[发明专利]荧光发生核酸分子以及荧光标记靶RNA的方法在审

专利信息
申请号: 201980079072.0 申请日: 2019-12-03
公开(公告)号: CN113166758A 公开(公告)日: 2021-07-23
发明(设计)人: 冈田康志;有吉哲郎 申请(专利权)人: 国立研究开发法人科学技术振兴机构
主分类号: C12N15/11 分类号: C12N15/11;C12N15/115;C12N15/63;C12Q1/6806;C12Q1/6825;C12Q1/6876
代理公司: 北京英赛嘉华知识产权代理有限责任公司 11204 代理人: 王达佐;洪欣
地址: 日本*** 国省代码: 暂无信息
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摘要:
搜索关键词: 荧光 发生 核酸 分子 以及 标记 rna 方法
【权利要求书】:

1.一种荧光发生核酸分子,其特征在于,包含经由接头序列连接有2个以上的荧光分子结合区的碱基序列,

所述荧光分子结合区在支架序列中插入有1个以上的荧光分子结合适体序列。

2.如权利要求1所述的荧光发生核酸分子,其中,所述接头序列的长度为20个碱基以上。

3.如权利要求1或2所述的荧光发生核酸分子,其中,所述接头序列未形成特定的立体结构。

4.如权利要求1至3中任一项所述的荧光发生核酸分子,其中,所述荧光分子结合区在所述支架序列中插入有2个以上的所述荧光分子结合适体序列。

5.如权利要求4所述的荧光发生核酸分子,其中,所述荧光分子结合区通过形成含有2个以上的环结构的茎环结构的单链核酸分子中的至少2个所述环结构被取代为所述荧光分子结合适体序列的结构来构成。

6.如权利要求1至5中任一项所述的荧光发生核酸分子,其中,所述荧光分子结合适体序列含有:形成以G-quadruplex结构所夹持的茎环结构的单链核酸分子的碱基序列;

所述茎环结构通过4~6个碱基的茎结构和4个碱基的环结构来构成。

7.如权利要求1至6中任一项所述的荧光发生核酸分子,其中,所述荧光分子结合适体序列是Broccoli、Broccoli3或dBroccoli。

8.如权利要求1至5中任一项所述的荧光发生核酸分子,其中,所述荧光分子结合区通过序列号16或17所示的碱基序列来构成。

9.如权利要求1至8中任一项所述的荧光发生核酸分子,其中,所述接头序列通过序列号18~20中任意之一所示的碱基序列来构成。

10.如权利要求1至9中任一项所述的荧光发生核酸分子,其含有4个以上的所述荧光分子结合适体序列。

11.如权利要求1至10中任一项所述的荧光发生核酸分子,其中,所述荧光分子结合适体序列所结合的荧光分子是DFHBI家族的荧光分子。

12.一种荧光标记靶RNA的方法,其是对靶RNA进行荧光标记的方法;其中,使靶RNA直接或间接地连接权利要求1至11中任一项所述的荧光发生核酸分子之后,使其与所述荧光发生核酸分子中的所述荧光分子结合适体序列所结合的荧光分子接触。

13.如权利要求12所述的荧光标记靶RNA的方法,其中,所述靶RNA是靶基因的转录产物,

向在所述靶基因的3’非翻译区内整合有编码所述荧光发生核酸分子的碱基序列的细胞内,导入所述荧光发生核酸分子中的所述荧光分子结合适体序列所结合的荧光分子,并使所述靶基因的转录产物与所述荧光分子结合。

14.一种荧光标记靶RNA的方法,其是对靶RNA进行荧光标记的方法;其中,向含有靶RNA的试样中混合:

使与所述靶RNA的一部分杂交的探针直接或间接地连接于权利要求1至11中任一项所述的荧光发生核酸分子而成的核酸分子,以及

所述核酸分子中的所述荧光分子结合适体序列所结合的荧光分子。

15.一种载体,其具有:

控制外源基因的表达的启动子;

位于所述启动子的下游并且用于插入所述外源基因的编码区的限制性酶切位点;以及

位于所述限制性酶切位点的下游的3’非翻译区,

所述3’非翻译区包含编码权利要求1至11中任一项所述的荧光发生核酸分子的碱基序列。

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