[发明专利]微生物的多关联网络计算方法、装置、设备及存储介质有效

专利信息
申请号: 202010149870.0 申请日: 2020-03-06
公开(公告)号: CN111477267B 公开(公告)日: 2022-05-03
发明(设计)人: 陈挺;王欣;杨煜清;朱丛敏 申请(专利权)人: 清华大学
主分类号: G16B5/00 分类号: G16B5/00;G16B30/10;G16B30/20;G16B40/00
代理公司: 北京华专卓海知识产权代理事务所(普通合伙) 11664 代理人: 彭锐
地址: 100084*** 国省代码: 北京;11
权利要求书: 查看更多 说明书: 查看更多
摘要:
搜索关键词: 微生物 关联 网络 计算方法 装置 设备 存储 介质
【权利要求书】:

1.一种微生物的多关联网络计算方法,其特征在于,所述方法包括:

获取测序样本数据集及环境因素集

初始化所述测序样本数据集和所述环境因素集的根节点node0,其中,|node0|=N;

根据所述测序样本数据集和所述环境因素集的根节点node0、二成分高斯混合模型递归划分所述测序样本数据集和所述环境因素集,并得到所述测序样本数据集和所述环境因素集的至少两个子节点,其中,一个节点nodek+1={Xk+1,Mk+1},另一个子节点nodek+2=nodek+2={Xk+2,Mk+2},且|nodek+1|=Nk+1,|nodek+2|=Nk+2,所述nodek+1和nodek+2构成一个样本簇;

确定节点nodek+1和节点nodek+2的B′、Θ′,所述B′表征第k+1个环境条件下的环境因素与微生物之间的关联网络,Θ′表征微生物之间的关联网络。

2.如权利要求1所述的方法,其特征在于,在所述获取测序样本数集之后,根据所述测序样本数据集和所述环境因素集的根节点node0、二成分高斯混合模型递归划分所述测序样本数据集和所述环境因素集,并得到所述测序样本数据集和所述环境因素集的至少两个子节点之后,所述方法还包括:

获取所述测序样本数据集和所述环境因素集的样本簇最小值Nmin;

所述根据所述测序样本数据集和所述环境因素集的根节点node0、二成分高斯混合模型递归划分所述测序样本数据集和所述环境因素集,并得到所述测序样本数据集和所述环境因素集的至少两个子节点,包括:

根据所述测序样本数据集和所述环境因素集的根节点node0、二成分高斯混合模型递归划分所述测序样本数据集和所述环境因素集,直至节点nodek+1的Nk+1和nodek+2的Nk+2大于所述样本簇最小值Nmin

3.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述根据所述测序样本数据集和所述环境因素集的根节点node0、二成分高斯混合模型递归划分所述测序样本数据集和所述环境因素集,并得到所述测序样本数据集和所述环境因素集的至少两个子节点,还包括:

当根据所述测序样本数据集和所述环境因素集至少两个样本簇时,保留所述至少两个样本簇中的环境因素均值向量位于节点nodek+1的Nk+1和nodek+2的环境均值向量之间的样本簇。

下载完整专利技术内容需要扣除积分,VIP会员可以免费下载。

该专利技术资料仅供研究查看技术是否侵权等信息,商用须获得专利权人授权。该专利全部权利属于清华大学,未经清华大学许可,擅自商用是侵权行为。如果您想购买此专利、获得商业授权和技术合作,请联系【客服

本文链接:http://www.vipzhuanli.com/pat/books/202010149870.0/1.html,转载请声明来源钻瓜专利网。

同类专利
专利分类
×

专利文献下载

说明:

1、专利原文基于中国国家知识产权局专利说明书;

2、支持发明专利 、实用新型专利、外观设计专利(升级中);

3、专利数据每周两次同步更新,支持Adobe PDF格式;

4、内容包括专利技术的结构示意图流程工艺图技术构造图

5、已全新升级为极速版,下载速度显著提升!欢迎使用!

请您登陆后,进行下载,点击【登陆】 【注册】

关于我们 寻求报道 投稿须知 广告合作 版权声明 网站地图 友情链接 企业标识 联系我们

钻瓜专利网在线咨询

周一至周五 9:00-18:00

咨询在线客服咨询在线客服
tel code back_top