[发明专利]用于鉴定实验用小型猪品种的特异性微卫星引物组合物及鉴定实验用小型猪品种的方法有效
申请号: | 202010276938.1 | 申请日: | 2020-04-10 |
公开(公告)号: | CN111363830B | 公开(公告)日: | 2022-06-21 |
发明(设计)人: | 王洪洋;谈永松;涂尾龙;张莺莺;吴华莉;曹建国 | 申请(专利权)人: | 上海市农业科学院 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12Q1/686;C12N15/11 |
代理公司: | 上海十蕙一兰知识产权代理有限公司 31331 | 代理人: | 刘秋兰 |
地址: | 201106 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 鉴定 实验 小型 品种 特异性 卫星 引物 组合 方法 | ||
1.一种鉴定实验用小型猪品种的方法,其特征在于包括如下步骤:
步骤S1:采集待鉴定实验用小型猪个体的组织样品,进行DNA提取及质量检测,其中,待鉴定实验用小型猪个体的品种范围为五指山猪、巴马猪、近交陆川猪或藏香猪;
步骤S2:用鉴定实验用小型猪品种的特异性微卫星引物组合物进行PCR扩增得PCR扩增产物;
所述引物组合物包括3对引物,分别对应于7号、9号和19号微卫星,具体为:
如SEQ ID NO:1所示的正向荧光引物F7:ATCCCCCACTCATTCTCACA;
如SEQ ID NO:2所示的反向普通引物R7:GCAAAACTGCACACAGCCTA;
如SEQ ID NO:3所示的正向荧光引物F9:TCCAGGCCCAGGTTGTATTA;
如SEQ ID NO:4所示的反向普通引物R9:AGGATCTTTTTCGGCAGGAT;
如SEQ ID NO:5所示的正向荧光引物F19:CAGCTTACAGCAAAAGTAGCCA;
如SEQ ID NO:6所示的反向普通引物R19:AAGATGTTTCATCAGACTATATCCGT;
步骤S3:取部分PCR扩增产物进行毛细管电泳,根据分子内标和HiDi确定相应位点的片段大小和信号值;
步骤S4:依据待鉴定实验用小型猪个体在7、9和19号微卫星座位上的基因片段大小,统计相应等位基因和基因型,根据等位基因及基因型推算待鉴定实验用小型猪个体的品种;
其中,7号、9号以及19号微卫星座位上的等位基因编号对应的等位基因大小如上所示;
步骤S4中得出的等位基因及基因型,依据以下标准鉴定实验用小型猪个体的品种:
若待鉴定个体在7号微卫星座位上存在7G或7K等位基因,或在7号微卫星座位上存在特异基因型7F7K,或在9号微卫星座位上存在特异等位基因9D,或在9号微卫星座位上存在特异基因型9C9H或9E9H,或在19号微卫星座位上存在特异等位基因19F,或在19号微卫星座位上存在特异基因型19A19D或19C19D,则待鉴定个体为五指山猪;
若待鉴定个体在7号微卫星座位存在7D或7J等位基因,或在7号微卫星座位上存在特异基因型7C7J或7F7J,或在19号微卫星座位上存在特异基因型19C19H,则待鉴定个体为巴马猪;
若待鉴定个体在7号微卫星座位上存在7L等位基因,或在9号微卫星座位上存在9I等位基因,或在9号微卫星座位上存在特异基因型9B9I、9H9I或9I9I,或在19号微卫星座位上存在特异基因型19A19G、19A19H、19G19H或19H19H,则待鉴定个体为近交陆川猪;
若待鉴定个体在7号微卫星座位上存在7A等位基因,或在9号微卫星座位上存在特异基因型9A9F、9E9F或9F9F,则待鉴定个体为藏香猪。
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