[发明专利]用于检测西瓜白粉病抗性的SNP位点、KASP标记及其应用

说明书

本发明属于分子生物学领域，提供了一种用于检测西瓜白粉病抗性的SNP位点、KASP标记及其应用。本发明提供的用于检测西瓜白粉病抗性的SNP位点为西瓜基因组2号染色体上第29421971位核苷酸T→G；所述KASP标记具有序列表中序列1或序列2所示的核苷酸序列组成；用于检测西瓜白粉病抗性的KASP标记的引物序列组合包括序列表中的序列3、4和5；本发明还提供了含有上述引物序列组合的试剂盒，及上述引物组合和试剂盒的应用。本发明提供的SNP位点和KASP标记具有快速、直接、特异性高和高通量等特点，可在较短时间内完成大批量材料中抗白粉病基因的筛选和表型预测工作，可有效服务于西瓜白粉病抗病育种工作。

技术领域

本发明属于分子生物学领域，特别涉及一种用于检测西瓜白粉病抗性的 SNP位点、KASP标记及其应用。

背景技术

白粉病是危害葫芦科瓜类作物的重要病害之一，严重影响瓜类的产量和 品质。近年来，随着保护地栽培面积的不断扩大，西瓜白粉病发病有日益严 重的趋势，已经成为西瓜绿色无公害生产的重要障碍。因此，防控西瓜白粉 病对改善西瓜品质、提高西瓜产量具有重要意义。

利用西瓜白粉病抗病基因进行抗病品种的选育无疑是最为安全、经济的 白粉病防治措施。而进行西瓜白粉病表型鉴定时，易受温度、湿度等环境的 影响，给抗病性鉴定带来了很大的阻碍。近年来广泛应用的分子标记则不受 基因表达及环境的影响。因此，开发与西瓜白粉病抗性基因紧密连锁的分子 标记，以辅助西瓜白粉病抗性改良，可避免繁杂耗时的抗性筛选过程、缩短 育种年限，提高西瓜抗白粉病分子聚合育种的效率。

北京地区葫芦科作物白粉病菌Podosphaera xanthii(P.xanthii)的优势生理 小种是2France(2F)，开展P.xanthii 2F对应的抗病基因研究将是解决西瓜 白粉病问题的首要突破口。

发明内容

为了解决现有技术中存在的上述问题，本发明提供了一种用于检测西瓜 白粉病抗性的SNP位点、KASP标记及其应用，所述西瓜白粉病抗性基因为LOX基因。

抗白粉病西瓜品种Lvwangtuo经过发明人多年多点的抗病性鉴定，发现 其具有对P.xanthii 2F具有持久抗性。抗病性鉴定及遗传分析表明，Lvwangtuo 携带一个单显性抗病基因，对该基因进行精细定位和图位克隆获得了候选抗 病基因Lipoxygenase(LOX基因)。在此基础上开发与P.xanthii 2F的抗病基 因连锁的分子标记，满足分子标记辅助西瓜抗白粉病育种的要求，可大大缩 短育种的年限，提高育种效率。因此，在西瓜抗病育种领域的科研和实践中， 在上述发现LOX基因是Lvwangtuo的白粉病抗性的单显性抗病基因的基础 上，经过发明人大量的创造性劳动，开发出了一种基于LOX基因的、与西 瓜白粉病抗性基因连锁的SNP位点、KASP标记及其应用。

本发明的第一个方面提供了一种用于检测西瓜白粉病抗性的SNP位点， 所述SNP位点为西瓜基因组(http://cucurbitgenomics.org/,V1)2号染色体上 第29421971位核苷酸T→G。

本发明的第二个方面提供了一种用于检测西瓜白粉病抗性的KASP标 记，所述KASP标记具有序列表中序列1或序列2所示的核苷酸序列组成。

本发明的第三个方面提供了一种检测根据本发明的第二个方面提供的用 于检测西瓜白粉病抗性的KASP标记的引物序列组合，包括序列表中的序列 3、4和5：

序列3(上游引物：抗病位点结合引物)：

5’-ATCTGCAGGGAGTGCTTGTTCATT-3’；

序列4(上游引物：感病位点结合引物)：

5’-CTGCAGGGAGTGCTTGTTCATG-3’；

序列5(下游引物)：