 202010838165.1 申请日: 2020-08-19
公开(公告)号: CN112098489B 公开(公告)日: 2022-11-15
发明(设计)人: 孙经纬 申请(专利权)人: 孙经纬
主分类号: G01N27/327 分类号: G01N27/327;C12Q1/6886
代理公司: 广州嘉权专利商标事务所有限公司 44205 代理人: 胡辉
地址: 广东省广*** 国省代码: 广东;44
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摘要:
搜索关键词: 一种 定量 dna 甲基化 程度 电化学 方法 系统
【权利要求书】:

1.一种DNA甲基化的电化学检测方法,包括:

S1)获取待测DNA样本;

S2)将待测DNA样本溶解于水性缓冲液中,得到DNA溶液;所述水性缓冲液为pH=8.0的TE缓冲液;

S3)将电化学工作站的工作电极、参比电极和对电极浸没于电解液中,确定吸附前的DPV电流峰值作为基线电流A0,所述电解液为添加有水溶性铁氰化盐和水溶性亚铁氰化盐的缓冲液;所述缓冲液为PBS缓冲液;

S4)将工作电极浸入所述DNA溶液中并充分吸附,测试吸附后的DPV电流峰值,记为样本电流A1;

S5)根据基线电流A0和样本电流A1,计算DNA甲基化程度;

其中,检测过程中维持恒温至15~25℃,所述工作电极为金电极;

所述金电极在使用前经过铝粉进行打磨;

电化学工作站DPV模式的检测参数为:t equilibration=0s、E begin=-0.1V、E end=0.5V、E step=0.005V、E pulse=0.05V、t pulse=0.05s、Scan rate=0.05V/s、Current range=1uA–1mA;

DNA电流吸附率的计算公式为:

当计算得到的DNA电流吸附率低于10%时,对样本进行复核。

2.根据权利要求1所述的电 化学检测方法,其特征在于:检测过程中的温度维持在20℃。

3.根据权利要求1所述的电 化学检测方法,其特征在于:水溶性铁氰化盐选自[K3Fe(CN)6]、[Na3Fe(CN)6];水溶性亚铁氰化盐选自[K4Fe(CN)6]或[Na4Fe(CN)6]。

4.根据权利要求1~3任一项所述的电 化学检测方法,其特征在于:水溶性铁氰化盐和水溶性亚铁氰化盐的摩尔比为(0.95~1.05):1。

5.根据权利要求4所述的电 化学检测方法,其特征在于:水溶性铁氰化盐和水溶性亚铁氰化盐的摩尔比为1:1。

6.根据权利要求1~3任一项所述的电 化学检测方法,其特征在于:使用磁珠吸附法提取获得待测DNA样本。

7.根据权利要求1~3任一项所述的电 化学检测方法,其特征在于:所述待测DNA样本包括血浆cfDNA样本、组织DNA样本。

8.一种肿瘤筛查系统,包括:

样本DNA甲基化程度检测装置:采用 权利要求1~7任一项所述的方法,确定样本DNA甲基化程度;

结果判断装置:基于样本DNA甲基化程度,筛查恶性肿瘤。

9.根据权利要求8所述的肿瘤筛查系统,其特征在于:所述肿瘤选自肺癌、前列腺癌、乳腺癌、头颈部鳞癌、食管癌、淋巴瘤、胃癌、白血病、胰腺癌、肝癌、肠癌、卵巢癌、子宫内膜癌、胆囊癌、宫颈癌。

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