[发明专利]耐盐基因及其应用有效
| 申请号: | 202010693835.5 | 申请日: | 2020-07-17 |
| 公开(公告)号: | CN111733276B | 公开(公告)日: | 2021-04-16 |
| 发明(设计)人: | 刘敏轩;李海;宝力格;陆平 | 申请(专利权)人: | 中国农业科学院作物科学研究所 |
| 主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12N15/11 |
| 代理公司: | 北京预立生科知识产权代理有限公司 11736 | 代理人: | 孟祥斌 |
| 地址: | 100081 北*** | 国省代码: | 北京;11 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 基因 及其 应用 | ||
本发明公开了一种耐盐基因及其应用,具体的涉及耐盐基因LOC8076251和/或LOC8056787,其在耐盐过程或者耐盐株中高表达。可以将LOC8076251和/或LOC8056787应用于植物的培育中,选育出具有耐盐胁迫能力的植物品种。
技术领域
本发明属于生物技术领域,涉及耐盐基因及其应用。
背景技术
2009年,美国能源部联合基因组研究所的科学家们利用全基因组鸟枪测序法完成了对高粱全基因组的测序及分析,结果显示,高粱基因组大约有3万个基因,7.3亿个核苷酸。高粱全基因组测序的完成对高粱后续各项研究的进展提供了坚实的基础。
随着三代测序技术的到来,三代全长转录组的应用在植物研究领域带来了更广阔的前景。Salah E.Abdel-Ghany等通过对高粱转录组的二代测序和三代测序数据进行比较分析,结果表明三代测序在识别全长亚型,多聚腺苷酸化等方面具有二代测序无可比拟的优势。
本研究使用Oxford Nanopore Technologies三代全长转录组测序方法对高粱苗期耐盐品种和敏盐品种进行测序比较分析,旨在探究两个品种耐盐机制的异同,发掘耐盐性关键基因,为后续高粱耐盐机制的深入研究奠定基础。
发明内容
本发明的目的在于提供一种与高粱耐盐相关的分子标志物,可以为高粱品种的筛选、推广种植以及改良提供理论依据和新的手段。
为了实现上述目的,本发明采用了如下的技术方案:
本发明第一方面提供了一种与高粱耐盐相关的分子标志物,所述分子标志物选自:LOC8076251和/或LOC8056787。
本发明第二方面提供了一种预测或辅助预测高粱耐盐的方法,通过检测样品中本发明第一方面所述的分子标志物的表达水平来预测或辅助预测植物的耐盐性。
进一步,通过northern blotting、实时荧光定量PCR、原位杂交、基因芯片、高通量测序技术、蛋白免疫技术检测样品中本发明第一方面所述的分子标志物的表达水平。
进一步,通过实时荧光定量PCR检测样品中本发明第一方面所述的分子标志物的表达水平。
本发明第三方面提供了本发明第二方面所述的方法在筛选耐盐高粱中的应用。
本发明第四方面提供了本发明第二方面所述的方法在高粱育种中的应用。
本发明第五方面提供了一种检测本发明第一方面所述的分子标志物的试剂,所述试剂能够检测LOC8076251或LOC8056787的水平。
本发明的第六方面提供了一种试剂盒,所述试剂盒包括本发明第五方面所述的试剂。
本发明第七方面提供了本发明第五方面所述的试剂或本发明第六方面所述的试剂盒在预测或辅助预测高粱耐盐中的应用;和/或在筛选耐盐高粱中的应用。
本发明第八方面提供了一种提高高粱耐盐性的方法,所述方法包括:增加本发明第一方面所述的分子标志物的表达。
本发明的优点和有益效果:
本发明首次发现了LOC8076251或LOC8056787与植物耐盐相关,对于研究植物抗逆的遗传本质及提高植物耐盐具有重要的意义。
附图说明
图1是分子标志物LOC8076251和LOC8056787在敏盐株和耐盐株中的表达情况图;其中,A是LOC8076251;图B是LOC8056787;
图2是LOC8076251和LOC8056787在盐胁迫中的表达情况图;其中,图A是LOC8076251,图B是LOC8056787。
具体实施方式
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