[发明专利]一种重组酶聚合酶扩增光电化学循环肿瘤DNA液体活检的方法在审

专利信息
申请号: 202010429706.5 申请日: 2020-05-20
公开(公告)号: CN111534595A 公开(公告)日: 2020-08-14
发明(设计)人: 混旭;邓陆平;孟玉婵;王浩 申请(专利权)人: 青岛科技大学
主分类号: C12Q1/6886 分类号: C12Q1/6886;C12Q1/6844;C01B19/04;B82Y30/00;B82Y40/00
代理公司: 青岛中天汇智知识产权代理有限公司 37241 代理人: 雷斐
地址: 266000 山*** 国省代码: 山东;37
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摘要:
搜索关键词: 一种 重组 聚合 扩增 光电 化学 循环 肿瘤 dna 液体 活检 方法
【权利要求书】:

1.一种重组酶聚合酶扩增光电化学循环肿瘤DNA液体活检的方法,其特征在于,首先,将AuNPs@ZnSeNSs修饰到GE上,然后通过Au-S键将FP固定在AuNPs@ZnSeNSs/GE上;加入含有KLK2的样品后,电极表面的FP和溶液中的RP在重组酶聚合酶的存在下进行RPA扩增;在电极上扩增了靶标,并在电极表面捕获了RP;洗涤后,St-ALP通过生物素和链霉亲和素之间的亲和作用连接在电极上;ALP催化水解p-NPP为p-NP;由于ALP的高催化活性,产生了许多p-NP;在MB和p-NP的作用下产生强的光电信号,根据PEC信号强度实现KLK2含量的测定;由于MB和p-NP共调控作用、MB的循环,以及重组酶聚合酶扩增实现了目标物的高灵敏度检测;在MB和p-NP存在的情况下,AuNPs@ZnSeNSs/GE在0V时产生强的光电流,具有自供能特性,结合原位重组酶聚合酶扩增策略,建立了一种前列腺癌循环肿瘤DNA KLK2液体活检新方法;具体步骤为:

ZnSe纳米片的制备包括以下步骤:

通过超声剥离方法剥离得到ZnSe纳米片;首先,将0.1mg~450mg的ZnSe加到1mL~150mL DMF溶液中,然后将混合物通过超声分散0.1h~100h,以获得黄色分散液;接下来,在14,000rpm条件下离心20min,从分散液中分离出剥离的ZnSe,并用乙醇洗涤3次;最后,将ZnSeNSs悬浮液用于下一实验;

AuNPs@ZnSeNSs的合成包括以下步骤:

通过原位生长法制备AuNPs@ZnSeNSs;将0.1mL~30mL ZnSeNSs和0.1mL~10mLHAuCl4·4H2O加入到烧瓶中,在搅拌下通过油浴加热至115℃;溶液继续回流并搅拌3分钟;然后,将0.1mL~10mL 1.66mg/mL的柠檬酸钠溶液滴入烧瓶中;将该混合物在115℃下回流3分钟,得到黑色的AuNPs@ZnSeNSs;在14,000rpm条件下离心10min,收集最终的黑色沉淀物;在AuNPs@ZnSeNSs的合成方法中,不同质量的氯金酸会影响PEC信号;ZnSeNSs与氯金酸的质量比分别为1:0.2、1:0.33、1:0.66、1:1、1:1.5;

KLK2检测包括以下步骤:

将1μL~60μL AuNPs@ZnSeNSs滴到金电极表面,并在空气中自然干燥;然后将1μL~60μL的10mM TCEP加到1μL~60μL的10μM FP溶液中,将混合物溶液在37℃下孵育;60分钟后,将1μL~60μL混合物添加到AuNPs@ZnSeNSs/GE的表面,并在37℃条件下孵育2小时,得到FP/AuNPs@ZnSeNSs/GE;然后,将FP/AuNPs@ZnSeNSs/GE浸入1mM MCH溶液中1h以消除非特异性吸附;接下来,制备RPA溶液用于KLK2基因的表面扩增;RPA反应溶液由2.4μL 10μM RP,13.2μL不含DNase的水,31.9μL重组酶聚合酶缓冲溶液和2.5μL280mM醋酸镁溶液制成;然后将1μL~50μL该RPA溶液和1μL~50μL含KLK2的样品添加到FP/AuNPs@ZnSeNSs/GE的表面上;在37℃扩增30分钟后,电极用0.1M PBS洗涤;最后,将电极浸入2μL~60μL 1μM St-ALP溶液中,在37℃下孵育30分钟,用0.1M PBS洗涤电极,将电极插入p-NPP和MB的溶液中,ALP催化水解p-NPP为p-NP;在MB和p-NP的作用下产生强的光电信号,根据PEC信号强度实现KLK2含量的测定。

正向引物、反向引物和KLK2基因的序列如下:

KLK2正向引物(FP):5'-SH-GGGGGTCCACTTGTCTGTAA-3'

KLK2反向引物(RP)5'-GGTGAGTTCCAAGCTTCAGG-biotin-3'

KLK2基因:5'-GGGGGTCCA CTTGTCTGTA ATGGTGTGCT TCAAGGTATC ACATCATGGGGCCCTGAGCC ATGTGCCCTG CCTGAAAAGC CTGCTGTGTA CACCAAGGTG GTGCATTACC GGAAGTGGATCAAGGACACC ATCGCAGCCA ACCCCTGAGT GCCCCTGTCC CACCCCTACC TCTAGTAAAT TTAAGTCCACCTCACGTTCT GGCATCACTT GGCCTTTCTG GATGCTGGAC ACCTGAAGCT TGGAACTCAC C-3' 。

2.根据权利要求1所述的一种重组酶聚合酶扩增光电化学循环肿瘤DNA液体活检的方法,其所用的试剂和仪器如下:

三羟甲基氨基甲烷(Tris)、巯基乙胺(MCH)、三(2-羧乙基)膦(TCEP)和链霉亲和素标记的碱性磷酸酶(St-ALP)、N,N-二甲基甲酰胺(DMF)由Sangon Biotech Co.,Ltd.(中国,上海)提供;TwistAmp Basic RT-RPA试剂盒(Twist-DX)、重组酶聚合酶缓冲溶液从Babraham(UK)购买的;生物素标记的反向引物(RP)、巯基化正向引物(FP)由Sangon Biotech Co.,Ltd.(中国,上海)合成,

聚丙烯酰胺凝胶电泳分析是使用ADYCP-31E电泳仪,购于WoDeLife SciencesInstrument Co.,Ltd.;所有光致电化学测量均在CHI660E电化学工作站上进行,购于上海辰华仪器有限公司。

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