[发明专利]与油茶种仁油中亚麻酸含量相关的关键SNP分子标记及其应用有效

专利信息
申请号: 202010442342.4 申请日: 2020-05-22
公开(公告)号: CN111455090B 公开(公告)日: 2023-04-07
发明(设计)人: 姚小华;林萍;王开良 申请(专利权)人: 中国林业科学研究院亚热带林业研究所
主分类号: C12Q1/6895 分类号: C12Q1/6895;C12N15/11
代理公司: 北京路浩知识产权代理有限公司 11002 代理人: 黄爽
地址: 311400 浙*** 国省代码: 浙江;33
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摘要:
搜索关键词: 油茶 种仁 亚麻 含量 相关 关键 snp 分子 标记 及其 应用
【权利要求书】:

1.与油茶种仁油中亚麻酸含量相关的关键SNP分子标记,其特征在于,所述分子标记选自PB.70158.1-473、PB.70158.1-649、PB.70158.1-704和PB.70158.1-707中的任一个;

其中,标记PB.70158.1-473含有油茶如SEQ ID NO:3所示序列第473bp处的多态性为C/G的核苷酸序列;

标记PB.70158.1-649含有油茶如SEQ ID NO:3所示序列第649bp处的多态性为A/G的核苷酸序列;

标记PB.70158.1-704含有油茶如SEQ ID NO:3所示序列第704bp处的多态性为G/A的核苷酸序列;

标记PB.70158.1-707含有油茶如SEQ ID NO:3所示序列第707bp处的多态性为A/C的核苷酸序列。

2.根据权利要求1所述的分子标记,其特征在于,标记PB.70158.1-473所含多态性位点的基因型为GG,对应于高亚麻酸含量,若基因型为CG或CC,对应于低亚麻酸含量;

标记PB.70158.1-649所含多态性位点的基因型为GG,对应于高亚麻酸含量,若基因型为AG或AA,对应于低亚麻酸含量;

标记PB.70158.1-704所含多态性位点的基因型为AA,对应于高亚麻酸含量,若基因型为AG或GG,对应于低亚麻酸含量;

标记PB.70158.1-707所含多态性位点的基因型为CC,对应于高亚麻酸含量,若基因型为AC或AA,对应于低亚麻酸含量。

3.与油茶种子亚麻酸含量相关的关键SNP分子标记组合,其特征在于,所述分子标记组合选自权利要求1或2中所述的PB.70158.1-473、PB.70158.1-649、PB.70158.1-704和PB.70158.1-707中的至少两个。

4.用于扩增权利要求1或2所述分子标记的引物,其特征在于,包括如SEQ IDNO:1所示的上游引物和如SEQ ID NO:2所示的下游引物。

5.含有权利要求4所述的引物的检测试剂或试剂盒。

6.高亚麻酸含量油茶品种的鉴定及选育方法,其特征在于,包括:

1)提取待测油茶总RNA,反转录合成cDNA;

2)以cDNA为模板,利用SEQ ID NO:1-2所示引物进行PCR扩增;

3)分析PCR扩增产物。

7.根据权利要求6所述的方法,其特征在于,PCR反应程序为:95℃3min;95℃15s,68℃45s,共40个循环;68℃5min。

8.根据权利要求6或7所述的方法,其特征在于,步骤3)包括:对扩增产物进行测序,根据测序结果判定如下:

若标记PB.70158.1-473对应的多态性位点的基因型为GG,判定待测油茶为高亚麻酸含量,若基因型为CG或CC,则待测油茶为低亚麻酸含量;和/或

若标记PB.70158.1-649对应的多态性位点的基因型为GG,判定待测油茶为高亚麻酸含量,若基因型为AG或AA,则待测油茶为低亚麻酸含量;和/或

若标记PB.70158.1-704对应的多态性位点的基因型为AA,判定待测油茶为高亚麻酸含量,若基因型为AG或GG,则待测油茶为低亚麻酸含量;和/或

若标记PB.70158.1-707对应的多态性位点的基因型为CC,判定待测油茶为高亚麻酸含量,若基因型为AC或AA,则待测油茶为低亚麻酸含量。

9.权利要求1或2所述分子标记、权利要求3所述分子标记组合、权利要求4所述引物或权利要求5所述检测试剂或试剂盒的以下任一应用:

(1)用于油茶种质资源亚麻酸含量的鉴定及改良;

(2)用于油茶亚麻酸含量早期预测;

(3)用于油茶亚麻酸含量性状的分子标记辅助育种。

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