[发明专利]ceRNA竞争模块识别方法、装置、电子设备及存储介质有效
申请号: | 202010158035.3 | 申请日: | 2020-03-09 |
公开(公告)号: | CN111383709B | 公开(公告)日: | 2021-06-08 |
发明(设计)人: | 张俊鹏;饶妮妮;王光斌 | 申请(专利权)人: | 电子科技大学;大理大学 |
主分类号: | G16B20/00 | 分类号: | G16B20/00;G06K9/62 |
代理公司: | 四川省成都市天策商标专利事务所 51213 | 代理人: | 龚海月 |
地址: | 610000 四川省成*** | 国省代码: | 四川;51 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | cerna 竞争 模块 识别 方法 装置 电子设备 存储 介质 | ||
1.一种ceRNA竞争模块识别方法,其特征在于,包括:
分别根据核糖核酸RNA1的表达矩阵和RNA2的表达矩阵获取所述RNA1基因模块和所述RNA2基因模块,其中,所述RNA1和所述RNA2为微小核糖核酸miRNA靶基因;
根据先验的miRNA-靶基因调控关系数据、miRNA表达矩阵、所述RNA1基因模块和所述RNA2基因模块,分别获取RNA1-RNA1模块的共享miRNAs显著性值、典型相关系数值、敏感典型相关系数值和RNA2-RNA2模块的共享miRNAs显著性值、典型相关系数值、敏感典型相关系数值,从这些值识别得到满足条件的内部ceRNA竞争模块;
根据先验的miRNA-靶基因调控关系数据、miRNA表达矩阵、所述RNA1基因模块和所述RNA2基因模块,分别获取RNA1-RNA2模块的共享miRNAs显著性值、典型相关系数值、敏感典型相关系数值,从这些值识别得到满足条件的外部ceRNA竞争模块。
2.如权利要求1所述的方法,其特征在于,从RNA1-RNA1模块和RNA2-RNA2模块的共享miRNAs显著性值、典型相关系数值、敏感典型相关系数值识别得到满足条件的内部ceRNA竞争模块,包括:
若所述RNA1-RNA1模块和所述RNA2-RNA2模块的所述共享miRNAs显著性值小于第一阈值,所述典型相关系数值大于第二阈值,所述敏感典型相关系数值大于第三阈值,则确认所述RNA1-RNA1模块和所述RNA2-RNA2模块分别为所述RNA1-RNA1内部竞争模块和所述RNA2-RNA2内部竞争模块。
3.如权利要求1所述的方法,其特征在于,从RNA1-RNA2模块的共享miRNAs显著性值、典型相关系数值、敏感典型相关系数值识别得到满足条件的外部ceRNA竞争模块,包括:
若所述RNA1-RNA2模块的所述共享miRNAs显著性值小于第一阈值,所述典型相关系数值大于第二阈值,所述敏感典型相关系数值大于第三阈值,则确认所述RNA1-RNA2模块为所述RNA1-RNA2外部竞争模块。
4.一种电子设备,其特征在于,包括处理器、存储介质和总线,所述存储介质存储有所述处理器可执行的机器可读指令,当所述电子设备运行时,所述处理器与所述存储介质之间通过所述总线通信,所述处理器执行所述机器可读指令,以执行权利要求1-3任一项所述方法的步骤。
5.一种计算机可读存储介质,所述计算机可读存储介质上存储有计算机程序,其特征在于,所述计算机程序被处理器运行时执行权利要求1-3任一项所述方法的步骤。
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