[发明专利]一种检测甘蔗屈恩柄锈菌的单管巢式PCR引物对及检测方法有效

专利信息
申请号: 202010045649.0 申请日: 2020-01-16
公开(公告)号: CN111100943B 公开(公告)日: 2023-04-14
发明(设计)人: 吴伟怀;刘宝慧;贺春萍;易克贤;梁艳琼;习金根;郑金龙;李锐 申请(专利权)人: 中国热带农业科学院环境与植物保护研究所
主分类号: C12Q1/6895 分类号: C12Q1/6895;C12Q1/6848;C12Q1/04;C12R1/645
代理公司: 北京惟诚致远知识产权代理事务所(普通合伙) 11536 代理人: 王慧凤;李巍
地址: 571101 *** 国省代码: 海南;46
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摘要:
搜索关键词: 一种 检测 甘蔗 屈恩柄 锈菌 单管巢式 pcr 引物 方法
【权利要求书】:

1.一组检测甘蔗屈恩柄锈菌(Puccinia kuehnii)的单管巢式引物对,由序列表中序列1所示的核苷酸、序列表中序列2所示的核苷酸、序列表中序列3所示的核苷酸和序列表中序列4所示的核苷酸组成。

2.一种检测甘蔗屈恩柄锈菌(P. kuehnii)的试剂盒,包括权利要求1所述的单管巢式引物对。

3.根据权利要求2所述的试剂盒,其特征在于:所述试剂盒中还包括PCR反应试剂。

4.权利要求1所述的单管巢式引物对以及权利要求2或3所述的试剂盒在检测甘蔗屈恩柄锈菌(P. kuehnii)中的应用。

5.检测甘蔗屈恩柄锈菌(P. kuehnii)的方法,包括下述步骤:

1)提取待测样品DNA;

2)以待测样品DNA为模板,用权利要求1所述的单管巢式引物对进行PCR扩增;

3)通过肉眼直接观察凝胶电泳检测扩增产物,从而判定样品中是否含有甘蔗屈恩柄锈菌(P. kuehnii)。

6.根据权利要求5所述的方法,其特征在于:

 所述单管巢式PCR扩增的反应体系为20 μL,包括:dd H2O 13.3 μL,10× rTaq Buffer2 μL,2.5 mM/L d NTPs 1.6 μL,rTaq DNA Polymerase 0.1 μL,含浓度为0.1 pM序列表中序列1所示的核苷酸和浓度为0.1 pM的序列表中序列2所示的核苷酸的溶液1 μL,含浓度为10 μM序列表中序列3所示的核苷酸和浓度为10 µM的序列表中序列4所示的核苷酸的溶液1μL,待测样品DNA 1 μL;

反应程序为:94℃预变性3 min,94℃变性30 s,65℃退火10 s,72℃延伸25 s,20个循环,72℃延伸4 min;94℃预变性3 min,94℃变性30 s,53℃退火10 s,72℃延伸25 s,45个循环,72℃延伸4 min,12℃保存。

7.根据权利要求5所述的方法,其特征在于:通过将所测样品的单管巢式扩增反应产物进行琼脂糖电泳检测,并在凝胶成像仪下观察结果,如果观察到条带大小与目的条带一致,则所述待测样品含有甘蔗屈恩柄锈菌(P. kuehnii);反之,则待测样品不含有甘蔗屈恩柄锈菌(P. kuehnii)。

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