[发明专利]用于几种鲟鱼物种鉴定的SSR引物对组、试剂盒、鉴定方法及应用有效
申请号: | 201911165905.3 | 申请日: | 2019-11-25 |
公开(公告)号: | CN110951892B | 公开(公告)日: | 2023-05-26 |
发明(设计)人: | 张书环;杜浩;张辉;阮瑞;危起伟 | 申请(专利权)人: | 中国水产科学研究院长江水产研究所 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12N15/11 |
代理公司: | 深圳泛航知识产权代理事务所(普通合伙) 44867 | 代理人: | 邓爱军 |
地址: | 430070 湖北省武汉市*** | 国省代码: | 湖北;42 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 鲟鱼 物种 鉴定 ssr 引物 试剂盒 方法 应用 | ||
1.一种用于几种鲟鱼物种鉴定的SSR引物对组,其特征在于,包括正向引物P4-58F和反向引物P4-58R,其中正向引物P4-58F具有如SEQ ID NO.1所示核苷酸序列,反向引物P4-58R具有如SEQ ID NO.2所示核苷酸序列;
SEQ ID NO.1所示核苷酸序列为ACCCTGAAAAGAAAGGGGAA;
SEQ ID NO.2所示核苷酸序列为TATGGGCCAAAAGGAACAAG;
所述鲟鱼包括俄罗斯鲟、中华鲟、长江鲟、欧鳇和闪光鲟。
2.如权利要求1所述的SSR引物对组,其特征在于,所述正向引物P4-58F可用荧光染料进行标记。
3.一种用于几种鲟鱼物种鉴定的试剂盒,其特征在于,包括权利要求1所述的SSR引物对组,所述鲟鱼包括俄罗斯鲟、中华鲟、长江鲟、欧鳇和闪光鲟。
4.如权利要求3所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括:水、PCR缓冲液、dNTPs、DNA聚合酶、上样缓冲液中的一种或多种。
5.一种几种鲟鱼间的物种鉴定方法,其特征在于,包括如下步骤:
S1、提取待鉴定的俄罗斯鲟、中华鲟、长江鲟、欧鳇和闪光鲟的DNA样本;
S2、合成如权利要求1所述的SSR引物对组,且利用所述SSR引物对组、以步骤S1中获取的DNA样本为模板进行PCR扩增;
S3、对经步骤S2获得的PCR扩增产物进行检测,以获得PCR扩增产物多态性原始数据;
以及S4、对PCR扩增产物多态性原始数据进行分析,以得出测序峰图数据,并根据所述测序峰图数据对俄罗斯鲟、中华鲟、长江鲟、欧鳇和闪光鲟进行鉴定。
6.如权利要求5所述的鉴定方法,其特征在于,在进行PCR扩增时,所述正向引物P4-58F的退火温度为52~60℃;所述反向引物P4-58R的退火温度为50~59℃。
7.如权利要求6所述的鉴定方法,其特征在于,在进行PCR扩增时,所述正向引物P4-58F与反向引物P4-58R的退火温度均为52℃。
8.如权利要求1所述的SSR引物对组和/或如权利要求3所述的试剂盒和/或如权利要求5中所述的鉴定方法在俄罗斯鲟、中华鲟、长江鲟、欧鳇和闪光鲟的种间鉴定/种质鉴定/家系管理中应用。
9.一种分离的SSR标志物,其特征在于,其通过权利要求1所述的SSR引物对组、以俄罗斯鲟的DNA样本为模板进行扩增获得。
10.如权利要求9所述的SSR标记物,其特征在于,所述SSR标志物包括长度分别为124bp、134bp和145bp的3种特异性基因片段。
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