[发明专利]水稻多雌蕊基因LOC_Os03g11630的分子标记方法

说明书

水稻多雌蕊基因LOC_Os03g11630的分子标记方法，以多雌蕊水稻为基因供体构建F₂遗传定位分离群体，以F₂群体隐性单株为基因定位群体，借助SSR和InDel^#标记进行PCR扩增，根据PCR扩增电泳结果，对水稻多雌蕊进行高密度连锁分析，获得了与之紧密连锁的基于PCR反应的2对特异PCR引物对L3‑135和RM7576，2特异标记间物理距离为40.617Kb，与LOC_Os03g11630基因紧密连锁。当标记L3‑135和RM7576能单独或者同时扩增250bp和206bp大小的片段，则该水稻材料携带多雌蕊基因LOC_Os03g11630，并由此获得该多雌蕊基因。本发明用于检测、筛选水稻多雌蕊基因，为水稻遗传机理解析提供基因资源，挖掘与新创优异水稻资源，支持超高产水稻新品种的培育。

技术领域

本发明涉及一种控制水稻多雌蕊基因LOC_Os03g11630的分子标记方法，属于水稻优异基因资源挖掘和分子遗传学领域。

背景技术

水稻是世界上最重要的第一大粮食作物，全球半数以上人口以稻米为主食，特别在保障我国可持续的粮食供给中其扮演着重要角色。回顾我国建国以来水稻遗传育种的研发历程，每个优质高产新品种的成功培育和每篇世界顶级杂志所刊发水稻相关论文都离不开水稻优异种质资源的挖掘与特异基因的创新利用。因此，不断挖掘与创新利用优异水稻资源是超高产水稻新品种培育必不可缺的重要环节,更是丰富和发展水稻遗传基础理论研究的源动力。花器官是水稻完成整个生活史中必不可缺的器官，其发育正常与否直接决定着稻谷产量和品质的形成。鉴定影响水稻花器官数目和结构变异的相关基因，为进一步研究水稻花发育的分子机制，为提高水稻产量、品质及挖掘水稻潜在的种质资源奠定基础。

分子遗传学研究表明，水稻花器官变异基因属于单基因控制的质量性状。随着基因定位克隆技术的广泛应用，图位克隆技术是从水稻种质资源中定位克隆控制重要农艺性状QTL/基因最有效的手段之一。利用SSR，InDel，Caps等标记技术及不同变异来源的水稻花器官突变资源，综合运用经典遗传学、分子生物学、基因工程学及育种学等多学科交叉的基础理论技术体系鉴定出大量水稻花器官突变基因，从一定程度上促进了人们对水稻花器官遗传突变机制的理解。但是，由于之前的研究选用不同类型的花器官突变材料为基因供体，筛选鉴定目标基因的遗传差异较大，基因的遗传多样性丰富，特别是目前鉴定的花器官数目和结构突变基因在染色体上的物理位置分布存在较大差异。迄今为止，控制水稻花器官数量和形态结构变异的相关基因都有报道，并精细定位和克隆了部分花器官突变基因，这些基因位于水稻不同染色体上。目前，还有很多水稻多雌蕊相关基因未被发掘。本申请人从“热粳35/协青早B”F₂遗传分离群体中筛选到1份花器官突变材料，经过海南和重庆两地连续多代自交遗传分离纯化后、花器官突变体田间表型稳定且不受环境影响，在扬花期该突变材料表现为6枚雄蕊正常，花药花丝发育正常，雌蕊突变表现为2或3个子房，成熟期受精结实形成完整的2或3颗谷粒，成熟种子萌发成连体双苗，暂命名为多雌蕊172。申请人以多雌蕊172作为基因供体，构建“02428/多雌蕊172”杂交组合获得F₀杂交种子，种植F₀杂交种子获得F₁植株，F₁植株自交获得F₂遗传定位群体种子，采用图位定位克隆策略将多雌蕊基因定位在第3染色体短臂上L3-135-RM7576区间，2对特异PCR标记间物理距离40.617Kb，2对特异PCR标记与多雌蕊基因LOC_Os03g11630存在紧密连锁关系。

发明内容

本发明所要解决的技术问题为：如何提供一个全新的影响水稻雌蕊数目变化的新基因。并提供了多雌蕊突变基因的分子标记方法和检测方法。