[发明专利]一种新型基因组编辑工具(Lb2Cas12a-RVR)及其构建方法和应用方法在审
申请号: | 202010042406.1 | 申请日: | 2020-01-15 |
公开(公告)号: | CN111647618A | 公开(公告)日: | 2020-09-11 |
发明(设计)人: | 谷峰;刘潇宇;林莉 | 申请(专利权)人: | 温州医科大学 |
主分类号: | C12N15/79 | 分类号: | C12N15/79;C12N15/66 |
代理公司: | 杭州斯可睿专利事务所有限公司 33241 | 代理人: | 孙晓林 |
地址: | 325000 *** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 新型 基因组 编辑 工具 lb2cas12a rvr 及其 构建 方法 应用 | ||
1.一种新型基因组编辑工具(Lb2Cas12a-RVR),其特征在于:包括编码表达Lb2Cas12a-RVR突变型蛋白编码质粒pcDNA3.1-hLb2Cas12a-RVR,编码蛋白的DNA序列如SEQ ID NO.1所示。
2.一种权利要求1所述的基因编辑工具(Lb2Cas12a-RVR)的构建方法,其特征在于:包括以下步骤:
步骤21:包括引物,所述引物上设置相应突变,所述引物序列如SEQ ID NO.7所示;
步骤22:从pY011(pcDNA3.1-hLb2Cpf1)载体上扩增片段1,序列如SEQ ID NO.2,扩增片段2,序列如SEQ ID NO.3;
步骤23:将扩增后的片段与骨架通过ClonExpressIIOne Step Cloning Kit得到突变后载体pcDNA3.1-hLb2Cas12a-RVR。
3.一种权利要求1所述的一种新型基因组编辑工具(Lb2Cas12a-RVR)的应用方法,其特征在于:包括以下步骤:
步骤33:包括构建针对某致病基因DNA靶点的crRNA,在真核细胞中共引入crRNA和Lb2Cas12a-RVR表达载体,使其在靶位点发生原位修复;
步骤34:构建评估Lb2Cas12a-RVR编辑活性、效率和保真性的GFP报告系统,其利用的GFP基因序列为SEQ ID NO.4;
步骤35:构建Lb2Cas12a-RVR基因修复模板RS1-GFP细胞系,其利用的RS1-GFP基因序列为SEQ ID NO.5;
步骤36:对于处理后的真核细胞基因组DNA进行抽提,然后利用针对靶点的特异性引物进行PCR扩增,利用基因组DNA的PCR产物构建高通量测序DNA文库,并进行高通量测序。
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