[发明专利]代谢组与其他组学联合分析方法及装置有效
申请号: | 201911380147.7 | 申请日: | 2019-12-27 |
公开(公告)号: | CN111061818B | 公开(公告)日: | 2023-06-30 |
发明(设计)人: | 郑洪坤;秦刚;张蕾;梁若冰 | 申请(专利权)人: | 北京百迈客生物科技有限公司 |
主分类号: | G06F16/28 | 分类号: | G06F16/28;G16B40/00;G16B20/00 |
代理公司: | 北京路浩知识产权代理有限公司 11002 | 代理人: | 郑朝然 |
地址: | 101300 北京市顺义区南*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 代谢 其他 联合 分析 方法 装置 | ||
本发明实施例提供一种代谢组与其他组学联合分析方法及装置,方法包括:对代谢组的数据,以及除所述代谢组以外的一种或多种其他组学的数据进行多重协惯量分析,获取所述代谢组与所述其他组学之间数据的关联关系;将存在关联关系的代谢组的数据和其他组学的数据作为一个数据对,对每个所述数据对进行相关性分析,根据每个所述数据对的相关性分析结果对所述数据对进行筛选;对筛选出的每个所述数据对进行限制性对应分析,根据每个所述数据对的限制性对应分析结果,确定最终保留的数据对,根据最终保留的数据对最终确定所述代谢组与所述其他组学之间数据的关联关系。本发明实施例实现了代谢组与其他组学的联合分析,且分析结果更加精确。
技术领域
本发明属于生物信息分析技术领域,尤其涉及一种代谢组与其他组学联合分析方法及装置。
背景技术
代谢组学是随着质谱技术和信息技术不断发展而兴起的一门组学研究,以生物体内的全套代谢产物为研究对象。代谢组在疾病诊断与防治、新药筛选与开发和生态学研究中起着关键作用。
目前,转录组、蛋白组、代谢组、微生物组等各种组学的发展促进了对生物生理活动的理解,但是单一的组学研究难以阐释生物体复杂的生命活动。不同组学的研究展示了生物体在不同时空下的状态,要想获得生物整体的活动机理,就需要将各种组学进行整合。将多种组学进行联合分析,有利于系统地解释生物的内在机理,而如何将代谢组与其他组学数据进行有效整合并挖掘出关键的信息是亟待解决的问题。
现有的多组学联合分析方法大多以相关性分析为主,但相关性分析对组学数据之间关联关系的分析并不精确。
发明内容
为克服上述现有的多组学联合分析方法分析结果不精确的问题或者至少部分地解决上述问题,本发明实施例提供一种代谢组与其他组学联合分析方法及装置。
根据本发明实施例的第一方面,提供一种代谢组与其他组学联合分析方法,包括:
对代谢组的数据,以及除所述代谢组以外的一种或多种其他组学的数据进行多重协惯量分析,获取所述代谢组与所述其他组学之间数据的关联关系;
将存在关联关系的代谢组的数据和其他组学的数据作为一个数据对,对每个所述数据对进行相关性分析,根据每个所述数据对的相关性分析结果对所述数据对进行筛选;
对筛选出的每个所述数据对进行限制性对应分析,根据每个所述数据对的限制性对应分析结果,确定最终保留的数据对,根据最终保留的数据对最终确定所述代谢组与所述其他组学之间数据的关联关系。
具体地,对代谢组的数据,以及除所述代谢组以外的一种或多种其他组学的数据进行多重协惯量分析,获取所述代谢组与所述其他组学之间数据的关联关系的步骤包括:
基于omicade4软件将所述代谢组的数据和所述其他组学的数据投影到相同的维度空间;
根据所述维度空间中代谢组的任一数据的坐标和任一其他组学的任一数据的坐标与原点的连线之间的夹角,确定所述代谢组的任一数据和任一所述其他组学中的任一数据之间的关联性;
初步确定大于第一预设阈值的关联性对应的代谢组的数据和其他组学的数据之间存在关联关系。
具体地,对代谢组的数据,以及除所述代谢组以外的一种或多种其他组学的数据进行多重协惯量分析的步骤具体包括:
对所述代谢组的数据的表达量文件和所述其他组学的数据的表达量文件进行差异分析;
对所述代谢组的数据的差异分析结果和所述其他组学的数据的差异分析结果进行多重协惯量分析。
具体地,对每个所述数据对进行相关性分析,根据每个所述数据对的相关性分析结果对所述数据对进行筛选的步骤包括:
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