[发明专利]检测低突变丰度样本的NGS文库制备接头及其制备方法在审

专利信息
申请号: 202010292398.6 申请日: 2020-04-14
公开(公告)号: CN111471746A 公开(公告)日: 2020-07-31
发明(设计)人: 金泰庆;万季;余涛;潘晓新;王志强;蔡雪儿;王一杏;关建洪;王奕;宋麒 申请(专利权)人: 深圳市新合生物医疗科技有限公司
主分类号: C12Q1/6806 分类号: C12Q1/6806;C12N15/11;C40B80/00
代理公司: 北京冠和权律师事务所 11399 代理人: 安琪
地址: 518000 广东省深圳市南*** 国省代码: 广东;44
权利要求书: 查看更多 说明书: 查看更多
摘要:
搜索关键词: 检测 突变 样本 ngs 文库 制备 接头 及其 方法
【权利要求书】:

1.一种检测低突变丰度样本的NGS文库制备接头,其特征在于:包括P5端寡核苷酸链和P7端寡核苷酸链,寡核苷酸链上含有P5及P7引物序列,还包括a.测序引物位点SP序列;b.UMIs序列;c.样本标签Index序列;其中,P5端寡核苷酸链包括P5引物序列,其3’端依次连接测序引物位点SP序列、连接在一起的UMIs序列和样本标签Index序列,P7端寡核苷酸链包括P7引物序列,其5’端依次连接测序引物位点SP序列、连接在一起的UMIs序列和样本标签Index序列;P5与P7端寡核苷酸链除P5及P7引物序列外,其他部分序列反向互补;所述NGS文库制备接头呈Y型结构,P5及P7引物序列为分别为Y型上方的两头。

2.根据权利要求1所述的检测低突变丰度样本的NGS文库制备接头,其特征在于:所述UMIs序列为一段1-16碱基的随机寡核苷酸。

3.根据权利要求1所述的检测低突变丰度样本的NGS文库制备接头,其特征在于:所述样本标签Index序列为一段1-16碱基寡核苷酸。

4.根据权利要求1所述的检测低突变丰度样本的NGS文库制备接头,其特征在于:所述接头含3’T粘性末端。

5.根据权利要求1所述的检测低突变丰度样本的NGS文库制备接头,其特征在于:所述接头正链及负链5‘端含磷酸化基团。

6.一种权利要求1-5任一项所述的检测低突变丰度样本的NGS文库制备接头的制备方法,其特征在于:包括以下步骤:

(1)合成P5端寡核苷酸链和P7端寡核苷酸链:

寡核苷酸链包括P5/P7引物序列,还包括a.测序引物位点SP序列;b.UMIs序列;c.样本标签Index序列;

(2)接头合成及制备:

1)将步骤(1)合成的P5端寡核苷酸链和P7端寡核苷酸链进行链融合;

2)对步骤1)链融合得到的DNA进行链延伸;

3)对步骤2)产物DNA进行酶切消化,在双链末端制备出T粘性末端。

7.根据权利要求6所述的检测低突变丰度样本的NGS文库制备接头的制备方法,其特征在于:步骤1)所述链融合,具体为:

①将合成的P5和P7端寡核苷酸链溶解,并调整浓度为1-100uM,二者的溶液等浓度;

②将步骤①配置好的P5和P7端寡核苷酸链溶液等体积混合,加入等体积链融合缓冲液,混匀;

③95℃孵育10min;

④自然冷却至室温;

⑤将混合溶液中的DNA沉淀出来;

⑥乙醇溶液清洗所得DNA沉淀,晾干;并加入适量水或TE溶解。

8.根据权利要求6所述的检测低突变丰度样本的NGS文库制备接头的制备方法,其特征在于:步骤2)所述对步骤1)链融合得到的DNA进行链延伸,包括以下步骤:

①配制含Klenow酶延伸体系;

②上述体系在37℃孵育10min至24h;

③将混合溶液中的DNA沉淀出来;

④乙醇溶液清洗所得DNA沉淀,晾干;加入适量水或TE溶解。

9.根据权利要求6所述的检测低突变丰度样本的NGS文库制备接头的制备方法,其特征在于:步骤3)所述对步骤2)产物DNA进行酶切消化,包括以下步骤:

①配制含HPYCH4III酶的酶切体系;

②将上述体系在37℃孵育10min至24h;

③将混合溶液中的DNA沉淀出来;

④乙醇溶液清洗所得DNA沉淀,晾干;加入适量水或TE溶解。

下载完整专利技术内容需要扣除积分,VIP会员可以免费下载。

该专利技术资料仅供研究查看技术是否侵权等信息,商用须获得专利权人授权。该专利全部权利属于深圳市新合生物医疗科技有限公司,未经深圳市新合生物医疗科技有限公司许可,擅自商用是侵权行为。如果您想购买此专利、获得商业授权和技术合作,请联系【客服

本文链接:http://www.vipzhuanli.com/pat/books/202010292398.6/1.html,转载请声明来源钻瓜专利网。

×

专利文献下载

说明:

1、专利原文基于中国国家知识产权局专利说明书;

2、支持发明专利 、实用新型专利、外观设计专利(升级中);

3、专利数据每周两次同步更新,支持Adobe PDF格式;

4、内容包括专利技术的结构示意图流程工艺图技术构造图

5、已全新升级为极速版,下载速度显著提升!欢迎使用!

请您登陆后,进行下载,点击【登陆】 【注册】

关于我们 寻求报道 投稿须知 广告合作 版权声明 网站地图 友情链接 企业标识 联系我们

钻瓜专利网在线咨询

周一至周五 9:00-18:00

咨询在线客服咨询在线客服
tel code back_top