[发明专利]用于检测西瓜白粉病抗性的SNP位点、KASP标记及其应用有效
申请号: | 202010076471.6 | 申请日: | 2020-01-23 |
公开(公告)号: | CN111334597B | 公开(公告)日: | 2022-07-19 |
发明(设计)人: | 许勇;李茂营;宫国义;张海英;郭绍贵;张洁;任毅 | 申请(专利权)人: | 北京市农林科学院 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12N15/11;A01H1/02 |
代理公司: | 北京五洲洋和知识产权代理事务所(普通合伙) 11387 | 代理人: | 荣红颖;简德明 |
地址: | 100097 北京市海*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 检测 西瓜 白粉病 抗性 snp kasp 标记 及其 应用 | ||
1.一种用于检测西瓜白粉病抗性的KASP引物组合,其特征在于,所述引物组合由两条上游引物和一条下游引物组成,其核苷酸序列分别如序列表中序列3-5所示;所述序列3的5’末端连接荧光基团HEX;所述序列4的5’末端连接荧光基团FAM。
2.一种用于检测西瓜白粉病抗性的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括权利要求1所述的用于检测西瓜白粉病抗性的KASP引物组合。
3.根据权利要求2所述的试剂盒,其特征在于,所述用于检测西瓜白粉病抗性的试剂盒还包括高保真Taq酶和dNTP。
4.权利要求1所述的用于检测西瓜白粉病抗性的KASP引物组合,或者权利要求2或3所述的用于检测西瓜白粉病抗性的试剂盒在如下任一种中的应用:
1)检测或者辅助检测西瓜白粉病抗性基因LOX基因的基因型;
2)培育具有西瓜白粉病抗性的新品种西瓜。
5.一种检测或者辅助检测西瓜白粉病抗性基因LOX基因的基因型的方法,其特征在于,包括如下步骤:
以待测西瓜的基因组DNA为模板,采用权利要求1所述的用于检测西瓜白粉病抗性的KASP引物组合,或者权利要求2或3所述的用于检测西瓜白粉病抗性的试剂盒进行PCR扩增,将所得扩增产物进行荧光信号扫描;
若荧光信号为深红色,则待测西瓜的LOX基因为纯合TT基因型;
若荧光信号为蓝色,则待测西瓜的LOX基因为纯合GG基因型;
若荧光信号为绿色,则待测西瓜的LOX基因为TG基因型。
6.一种培育具有西瓜白粉病抗性的新品种的方法,其特征在于,包括如下步骤:
以感白粉病、品质优良材料为受体亲本P1,与具有抗白粉病基因、品质一般的供体亲本P2配制F1代杂交组合;再以受体亲本P1作为轮回亲本进行回交,获得BC1F1代回交分离群体;
对所述BC1F1代回交分离群体,采用权利要求1所述的用于检测西瓜白粉病抗性的KASP标记的引物序列组合,或者权利要求2或3所述的用于检测西瓜白粉病抗性的试剂盒进行基因型检测,选取SNP分型为TG基因型的单株继续回交,获得BC2F1代回交分离群体;
对所述BC2F1代回交分离群体,采用权利要求1所述的用于检测西瓜白粉病抗性的KASP标记的引物序列组合,或者权利要求2或3所述的用于检测西瓜白粉病抗性的试剂盒进行基因型检测,选取SNP分型为TG基因型的单株,继续回交至BC4代,获得BC4F1代回交分离群体;
对BC4F1代回交分离群体进一步进行了自交,继续采用权利要求1所述的用于检测西瓜白粉病抗性的KASP标记的引物序列组合,或者权利要求2或3所述的用于检测西瓜白粉病抗性的试剂盒进行基因型检测,选取SNP分型为TT基因型的单株自交,获得纯合抗白粉病株系。
7.根据权利要求6所述的方法,其特征在于,所述受体亲本P1为感白粉病的小富母本,所述供体亲本P2为抗白粉病的Lvwangtuo。
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