[发明专利]一种基于RAA-LFD检测新冠病毒的方法在审
申请号: | 202010637007.X | 申请日: | 2020-07-03 |
公开(公告)号: | CN111676324A | 公开(公告)日: | 2020-09-18 |
发明(设计)人: | 林敏;郑玉忠;杨培奎;林丽云;陈江涛;吴显劲 | 申请(专利权)人: | 韩山师范学院;惠州市中心人民医院 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/6844 |
代理公司: | 北京劲创知识产权代理事务所(普通合伙) 11589 | 代理人: | 徐家升 |
地址: | 521000*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 raa lfd 检测 病毒 方法 | ||
1.一种基于RAA-LFD检测新冠病毒的方法,其特征在于,包括如下步骤:
步骤1:样本留取:采集样本,包括咽拭子、鼻拭子、鼻咽抽取物或呼吸道抽取物、深咳痰液、支气管灌洗液、肺泡灌洗液、血液标本、血清标本、粪便标本、眼结膜拭子;
步骤2:核酸提取:采用闪电核酸释放剂提取全血、血清、血浆、尿液、唾液、口腔拭子、鼻咽拭子、细胞悬液等样品的核酸(RNA);
步骤3:标准质粒构建:新冠病毒COVID-19N基因全序列的重组质粒2019-nCoVN全长质粒V2,以紫外分光光度计测量重组质粒OD260、OD280及OD260/OD280值,并重复3次,确定质粒DNA浓度和纯度,按照梯度稀释:1×108拷贝/μL至1×101拷贝/μL,-20℃保存备用;
步骤4:以新冠病毒COVID-19N基因作为靶基因,分析新冠病毒COVID-19N基因的序列特点后,应用Primer Premier 5.0软件设计种属特异性扩增引物;
步骤5:使用RAA核酸扩增试剂盒进行RAA反应体系的配制;
步骤6:RAA反应结束后,打开Eppendorf管,吸取扩增产物至一新的Eppendorf管中,做好标记,并稀释50倍,马上进行试纸条检测;
步骤7:利用试剂盒进行RAA扩增和试纸条检测,获得产品的检测下限为1×101拷贝/μL;
步骤8:以超纯水作为阴性对照,以1×100拷贝/μL、1×101拷贝/μL、1×102拷贝/μL、重组质粒为模板,进行3次平行试验。
2.如权利要求1所述的基于RAA-LFD检测新冠病毒的方法,其特征在于,步骤4中与相近的物种冠状病毒序列做比对,包括SARS-COV、HCOV-229E、HCOV-U1、HCOV-NL63和HCOV-OC43。
3.如权利要求1所述的基于RAA-LFD检测新冠病毒的方法,其特征在于,步骤4探针序列位于扩增引物中间区段,经四氢呋喃修饰。
4.如权利要求1所述的基于RAA-LFD检测新冠病毒的方法,其特征在于,步骤5加样顺序为阴性质控样本、待检样本,每个样本添加完毕后均需立即扣好管盖。
5.如权利要求1所述的基于RAA-LFD检测新冠病毒的方法,其特征在于,步骤7在初始模板为1×103~1×106拷贝/μL的情况下,试纸条显色速度很快,从试纸条插入PCR反应管,至条带显色不超过3分钟。
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