[发明专利]一种检测CAR-T基因拷贝数的标准物质的制备在审
申请号: | 202010275514.3 | 申请日: | 2020-04-09 |
公开(公告)号: | CN111394316A | 公开(公告)日: | 2020-07-10 |
发明(设计)人: | 孙秀莲 | 申请(专利权)人: | 济南宜明医疗科技有限公司 |
主分类号: | C12N5/10 | 分类号: | C12N5/10;C12N15/90;C12Q1/6851;C12R1/91 |
代理公司: | 广州科沃园专利代理有限公司 44416 | 代理人: | 徐莉 |
地址: | 250101 山东省济南市高新区东区街道*** | 国省代码: | 山东;37 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 检测 car 基因 拷贝 标准 物质 制备 | ||
1.一种293细胞系,其特征在于,包含TCR的CD3ζ链,GFP和WPRE的DNA序列;其中,所述TCR的CD3ζ链序列信息如SEQ ID NO.1所示,所述GFP的序列信息如SEQ ID NO.2所示,所述WPRE的序列信息如SEQ ID NO.3所示。
2.如权利要求1所述的293细胞系,其特征在于,将所述TCR的CD3ζ链,GFP和WPRE的DNA序列插入到293细胞的AAVS1位点。
3.如权利要求1或2所述的293细胞系,其特征在于,编码所述TCR的CD3ζ链的引物1,包括上游引物及下游引物,所述上游引物的序列信息如SEQ ID NO.4所示,所述下游引物的序列信息如SEQ ID NO.5所示。
4.如权利要求1或2所述的293细胞系,其特征在于,编码所述WPRE的DNA序列的引物2,包括上游引物及下游引物,所述上游引物的序列信息如SEQ ID NO.6所示,所述下游引物的序列信息如SEQ ID NO.7所示。
5.一种如权利要求1-4任一项所述的293细胞系的制备方法,其特征在于,包括如下步骤:
(1)利用如SEQ ID NO.4及SEQ ID NO.5所示的引物合成TCR的CD3ζ链,SEQ ID NO.6及SEQ ID NO.7所示的引物合成WPRE的DNA序列,得TCR的CD3ζ链及WPRE的DNA序列;
(2)利用spCas9-gRNA使293细胞的双链DNA在AAVS1位点断裂,将步骤S1所得TCR的CD3ζ链及WPRE的DNA序列、GFP序列插入到AAVS1位点,即得。
6.一种利用权利要求1-5任一项所述的293细胞系估算CAR-T病毒拷贝数的方法,其特征在于,操作步骤如下:
S1、将所述293细胞系导入CAR-T细胞中,得转染后的CAR-T细胞;
S2、利用PCR技术筛选转染成功的CAR-T细胞,得成功转染的CAR-T细胞;
S3、利用PCR技术及NGS技术相结合,鉴定具有单个插入的克隆。
7.如权利要求6所述的利用293细胞系估算CAR-T病毒拷贝数的方法,其特征在于,所述步骤S2中的PCR技术的具体操作为:配制10μL的PCR体系,引物1的上、下游引物各1μL,10×master mix 5μL,DNA 1μL,水2μL;PCR扩增程序为,95℃,预热5min;95℃,加热30s,58℃,退火30s,72℃,延伸1min,36个循环;72℃,延伸10min;引物2的PCR技术与引物1类似。
8.如权利要求6所述的利用293细胞系估算CAR-T病毒拷贝数的方法,其特征在于,所述步骤S3中的PCR技术与步骤S2类似,所述步骤S2中的NGS技术是将PCR产物进行测序,筛选具有单个克隆的CAR-T细胞。
9.一种如权利要求1-4任一项所述的293细胞系在滴定慢病毒、估算CAR-T细胞感染效率和计算CAR-T细胞中CAR-T基因插入拷贝数中的作用。
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