[发明专利]COVID-19感染的宿主标志物的应用有效
申请号: | 202010173346.7 | 申请日: | 2020-03-13 |
公开(公告)号: | CN111041089B | 公开(公告)日: | 2020-06-19 |
发明(设计)人: | 许腾;杨文娇;谢淑媚;何福生;杨敏玲;莫茜;李永军;王小锐;苏杭 | 申请(专利权)人: | 广州微远基因科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6883 | 分类号: | C12Q1/6883;C12N15/11 |
代理公司: | 广州新诺专利商标事务所有限公司 44100 | 代理人: | 李海恬 |
地址: | 510130 广东省广州市高新技术产业开发*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | covid 19 感染 宿主 标志 应用 | ||
1.一种检测宿主标志物表达量的试剂在制备COVID-19感染检测试剂或检测设备中的应用,其特征在于,所述宿主标志物包括RNR1,MFSD11,SYNE3和SLC10A3基因;
所述宿主标志物中,以基因表达上调为标志的基因为:RNR1;以基因表达下调为标志的基因为:MFSD11、SYNE3、SLC10A3。
2.根据权利要求1所述的应用,其特征在于,对所述宿主标志物的应用为:检测生物样本中所述宿主标志物基因的表达量,与预定的各基因表达预设判定值进行对比,得出检测结果。
3.根据权利要求2所述的应用,其特征在于,所述宿主标志物基因的表达量通过以下方法获得:以高通量测序获得人基因组测序数据,以外显子作为转录本最小区间,以比对到已知基因的序列数作为基因表达量。
4.根据权利要求2所述的应用,其特征在于,所述基因表达预设判定值通过以下方法得到:分别获取COVID-19阳性肺炎组及COVID-19阴性肺炎组样本数据,根据两组样本数据进行差异化分析,以各基因表达量差异倍数绝对值为1.5倍以上为预设判定值。
5.根据权利要求4所述的应用,其特征在于,所述差异化分析时,限定P-Value 0.05,且FDR0.1。
6.根据权利要求1所述的应用,其特征在于,所述检测试剂用于痰液、咽拭子、肺泡灌洗液样本的检测。
7.根据权利要求6所述的应用,其特征在于,所述咽拭子包括鼻咽拭子。
8.一种COVID-19感染辅助检测试剂盒,其特征在于,包括检测以下基因表达量的试剂:RNR1,MFSD11,SYNE3和SLC10A3。
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