[发明专利]COVID-19感染的宿主标志物的应用

说明书

本发明涉及一种COVID‑19感染的宿主标志物的应用，属于基因检测技术领域。该宿主标志物可在制备COVID‑19感染检测试剂或检测设备中的应用，所述宿主标志物包括RNR1，MFSD11，SYNE3和SLC10A3基因中的至少一种。本发明通过对COVID‑19阳性肺炎组患者和COVID‑19阴性肺炎组患者基因表达的差异进行分析，得到上述具有差异表达的基因作为宿主标志物，可用于辅助COVID‑19感染诊断，在一定程度上可以弥补病毒核酸检验假阴性的缺陷，提高对COVID‑19的诊断能力。

技术领域

本发明涉及基因检测技术领域，特别是涉及一种COVID-19感染的宿主标志物的应用。

背景技术

COVID-19的传播方式是空气与接触传播，是易传播疾病，且COVID-19感染肺炎症状为发热、干咳、乏力等，与普通肺炎相似，临床医生较难鉴别，所以准确鉴定是否为COVID-19感染对临床诊断和治疗有重要的实际作用。

常规的COVID-19鉴定方式主要为RT-PCR等针对COVID-19病毒核酸检测，但由于实验技术和RNA病毒易变异的问题存在，核酸检测对COVID-19感染的鉴定存在一定的假阴性，导致部分患者无法迅速确诊。

发明内容

基于此，有必要针对上述问题，提供一种COVID-19感染的宿主标志物，通过观察这些宿主标志物差异化的表达，辅助诊断宿主是否存在COVID-19感染，提高对COVID-19的诊断能力。

一种宿主标志物在制备COVID-19感染检测试剂或检测设备中的应用，所述宿主标志物包括RNR1，MFSD11，SYNE3和SLC10A3基因中的至少一种。

本发明人在工作中发现，目前对COVID-19病毒的核酸检测，首先是经过前处理提取生物样本中的RNA进行核酸检测，而此时得到的RNA中，宿主RNA（人基因组）含量远远高于病原RNA，本发明通过对COVID-19阳性肺炎组患者和COVID-19阴性肺炎（即非COVID-19感染的其它肺炎）组患者基因表达的差异进行分析，得到上述具有差异表达的基因作为宿主标志物，可用于辅助COVID-19感染诊断，在一定程度上可以弥补病毒核酸检验假阴性的缺陷，提高对COVID-19的诊断能力，当COVID-19病毒核酸检测为阴性，而上述宿主标志物表达阳性（按照预设规则上调或下调），可提示进行复检等。

在其中一个实施例中，所述宿主标志物中，以基因表达上调为标志的基因为：RNR1；以基因表达下调为标志的基因为：MFSD11、SYNE3、SLC10A3。

在其中一个实施例中，对所述宿主标志物的应用为：检测生物样本中所述宿主标志物基因的表达量，与预定的各基因表达预设判定值进行对比，得出检测结果。

在其中一个实施例中，所述宿主标志物基因的表达量通过以下方法获得：以高通量测序获得人基因组测序数据，以外显子作为转录本最小区间，以比对到已知基因的序列数作为基因表达量。

在其中一个实施例中，所述基因表达预设判定值通过以下方法得到：分别获取COVID-19阳性肺炎组及COVID-19阴性肺炎组样本数据，根据两组样本数据进行差异化分析，以各基因表达量差异倍数绝对值为1.5倍以上为预设判定值。

在其中一个实施例中，所述差异化分析时，限定P-Value 0.05，且FDR0.1。

在其中一个实施例中，所述检测试剂用于痰液、鼻咽拭子、咽拭子、肺泡灌洗液样本的检测。

本发明还公开了一种COVID-19感染辅助检测试剂盒，包括检测以下至少一个基因表达量的试剂：MFSD11、RNR1、SYNE3、SLC10A3。

可以理解的，上述检测试剂盒可以针对基于芯片的检测方法设计，也可以针对基于测序的检测方法设计、或者基于PCR的检测方法设计均可，仅需能够检测出上述宿主标志物基因的表达量即可。